Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Gm18848-201ENSMUST00000182069 792 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Rnf4Q9QZS2 Gm27866-201ENSMUST00000184459 171 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Rnf4Q9QZS2 1700028D13Rik-202ENSMUST00000187272 675 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rnf4Q9QZS2 Gm28186-201ENSMUST00000187447 679 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Rnf4Q9QZS2 Gm28285-204ENSMUST00000187793 601 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rnf4Q9QZS2 Gm29470-201ENSMUST00000188007 696 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Rnf4Q9QZS2 Gm21292-202ENSMUST00000190329 1225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rnf4Q9QZS2 Gm28070-201ENSMUST00000191502 445 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Rnf4Q9QZS2 Gm37585-201ENSMUST00000195440 280 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Rnf4Q9QZS2 Gm5547-203ENSMUST00000200182 683 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rnf4Q9QZS2 Gm43040-201ENSMUST00000202399 558 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Rnf4Q9QZS2 9530003J23Rik-201ENSMUST00000020392 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rnf4Q9QZS2 4933432G23Rik-201ENSMUST00000213675 840 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rnf4Q9QZS2 4930555G07Rik-201ENSMUST00000218226 634 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rnf4Q9QZS2 AC108401.2-201ENSMUST00000220316 346 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rnf4Q9QZS2 AC129219.1-201ENSMUST00000224336 448 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Rnf4Q9QZS2 Olfr350-201ENSMUST00000055130 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
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Rnf4Q9QZS2 Gm9961-201ENSMUST00000068397 547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
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Rnf4Q9QZS2 Olfr1307-202ENSMUST00000099606 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rnf4Q9QZS2 Olfr1306-201ENSMUST00000099607 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rnf4Q9QZS2 Cnep1r1-203ENSMUST00000121097 2209 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rnf4Q9QZS2 Vmn1r39-201ENSMUST00000226217 2258 ntAPPRIS P2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rnf4Q9QZS2 Vmn1r39-204ENSMUST00000227555 2297 ntAPPRIS P2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rnf4Q9QZS2 Vmn1r39-205ENSMUST00000228008 2283 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rnf4Q9QZS2 Fbxw22-201ENSMUST00000080626 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rnf4Q9QZS2 Olfr25-202ENSMUST00000212354 1362 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rnf4Q9QZS2 Tlr11-202ENSMUST00000185091 3207 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rnf4Q9QZS2 Hyal4-201ENSMUST00000031691 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rnf4Q9QZS2 Gm14635-202ENSMUST00000146535 1409 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rnf4Q9QZS2 Gm43577-201ENSMUST00000197090 3344 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Rnf4Q9QZS2 4930422C21Rik-201ENSMUST00000212419 2362 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rnf4Q9QZS2 Gm26603-201ENSMUST00000181380 2861 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Rnf4Q9QZS2 Cyld-206ENSMUST00000209559 4476 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
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Rnf4Q9QZS2 Olfr491-203ENSMUST00000214605 2136 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Rnf4Q9QZS2 Vmn1r52-208ENSMUST00000228665 3226 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Rnf4Q9QZS2 9330178D15Rik-201ENSMUST00000196033 3451 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Rnf4Q9QZS2 Vmn1r37-204ENSMUST00000226974 1770 ntAPPRIS P2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
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Rnf4Q9QZS2 Ccdc66-201ENSMUST00000050480 2457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Rnf4Q9QZS2 Sema6d-205ENSMUST00000103238 3165 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
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Rnf4Q9QZS2 Gm13237-201ENSMUST00000122151 635 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Rnf4Q9QZS2 0610043K17Rik-201ENSMUST00000123107 614 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
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Rnf4Q9QZS2 AF067063-202ENSMUST00000195234 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
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Rnf4Q9QZS2 5033403H07Rik-202ENSMUST00000198248 756 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
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Rnf4Q9QZS2 4933430N04Rik-202ENSMUST00000208031 1146 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
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Rnf4Q9QZS2 Gm17094-201ENSMUST00000169881 3334 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Rnf4Q9QZS2 Cnot4-201ENSMUST00000044163 3337 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Rnf4Q9QZS2 AC160029.1-201ENSMUST00000219628 2678 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
Rnf4Q9QZS2 AW554918-208ENSMUST00000165400 5351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Rnf4Q9QZS2 AW554918-202ENSMUST00000097643 5351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Rnf4Q9QZS2 Top3b-203ENSMUST00000119787 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Rnf4Q9QZS2 Atp10b-201ENSMUST00000077659 6825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Rnf4Q9QZS2 Zgrf1-203ENSMUST00000196141 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Rnf4Q9QZS2 Ankfy1-206ENSMUST00000155998 8030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Rnf4Q9QZS2 Cep192-201ENSMUST00000025425 8093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Rnf4Q9QZS2 Fkbp15-202ENSMUST00000084528 3329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Rnf4Q9QZS2 Olfr118-202ENSMUST00000215811 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rnf4Q9QZS2 Foxp2-204ENSMUST00000115472 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rnf4Q9QZS2 Mat2a-201ENSMUST00000059472 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rnf4Q9QZS2 Pcdh15-211ENSMUST00000126920 6866 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rnf4Q9QZS2 Cacnb4-203ENSMUST00000102761 8039 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rnf4Q9QZS2 Slc24a2-203ENSMUST00000107157 10531 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rnf4Q9QZS2 Gm1527-201ENSMUST00000099170 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rnf4Q9QZS2 Gm37076-201ENSMUST00000192033 2294 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Rnf4Q9QZS2 Omt2a-202ENSMUST00000113376 478 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rnf4Q9QZS2 Gm14870-201ENSMUST00000118414 156 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Rnf4Q9QZS2 Prkd3-203ENSMUST00000118991 1265 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rnf4Q9QZS2 Gm12447-201ENSMUST00000119110 470 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Rnf4Q9QZS2 Gm6461-201ENSMUST00000120015 633 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
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