Protein–RNA interactions for Protein: B1AYL1

Scn7a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn7aB1AYL1 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Scn7aB1AYL1 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Scn7aB1AYL1 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Scn7aB1AYL1 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Scn7aB1AYL1 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Scn7aB1AYL1 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Scn7aB1AYL1 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Scn7aB1AYL1 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Scn7aB1AYL1 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Scn7aB1AYL1 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Scn7aB1AYL1 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Scn7aB1AYL1 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Scn7aB1AYL1 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Scn7aB1AYL1 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Scn7aB1AYL1 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Scn7aB1AYL1 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Scn7aB1AYL1 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Scn7aB1AYL1 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Scn7aB1AYL1 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Scn7aB1AYL1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Scn7aB1AYL1 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Scn7aB1AYL1 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Scn7aB1AYL1 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Scn7aB1AYL1 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Scn7aB1AYL1 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Scn7aB1AYL1 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Scn7aB1AYL1 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Scn7aB1AYL1 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Scn7aB1AYL1 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Scn7aB1AYL1 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Scn7aB1AYL1 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Scn7aB1AYL1 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Scn7aB1AYL1 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Scn7aB1AYL1 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Scn7aB1AYL1 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Scn7aB1AYL1 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Scn7aB1AYL1 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Scn7aB1AYL1 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Scn7aB1AYL1 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Scn7aB1AYL1 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Scn7aB1AYL1 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Scn7aB1AYL1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Scn7aB1AYL1 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Scn7aB1AYL1 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Scn7aB1AYL1 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Scn7aB1AYL1 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Scn7aB1AYL1 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Scn7aB1AYL1 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Scn7aB1AYL1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Scn7aB1AYL1 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Scn7aB1AYL1 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Scn7aB1AYL1 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Scn7aB1AYL1 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Scn7aB1AYL1 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Scn7aB1AYL1 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Scn7aB1AYL1 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Scn7aB1AYL1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Scn7aB1AYL1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Scn7aB1AYL1 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Scn7aB1AYL1 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Scn7aB1AYL1 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Scn7aB1AYL1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Scn7aB1AYL1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Scn7aB1AYL1 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Scn7aB1AYL1 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Scn7aB1AYL1 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Scn7aB1AYL1 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Scn7aB1AYL1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Scn7aB1AYL1 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Scn7aB1AYL1 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Scn7aB1AYL1 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Scn7aB1AYL1 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Scn7aB1AYL1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Scn7aB1AYL1 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Scn7aB1AYL1 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Scn7aB1AYL1 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Scn7aB1AYL1 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Scn7aB1AYL1 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Scn7aB1AYL1 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Scn7aB1AYL1 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Scn7aB1AYL1 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Scn7aB1AYL1 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Scn7aB1AYL1 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Scn7aB1AYL1 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Scn7aB1AYL1 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Scn7aB1AYL1 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Scn7aB1AYL1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Scn7aB1AYL1 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Scn7aB1AYL1 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Scn7aB1AYL1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Scn7aB1AYL1 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Scn7aB1AYL1 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Scn7aB1AYL1 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Scn7aB1AYL1 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Scn7aB1AYL1 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Scn7aB1AYL1 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Scn7aB1AYL1 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Scn7aB1AYL1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Scn7aB1AYL1 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Scn7aB1AYL1 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms