Protein–RNA interactions for Protein: B1AY10

Nfx1, Transcriptional repressor NF-X1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfx1B1AY10 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nfx1B1AY10 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nfx1B1AY10 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nfx1B1AY10 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nfx1B1AY10 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nfx1B1AY10 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nfx1B1AY10 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nfx1B1AY10 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nfx1B1AY10 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nfx1B1AY10 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nfx1B1AY10 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nfx1B1AY10 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nfx1B1AY10 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nfx1B1AY10 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nfx1B1AY10 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nfx1B1AY10 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nfx1B1AY10 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nfx1B1AY10 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nfx1B1AY10 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nfx1B1AY10 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nfx1B1AY10 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nfx1B1AY10 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nfx1B1AY10 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nfx1B1AY10 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nfx1B1AY10 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nfx1B1AY10 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nfx1B1AY10 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nfx1B1AY10 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nfx1B1AY10 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nfx1B1AY10 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nfx1B1AY10 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nfx1B1AY10 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nfx1B1AY10 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nfx1B1AY10 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nfx1B1AY10 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nfx1B1AY10 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nfx1B1AY10 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nfx1B1AY10 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nfx1B1AY10 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nfx1B1AY10 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nfx1B1AY10 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nfx1B1AY10 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nfx1B1AY10 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nfx1B1AY10 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nfx1B1AY10 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nfx1B1AY10 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nfx1B1AY10 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nfx1B1AY10 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nfx1B1AY10 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nfx1B1AY10 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nfx1B1AY10 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nfx1B1AY10 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nfx1B1AY10 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nfx1B1AY10 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Nfx1B1AY10 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Nfx1B1AY10 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nfx1B1AY10 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nfx1B1AY10 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nfx1B1AY10 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nfx1B1AY10 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nfx1B1AY10 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Nfx1B1AY10 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nfx1B1AY10 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nfx1B1AY10 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Nfx1B1AY10 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nfx1B1AY10 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nfx1B1AY10 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nfx1B1AY10 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nfx1B1AY10 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nfx1B1AY10 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nfx1B1AY10 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nfx1B1AY10 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nfx1B1AY10 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nfx1B1AY10 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nfx1B1AY10 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Nfx1B1AY10 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nfx1B1AY10 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nfx1B1AY10 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nfx1B1AY10 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nfx1B1AY10 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nfx1B1AY10 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nfx1B1AY10 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nfx1B1AY10 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nfx1B1AY10 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nfx1B1AY10 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nfx1B1AY10 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nfx1B1AY10 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nfx1B1AY10 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nfx1B1AY10 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nfx1B1AY10 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nfx1B1AY10 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nfx1B1AY10 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nfx1B1AY10 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nfx1B1AY10 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nfx1B1AY10 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nfx1B1AY10 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nfx1B1AY10 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nfx1B1AY10 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nfx1B1AY10 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nfx1B1AY10 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms