Protein–RNA interactions for Protein: A2RSL7

4931406B18Rik, RIKEN cDNA 4931406B18 gene, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931406B18RikA2RSL7 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
4931406B18RikA2RSL7 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4931406B18RikA2RSL7 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4931406B18RikA2RSL7 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4931406B18RikA2RSL7 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4931406B18RikA2RSL7 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4931406B18RikA2RSL7 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4931406B18RikA2RSL7 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4931406B18RikA2RSL7 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4931406B18RikA2RSL7 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
4931406B18RikA2RSL7 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4931406B18RikA2RSL7 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
4931406B18RikA2RSL7 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4931406B18RikA2RSL7 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
4931406B18RikA2RSL7 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4931406B18RikA2RSL7 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
4931406B18RikA2RSL7 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
4931406B18RikA2RSL7 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
4931406B18RikA2RSL7 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
4931406B18RikA2RSL7 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4931406B18RikA2RSL7 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4931406B18RikA2RSL7 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4931406B18RikA2RSL7 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
4931406B18RikA2RSL7 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4931406B18RikA2RSL7 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4931406B18RikA2RSL7 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4931406B18RikA2RSL7 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
4931406B18RikA2RSL7 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4931406B18RikA2RSL7 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4931406B18RikA2RSL7 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
4931406B18RikA2RSL7 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
4931406B18RikA2RSL7 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4931406B18RikA2RSL7 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4931406B18RikA2RSL7 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4931406B18RikA2RSL7 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4931406B18RikA2RSL7 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4931406B18RikA2RSL7 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4931406B18RikA2RSL7 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
4931406B18RikA2RSL7 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4931406B18RikA2RSL7 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4931406B18RikA2RSL7 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4931406B18RikA2RSL7 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4931406B18RikA2RSL7 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
4931406B18RikA2RSL7 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
4931406B18RikA2RSL7 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4931406B18RikA2RSL7 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
4931406B18RikA2RSL7 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4931406B18RikA2RSL7 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
4931406B18RikA2RSL7 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4931406B18RikA2RSL7 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4931406B18RikA2RSL7 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4931406B18RikA2RSL7 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
4931406B18RikA2RSL7 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4931406B18RikA2RSL7 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
4931406B18RikA2RSL7 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
4931406B18RikA2RSL7 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4931406B18RikA2RSL7 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4931406B18RikA2RSL7 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
4931406B18RikA2RSL7 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4931406B18RikA2RSL7 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
4931406B18RikA2RSL7 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
4931406B18RikA2RSL7 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
4931406B18RikA2RSL7 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4931406B18RikA2RSL7 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4931406B18RikA2RSL7 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4931406B18RikA2RSL7 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4931406B18RikA2RSL7 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4931406B18RikA2RSL7 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4931406B18RikA2RSL7 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
4931406B18RikA2RSL7 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4931406B18RikA2RSL7 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
4931406B18RikA2RSL7 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4931406B18RikA2RSL7 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4931406B18RikA2RSL7 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4931406B18RikA2RSL7 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4931406B18RikA2RSL7 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
4931406B18RikA2RSL7 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
4931406B18RikA2RSL7 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4931406B18RikA2RSL7 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
4931406B18RikA2RSL7 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4931406B18RikA2RSL7 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
4931406B18RikA2RSL7 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4931406B18RikA2RSL7 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
4931406B18RikA2RSL7 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4931406B18RikA2RSL7 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
4931406B18RikA2RSL7 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
4931406B18RikA2RSL7 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4931406B18RikA2RSL7 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4931406B18RikA2RSL7 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
4931406B18RikA2RSL7 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4931406B18RikA2RSL7 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4931406B18RikA2RSL7 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4931406B18RikA2RSL7 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4931406B18RikA2RSL7 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4931406B18RikA2RSL7 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4931406B18RikA2RSL7 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4931406B18RikA2RSL7 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4931406B18RikA2RSL7 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
4931406B18RikA2RSL7 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4931406B18RikA2RSL7 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms