Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L1

Chd5, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd5A2A8L1 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Chd5A2A8L1 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Chd5A2A8L1 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chd5A2A8L1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chd5A2A8L1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chd5A2A8L1 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Chd5A2A8L1 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Chd5A2A8L1 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chd5A2A8L1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chd5A2A8L1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chd5A2A8L1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chd5A2A8L1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chd5A2A8L1 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chd5A2A8L1 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chd5A2A8L1 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chd5A2A8L1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chd5A2A8L1 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Chd5A2A8L1 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chd5A2A8L1 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Chd5A2A8L1 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chd5A2A8L1 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chd5A2A8L1 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Chd5A2A8L1 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Chd5A2A8L1 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chd5A2A8L1 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chd5A2A8L1 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chd5A2A8L1 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chd5A2A8L1 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Chd5A2A8L1 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chd5A2A8L1 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chd5A2A8L1 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Chd5A2A8L1 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chd5A2A8L1 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chd5A2A8L1 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chd5A2A8L1 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Chd5A2A8L1 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Chd5A2A8L1 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chd5A2A8L1 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chd5A2A8L1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chd5A2A8L1 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chd5A2A8L1 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Chd5A2A8L1 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chd5A2A8L1 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Chd5A2A8L1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Chd5A2A8L1 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Chd5A2A8L1 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Chd5A2A8L1 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Chd5A2A8L1 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Chd5A2A8L1 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Chd5A2A8L1 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Chd5A2A8L1 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Chd5A2A8L1 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chd5A2A8L1 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chd5A2A8L1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chd5A2A8L1 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chd5A2A8L1 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chd5A2A8L1 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Chd5A2A8L1 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chd5A2A8L1 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chd5A2A8L1 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chd5A2A8L1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chd5A2A8L1 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chd5A2A8L1 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Chd5A2A8L1 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Chd5A2A8L1 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chd5A2A8L1 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chd5A2A8L1 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chd5A2A8L1 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Chd5A2A8L1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chd5A2A8L1 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chd5A2A8L1 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chd5A2A8L1 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chd5A2A8L1 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chd5A2A8L1 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chd5A2A8L1 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Chd5A2A8L1 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chd5A2A8L1 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chd5A2A8L1 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chd5A2A8L1 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chd5A2A8L1 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chd5A2A8L1 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chd5A2A8L1 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chd5A2A8L1 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chd5A2A8L1 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Chd5A2A8L1 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chd5A2A8L1 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chd5A2A8L1 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chd5A2A8L1 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chd5A2A8L1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chd5A2A8L1 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chd5A2A8L1 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chd5A2A8L1 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chd5A2A8L1 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chd5A2A8L1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Chd5A2A8L1 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Chd5A2A8L1 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Chd5A2A8L1 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Chd5A2A8L1 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Chd5A2A8L1 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Chd5A2A8L1 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms