Protein–RNA interactions for Protein: B1APN4

Rhox1, Reproductive homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox1B1APN4 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rhox1B1APN4 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rhox1B1APN4 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rhox1B1APN4 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rhox1B1APN4 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rhox1B1APN4 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rhox1B1APN4 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rhox1B1APN4 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rhox1B1APN4 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rhox1B1APN4 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rhox1B1APN4 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rhox1B1APN4 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rhox1B1APN4 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rhox1B1APN4 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rhox1B1APN4 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rhox1B1APN4 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Rhox1B1APN4 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rhox1B1APN4 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rhox1B1APN4 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rhox1B1APN4 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rhox1B1APN4 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rhox1B1APN4 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rhox1B1APN4 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rhox1B1APN4 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rhox1B1APN4 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Rhox1B1APN4 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rhox1B1APN4 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rhox1B1APN4 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rhox1B1APN4 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rhox1B1APN4 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rhox1B1APN4 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rhox1B1APN4 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rhox1B1APN4 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rhox1B1APN4 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rhox1B1APN4 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rhox1B1APN4 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rhox1B1APN4 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rhox1B1APN4 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rhox1B1APN4 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rhox1B1APN4 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rhox1B1APN4 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rhox1B1APN4 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rhox1B1APN4 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rhox1B1APN4 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rhox1B1APN4 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rhox1B1APN4 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rhox1B1APN4 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rhox1B1APN4 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rhox1B1APN4 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rhox1B1APN4 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rhox1B1APN4 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rhox1B1APN4 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rhox1B1APN4 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rhox1B1APN4 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rhox1B1APN4 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rhox1B1APN4 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rhox1B1APN4 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rhox1B1APN4 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rhox1B1APN4 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rhox1B1APN4 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rhox1B1APN4 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rhox1B1APN4 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rhox1B1APN4 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rhox1B1APN4 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rhox1B1APN4 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rhox1B1APN4 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rhox1B1APN4 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rhox1B1APN4 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rhox1B1APN4 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rhox1B1APN4 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rhox1B1APN4 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rhox1B1APN4 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rhox1B1APN4 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rhox1B1APN4 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rhox1B1APN4 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rhox1B1APN4 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rhox1B1APN4 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rhox1B1APN4 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rhox1B1APN4 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rhox1B1APN4 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rhox1B1APN4 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rhox1B1APN4 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rhox1B1APN4 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rhox1B1APN4 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rhox1B1APN4 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rhox1B1APN4 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rhox1B1APN4 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rhox1B1APN4 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rhox1B1APN4 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rhox1B1APN4 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rhox1B1APN4 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rhox1B1APN4 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rhox1B1APN4 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rhox1B1APN4 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rhox1B1APN4 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rhox1B1APN4 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rhox1B1APN4 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rhox1B1APN4 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rhox1B1APN4 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rhox1B1APN4 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms