Protein–RNA interactions for Protein: A2CFD5

Btbd35f28, BTB domain-containing 35, family member 28, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Btbd35f28A2CFD5 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Btbd35f28A2CFD5 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Btbd35f28A2CFD5 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Btbd35f28A2CFD5 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Btbd35f28A2CFD5 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Btbd35f28A2CFD5 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Btbd35f28A2CFD5 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Btbd35f28A2CFD5 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Btbd35f28A2CFD5 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Btbd35f28A2CFD5 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Btbd35f28A2CFD5 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Btbd35f28A2CFD5 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Btbd35f28A2CFD5 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Btbd35f28A2CFD5 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Btbd35f28A2CFD5 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Btbd35f28A2CFD5 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Btbd35f28A2CFD5 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Btbd35f28A2CFD5 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Btbd35f28A2CFD5 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Btbd35f28A2CFD5 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Btbd35f28A2CFD5 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Btbd35f28A2CFD5 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Btbd35f28A2CFD5 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Btbd35f28A2CFD5 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Btbd35f28A2CFD5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Btbd35f28A2CFD5 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Btbd35f28A2CFD5 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Btbd35f28A2CFD5 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Btbd35f28A2CFD5 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Btbd35f28A2CFD5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Btbd35f28A2CFD5 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Btbd35f28A2CFD5 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Btbd35f28A2CFD5 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Btbd35f28A2CFD5 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Btbd35f28A2CFD5 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Btbd35f28A2CFD5 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Btbd35f28A2CFD5 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Btbd35f28A2CFD5 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Btbd35f28A2CFD5 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Btbd35f28A2CFD5 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Btbd35f28A2CFD5 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Btbd35f28A2CFD5 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Btbd35f28A2CFD5 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Btbd35f28A2CFD5 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Btbd35f28A2CFD5 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Btbd35f28A2CFD5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Btbd35f28A2CFD5 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Btbd35f28A2CFD5 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Btbd35f28A2CFD5 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Btbd35f28A2CFD5 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Btbd35f28A2CFD5 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Btbd35f28A2CFD5 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Btbd35f28A2CFD5 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Btbd35f28A2CFD5 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Btbd35f28A2CFD5 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Btbd35f28A2CFD5 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Btbd35f28A2CFD5 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Btbd35f28A2CFD5 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Btbd35f28A2CFD5 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Btbd35f28A2CFD5 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Btbd35f28A2CFD5 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Btbd35f28A2CFD5 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Btbd35f28A2CFD5 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Btbd35f28A2CFD5 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Btbd35f28A2CFD5 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Btbd35f28A2CFD5 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Btbd35f28A2CFD5 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Btbd35f28A2CFD5 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Btbd35f28A2CFD5 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Btbd35f28A2CFD5 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Btbd35f28A2CFD5 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Btbd35f28A2CFD5 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Btbd35f28A2CFD5 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Btbd35f28A2CFD5 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Btbd35f28A2CFD5 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Btbd35f28A2CFD5 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Btbd35f28A2CFD5 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Btbd35f28A2CFD5 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Btbd35f28A2CFD5 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Btbd35f28A2CFD5 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Btbd35f28A2CFD5 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Btbd35f28A2CFD5 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Btbd35f28A2CFD5 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Btbd35f28A2CFD5 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Btbd35f28A2CFD5 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Btbd35f28A2CFD5 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Btbd35f28A2CFD5 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Btbd35f28A2CFD5 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Btbd35f28A2CFD5 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Btbd35f28A2CFD5 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Btbd35f28A2CFD5 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Btbd35f28A2CFD5 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Btbd35f28A2CFD5 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Btbd35f28A2CFD5 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Btbd35f28A2CFD5 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Btbd35f28A2CFD5 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Btbd35f28A2CFD5 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Btbd35f28A2CFD5 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Btbd35f28A2CFD5 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Btbd35f28A2CFD5 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms