Protein–RNA interactions for Protein: A2APC3

Ttll9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll9A2APC3 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttll9A2APC3 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttll9A2APC3 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttll9A2APC3 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ttll9A2APC3 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ttll9A2APC3 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ttll9A2APC3 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ttll9A2APC3 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ttll9A2APC3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ttll9A2APC3 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ttll9A2APC3 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ttll9A2APC3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ttll9A2APC3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ttll9A2APC3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttll9A2APC3 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttll9A2APC3 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttll9A2APC3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttll9A2APC3 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttll9A2APC3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttll9A2APC3 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttll9A2APC3 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttll9A2APC3 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttll9A2APC3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttll9A2APC3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttll9A2APC3 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttll9A2APC3 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttll9A2APC3 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttll9A2APC3 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ttll9A2APC3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttll9A2APC3 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttll9A2APC3 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttll9A2APC3 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttll9A2APC3 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttll9A2APC3 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttll9A2APC3 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttll9A2APC3 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttll9A2APC3 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttll9A2APC3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttll9A2APC3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttll9A2APC3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttll9A2APC3 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttll9A2APC3 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttll9A2APC3 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttll9A2APC3 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ttll9A2APC3 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ttll9A2APC3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ttll9A2APC3 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ttll9A2APC3 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ttll9A2APC3 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ttll9A2APC3 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ttll9A2APC3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ttll9A2APC3 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ttll9A2APC3 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ttll9A2APC3 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ttll9A2APC3 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ttll9A2APC3 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ttll9A2APC3 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ttll9A2APC3 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ttll9A2APC3 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ttll9A2APC3 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ttll9A2APC3 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ttll9A2APC3 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ttll9A2APC3 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ttll9A2APC3 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ttll9A2APC3 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ttll9A2APC3 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ttll9A2APC3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ttll9A2APC3 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ttll9A2APC3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ttll9A2APC3 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ttll9A2APC3 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ttll9A2APC3 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ttll9A2APC3 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ttll9A2APC3 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ttll9A2APC3 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ttll9A2APC3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ttll9A2APC3 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ttll9A2APC3 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ttll9A2APC3 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ttll9A2APC3 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ttll9A2APC3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ttll9A2APC3 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ttll9A2APC3 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ttll9A2APC3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ttll9A2APC3 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ttll9A2APC3 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ttll9A2APC3 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ttll9A2APC3 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ttll9A2APC3 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ttll9A2APC3 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ttll9A2APC3 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ttll9A2APC3 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ttll9A2APC3 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ttll9A2APC3 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ttll9A2APC3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ttll9A2APC3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ttll9A2APC3 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ttll9A2APC3 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ttll9A2APC3 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ttll9A2APC3 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms