Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atp8b5A3FIN4 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atp8b5A3FIN4 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atp8b5A3FIN4 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atp8b5A3FIN4 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atp8b5A3FIN4 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atp8b5A3FIN4 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atp8b5A3FIN4 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atp8b5A3FIN4 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atp8b5A3FIN4 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atp8b5A3FIN4 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atp8b5A3FIN4 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atp8b5A3FIN4 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atp8b5A3FIN4 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atp8b5A3FIN4 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atp8b5A3FIN4 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atp8b5A3FIN4 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atp8b5A3FIN4 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Atp8b5A3FIN4 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atp8b5A3FIN4 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atp8b5A3FIN4 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Atp8b5A3FIN4 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atp8b5A3FIN4 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atp8b5A3FIN4 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atp8b5A3FIN4 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atp8b5A3FIN4 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Atp8b5A3FIN4 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atp8b5A3FIN4 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atp8b5A3FIN4 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atp8b5A3FIN4 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atp8b5A3FIN4 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atp8b5A3FIN4 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atp8b5A3FIN4 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atp8b5A3FIN4 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atp8b5A3FIN4 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atp8b5A3FIN4 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atp8b5A3FIN4 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atp8b5A3FIN4 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atp8b5A3FIN4 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atp8b5A3FIN4 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atp8b5A3FIN4 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atp8b5A3FIN4 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atp8b5A3FIN4 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atp8b5A3FIN4 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atp8b5A3FIN4 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atp8b5A3FIN4 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atp8b5A3FIN4 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atp8b5A3FIN4 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atp8b5A3FIN4 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atp8b5A3FIN4 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atp8b5A3FIN4 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atp8b5A3FIN4 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atp8b5A3FIN4 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atp8b5A3FIN4 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atp8b5A3FIN4 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atp8b5A3FIN4 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atp8b5A3FIN4 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atp8b5A3FIN4 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atp8b5A3FIN4 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atp8b5A3FIN4 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atp8b5A3FIN4 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atp8b5A3FIN4 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atp8b5A3FIN4 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atp8b5A3FIN4 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp8b5A3FIN4 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp8b5A3FIN4 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp8b5A3FIN4 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp8b5A3FIN4 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp8b5A3FIN4 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp8b5A3FIN4 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp8b5A3FIN4 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp8b5A3FIN4 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp8b5A3FIN4 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp8b5A3FIN4 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp8b5A3FIN4 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp8b5A3FIN4 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp8b5A3FIN4 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp8b5A3FIN4 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp8b5A3FIN4 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp8b5A3FIN4 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp8b5A3FIN4 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp8b5A3FIN4 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp8b5A3FIN4 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp8b5A3FIN4 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp8b5A3FIN4 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp8b5A3FIN4 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp8b5A3FIN4 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp8b5A3FIN4 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp8b5A3FIN4 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp8b5A3FIN4 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp8b5A3FIN4 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp8b5A3FIN4 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp8b5A3FIN4 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp8b5A3FIN4 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp8b5A3FIN4 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp8b5A3FIN4 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp8b5A3FIN4 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp8b5A3FIN4 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp8b5A3FIN4 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp8b5A3FIN4 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
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