Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Grik3B1AS29 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Grik3B1AS29 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Grik3B1AS29 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Grik3B1AS29 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Grik3B1AS29 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Grik3B1AS29 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Grik3B1AS29 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Grik3B1AS29 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Grik3B1AS29 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Grik3B1AS29 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Grik3B1AS29 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Grik3B1AS29 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Grik3B1AS29 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Grik3B1AS29 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Grik3B1AS29 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Grik3B1AS29 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Grik3B1AS29 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Grik3B1AS29 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Grik3B1AS29 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Grik3B1AS29 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Grik3B1AS29 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Grik3B1AS29 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Grik3B1AS29 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Grik3B1AS29 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Grik3B1AS29 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Grik3B1AS29 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Grik3B1AS29 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Grik3B1AS29 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Grik3B1AS29 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Grik3B1AS29 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Grik3B1AS29 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Grik3B1AS29 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Grik3B1AS29 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Grik3B1AS29 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Grik3B1AS29 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Grik3B1AS29 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Grik3B1AS29 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Grik3B1AS29 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Grik3B1AS29 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Grik3B1AS29 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Grik3B1AS29 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Grik3B1AS29 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Grik3B1AS29 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Grik3B1AS29 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Grik3B1AS29 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Grik3B1AS29 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Grik3B1AS29 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Grik3B1AS29 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Grik3B1AS29 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Grik3B1AS29 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Grik3B1AS29 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Grik3B1AS29 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Grik3B1AS29 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Grik3B1AS29 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Grik3B1AS29 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Grik3B1AS29 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Grik3B1AS29 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Grik3B1AS29 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Grik3B1AS29 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Grik3B1AS29 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Grik3B1AS29 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Grik3B1AS29 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Grik3B1AS29 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Grik3B1AS29 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Grik3B1AS29 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Grik3B1AS29 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Grik3B1AS29 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Grik3B1AS29 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Grik3B1AS29 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Grik3B1AS29 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Grik3B1AS29 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Grik3B1AS29 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Grik3B1AS29 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Grik3B1AS29 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Grik3B1AS29 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Grik3B1AS29 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Grik3B1AS29 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Grik3B1AS29 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Grik3B1AS29 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Grik3B1AS29 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Grik3B1AS29 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Grik3B1AS29 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Grik3B1AS29 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Grik3B1AS29 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Grik3B1AS29 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Grik3B1AS29 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Grik3B1AS29 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Grik3B1AS29 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Grik3B1AS29 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Grik3B1AS29 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Grik3B1AS29 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Grik3B1AS29 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Grik3B1AS29 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Grik3B1AS29 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Grik3B1AS29 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Grik3B1AS29 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Grik3B1AS29 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Grik3B1AS29 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Grik3B1AS29 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms