Protein–RNA interactions for Protein: A2A935

Prdm16, PR domain zinc finger protein 16, mousemouse

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm16A2A935 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Prdm16A2A935 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Prdm16A2A935 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Prdm16A2A935 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Prdm16A2A935 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Prdm16A2A935 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Prdm16A2A935 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Prdm16A2A935 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Prdm16A2A935 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Prdm16A2A935 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Prdm16A2A935 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Prdm16A2A935 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Prdm16A2A935 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Prdm16A2A935 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Prdm16A2A935 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Prdm16A2A935 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Prdm16A2A935 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Prdm16A2A935 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Prdm16A2A935 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Prdm16A2A935 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Prdm16A2A935 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Prdm16A2A935 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Prdm16A2A935 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Prdm16A2A935 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Prdm16A2A935 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Prdm16A2A935 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Prdm16A2A935 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Prdm16A2A935 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Prdm16A2A935 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Prdm16A2A935 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Prdm16A2A935 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Prdm16A2A935 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Prdm16A2A935 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Prdm16A2A935 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Prdm16A2A935 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Prdm16A2A935 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Prdm16A2A935 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Prdm16A2A935 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Prdm16A2A935 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Prdm16A2A935 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Prdm16A2A935 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Prdm16A2A935 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Prdm16A2A935 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Prdm16A2A935 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Prdm16A2A935 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Prdm16A2A935 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Prdm16A2A935 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Prdm16A2A935 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Prdm16A2A935 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Prdm16A2A935 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Prdm16A2A935 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Prdm16A2A935 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Prdm16A2A935 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Prdm16A2A935 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Prdm16A2A935 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Prdm16A2A935 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Prdm16A2A935 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Prdm16A2A935 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Prdm16A2A935 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Prdm16A2A935 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Prdm16A2A935 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Prdm16A2A935 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Prdm16A2A935 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Prdm16A2A935 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Prdm16A2A935 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Prdm16A2A935 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Prdm16A2A935 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Prdm16A2A935 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Prdm16A2A935 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Prdm16A2A935 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Prdm16A2A935 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Prdm16A2A935 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Prdm16A2A935 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Prdm16A2A935 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Prdm16A2A935 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Prdm16A2A935 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Prdm16A2A935 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Prdm16A2A935 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Prdm16A2A935 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Prdm16A2A935 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Prdm16A2A935 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Prdm16A2A935 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Prdm16A2A935 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Prdm16A2A935 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Prdm16A2A935 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Prdm16A2A935 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Prdm16A2A935 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Prdm16A2A935 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Prdm16A2A935 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Prdm16A2A935 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Prdm16A2A935 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Prdm16A2A935 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Prdm16A2A935 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Prdm16A2A935 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Prdm16A2A935 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Prdm16A2A935 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Prdm16A2A935 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Prdm16A2A935 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Prdm16A2A935 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Prdm16A2A935 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms