Protein–RNA interactions for Protein: A2ALU4

Shroom2, Protein Shroom2, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shroom2A2ALU4 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Shroom2A2ALU4 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Shroom2A2ALU4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Shroom2A2ALU4 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Shroom2A2ALU4 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Shroom2A2ALU4 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Shroom2A2ALU4 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Shroom2A2ALU4 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Shroom2A2ALU4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Shroom2A2ALU4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Shroom2A2ALU4 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Shroom2A2ALU4 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
Shroom2A2ALU4 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Shroom2A2ALU4 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Shroom2A2ALU4 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Shroom2A2ALU4 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Shroom2A2ALU4 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Shroom2A2ALU4 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Shroom2A2ALU4 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Shroom2A2ALU4 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Shroom2A2ALU4 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Shroom2A2ALU4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Shroom2A2ALU4 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Shroom2A2ALU4 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Shroom2A2ALU4 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Shroom2A2ALU4 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Shroom2A2ALU4 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Shroom2A2ALU4 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Shroom2A2ALU4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Shroom2A2ALU4 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Shroom2A2ALU4 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Shroom2A2ALU4 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Shroom2A2ALU4 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Shroom2A2ALU4 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Shroom2A2ALU4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Shroom2A2ALU4 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Shroom2A2ALU4 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Shroom2A2ALU4 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Shroom2A2ALU4 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Shroom2A2ALU4 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Shroom2A2ALU4 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Shroom2A2ALU4 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Shroom2A2ALU4 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Shroom2A2ALU4 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Shroom2A2ALU4 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Shroom2A2ALU4 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Shroom2A2ALU4 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Shroom2A2ALU4 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
Shroom2A2ALU4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Shroom2A2ALU4 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
Shroom2A2ALU4 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Shroom2A2ALU4 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Shroom2A2ALU4 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Shroom2A2ALU4 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Shroom2A2ALU4 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Shroom2A2ALU4 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Shroom2A2ALU4 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Shroom2A2ALU4 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Shroom2A2ALU4 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Shroom2A2ALU4 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Shroom2A2ALU4 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Shroom2A2ALU4 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Shroom2A2ALU4 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Shroom2A2ALU4 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Shroom2A2ALU4 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Shroom2A2ALU4 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Shroom2A2ALU4 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Shroom2A2ALU4 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Shroom2A2ALU4 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Shroom2A2ALU4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Shroom2A2ALU4 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Shroom2A2ALU4 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Shroom2A2ALU4 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Shroom2A2ALU4 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Shroom2A2ALU4 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Shroom2A2ALU4 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Shroom2A2ALU4 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Shroom2A2ALU4 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Shroom2A2ALU4 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Shroom2A2ALU4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Shroom2A2ALU4 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Shroom2A2ALU4 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Shroom2A2ALU4 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Shroom2A2ALU4 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Shroom2A2ALU4 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Shroom2A2ALU4 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Shroom2A2ALU4 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Shroom2A2ALU4 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Shroom2A2ALU4 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Shroom2A2ALU4 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Shroom2A2ALU4 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Shroom2A2ALU4 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Shroom2A2ALU4 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Shroom2A2ALU4 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Shroom2A2ALU4 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Shroom2A2ALU4 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Shroom2A2ALU4 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Shroom2A2ALU4 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Shroom2A2ALU4 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Shroom2A2ALU4 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms