Protein–RNA interactions for Protein: A1Z198

Nlrp1b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1b allele 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1bA1Z198 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Nlrp1bA1Z198 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nlrp1bA1Z198 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Nlrp1bA1Z198 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nlrp1bA1Z198 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nlrp1bA1Z198 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nlrp1bA1Z198 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nlrp1bA1Z198 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nlrp1bA1Z198 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nlrp1bA1Z198 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Nlrp1bA1Z198 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nlrp1bA1Z198 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nlrp1bA1Z198 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nlrp1bA1Z198 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nlrp1bA1Z198 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nlrp1bA1Z198 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nlrp1bA1Z198 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nlrp1bA1Z198 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nlrp1bA1Z198 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Nlrp1bA1Z198 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nlrp1bA1Z198 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nlrp1bA1Z198 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nlrp1bA1Z198 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nlrp1bA1Z198 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nlrp1bA1Z198 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nlrp1bA1Z198 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nlrp1bA1Z198 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nlrp1bA1Z198 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nlrp1bA1Z198 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nlrp1bA1Z198 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nlrp1bA1Z198 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nlrp1bA1Z198 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nlrp1bA1Z198 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nlrp1bA1Z198 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nlrp1bA1Z198 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nlrp1bA1Z198 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nlrp1bA1Z198 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nlrp1bA1Z198 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nlrp1bA1Z198 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nlrp1bA1Z198 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nlrp1bA1Z198 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nlrp1bA1Z198 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Nlrp1bA1Z198 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nlrp1bA1Z198 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nlrp1bA1Z198 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nlrp1bA1Z198 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nlrp1bA1Z198 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Nlrp1bA1Z198 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nlrp1bA1Z198 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nlrp1bA1Z198 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nlrp1bA1Z198 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nlrp1bA1Z198 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nlrp1bA1Z198 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nlrp1bA1Z198 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nlrp1bA1Z198 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nlrp1bA1Z198 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nlrp1bA1Z198 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nlrp1bA1Z198 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nlrp1bA1Z198 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nlrp1bA1Z198 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nlrp1bA1Z198 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nlrp1bA1Z198 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrp1bA1Z198 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrp1bA1Z198 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrp1bA1Z198 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrp1bA1Z198 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrp1bA1Z198 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrp1bA1Z198 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrp1bA1Z198 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrp1bA1Z198 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrp1bA1Z198 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrp1bA1Z198 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrp1bA1Z198 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrp1bA1Z198 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrp1bA1Z198 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrp1bA1Z198 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrp1bA1Z198 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrp1bA1Z198 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrp1bA1Z198 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrp1bA1Z198 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrp1bA1Z198 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrp1bA1Z198 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrp1bA1Z198 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrp1bA1Z198 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrp1bA1Z198 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrp1bA1Z198 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrp1bA1Z198 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrp1bA1Z198 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrp1bA1Z198 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrp1bA1Z198 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrp1bA1Z198 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrp1bA1Z198 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrp1bA1Z198 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrp1bA1Z198 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrp1bA1Z198 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrp1bA1Z198 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrp1bA1Z198 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrp1bA1Z198 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nlrp1bA1Z198 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nlrp1bA1Z198 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms