Protein–RNA interactions for Protein: B1AYM9

CK137956, cDNA sequence CK137956, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CK137956B1AYM9 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CK137956B1AYM9 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CK137956B1AYM9 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CK137956B1AYM9 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CK137956B1AYM9 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CK137956B1AYM9 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CK137956B1AYM9 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CK137956B1AYM9 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CK137956B1AYM9 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CK137956B1AYM9 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CK137956B1AYM9 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CK137956B1AYM9 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CK137956B1AYM9 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CK137956B1AYM9 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CK137956B1AYM9 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CK137956B1AYM9 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CK137956B1AYM9 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CK137956B1AYM9 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CK137956B1AYM9 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CK137956B1AYM9 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CK137956B1AYM9 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CK137956B1AYM9 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CK137956B1AYM9 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CK137956B1AYM9 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CK137956B1AYM9 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CK137956B1AYM9 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CK137956B1AYM9 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CK137956B1AYM9 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CK137956B1AYM9 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CK137956B1AYM9 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CK137956B1AYM9 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CK137956B1AYM9 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CK137956B1AYM9 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CK137956B1AYM9 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CK137956B1AYM9 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CK137956B1AYM9 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CK137956B1AYM9 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CK137956B1AYM9 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CK137956B1AYM9 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CK137956B1AYM9 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CK137956B1AYM9 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CK137956B1AYM9 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CK137956B1AYM9 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CK137956B1AYM9 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CK137956B1AYM9 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CK137956B1AYM9 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CK137956B1AYM9 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CK137956B1AYM9 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CK137956B1AYM9 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
CK137956B1AYM9 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CK137956B1AYM9 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CK137956B1AYM9 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CK137956B1AYM9 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CK137956B1AYM9 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CK137956B1AYM9 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CK137956B1AYM9 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CK137956B1AYM9 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CK137956B1AYM9 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CK137956B1AYM9 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CK137956B1AYM9 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CK137956B1AYM9 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CK137956B1AYM9 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CK137956B1AYM9 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CK137956B1AYM9 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CK137956B1AYM9 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CK137956B1AYM9 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CK137956B1AYM9 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CK137956B1AYM9 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CK137956B1AYM9 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CK137956B1AYM9 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CK137956B1AYM9 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CK137956B1AYM9 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CK137956B1AYM9 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CK137956B1AYM9 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CK137956B1AYM9 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CK137956B1AYM9 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CK137956B1AYM9 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CK137956B1AYM9 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CK137956B1AYM9 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CK137956B1AYM9 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CK137956B1AYM9 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CK137956B1AYM9 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CK137956B1AYM9 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CK137956B1AYM9 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CK137956B1AYM9 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CK137956B1AYM9 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CK137956B1AYM9 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CK137956B1AYM9 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CK137956B1AYM9 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CK137956B1AYM9 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CK137956B1AYM9 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CK137956B1AYM9 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CK137956B1AYM9 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CK137956B1AYM9 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CK137956B1AYM9 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CK137956B1AYM9 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CK137956B1AYM9 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CK137956B1AYM9 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CK137956B1AYM9 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CK137956B1AYM9 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms