Protein–RNA interactions for Protein: B1AUC4

Ube2u, Ubiquitin-conjugating enzyme E2U (putative), mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2uB1AUC4 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ube2uB1AUC4 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ube2uB1AUC4 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Ube2uB1AUC4 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ube2uB1AUC4 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ube2uB1AUC4 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ube2uB1AUC4 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ube2uB1AUC4 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ube2uB1AUC4 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ube2uB1AUC4 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ube2uB1AUC4 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ube2uB1AUC4 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ube2uB1AUC4 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ube2uB1AUC4 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ube2uB1AUC4 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ube2uB1AUC4 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Ube2uB1AUC4 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ube2uB1AUC4 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ube2uB1AUC4 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ube2uB1AUC4 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ube2uB1AUC4 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ube2uB1AUC4 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ube2uB1AUC4 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ube2uB1AUC4 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Ube2uB1AUC4 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Ube2uB1AUC4 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ube2uB1AUC4 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ube2uB1AUC4 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ube2uB1AUC4 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ube2uB1AUC4 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ube2uB1AUC4 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ube2uB1AUC4 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ube2uB1AUC4 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ube2uB1AUC4 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ube2uB1AUC4 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ube2uB1AUC4 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ube2uB1AUC4 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ube2uB1AUC4 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ube2uB1AUC4 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ube2uB1AUC4 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ube2uB1AUC4 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ube2uB1AUC4 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ube2uB1AUC4 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ube2uB1AUC4 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ube2uB1AUC4 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ube2uB1AUC4 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ube2uB1AUC4 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ube2uB1AUC4 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ube2uB1AUC4 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ube2uB1AUC4 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ube2uB1AUC4 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ube2uB1AUC4 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ube2uB1AUC4 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ube2uB1AUC4 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ube2uB1AUC4 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ube2uB1AUC4 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ube2uB1AUC4 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ube2uB1AUC4 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ube2uB1AUC4 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ube2uB1AUC4 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ube2uB1AUC4 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ube2uB1AUC4 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ube2uB1AUC4 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ube2uB1AUC4 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ube2uB1AUC4 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ube2uB1AUC4 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ube2uB1AUC4 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Ube2uB1AUC4 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ube2uB1AUC4 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ube2uB1AUC4 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ube2uB1AUC4 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Ube2uB1AUC4 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ube2uB1AUC4 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ube2uB1AUC4 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ube2uB1AUC4 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ube2uB1AUC4 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ube2uB1AUC4 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ube2uB1AUC4 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ube2uB1AUC4 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ube2uB1AUC4 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ube2uB1AUC4 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ube2uB1AUC4 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ube2uB1AUC4 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ube2uB1AUC4 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ube2uB1AUC4 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ube2uB1AUC4 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ube2uB1AUC4 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ube2uB1AUC4 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ube2uB1AUC4 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ube2uB1AUC4 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ube2uB1AUC4 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ube2uB1AUC4 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ube2uB1AUC4 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ube2uB1AUC4 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ube2uB1AUC4 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ube2uB1AUC4 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ube2uB1AUC4 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Ube2uB1AUC4 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ube2uB1AUC4 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ube2uB1AUC4 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms