Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 M6pr-ps-201ENSMUST00000120481 830 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Hmg20aQ9DC33 Gm15160-201ENSMUST00000120553 907 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Hmg20aQ9DC33 Prkag2os1-201ENSMUST00000134633 991 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Hmg20aQ9DC33 Gm11423-201ENSMUST00000136051 655 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Hmg20aQ9DC33 Gm23954-201ENSMUST00000157213 353 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Hmg20aQ9DC33 Gm24057-201ENSMUST00000158616 302 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Hmg20aQ9DC33 Gm17121-201ENSMUST00000170414 847 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Hmg20aQ9DC33 Gm22701-201ENSMUST00000175371 291 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Hmg20aQ9DC33 Gm17222-201ENSMUST00000180135 847 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Hmg20aQ9DC33 Gm27401-201ENSMUST00000184052 173 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Hmg20aQ9DC33 C730036E19Rik-201ENSMUST00000188305 1102 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Hmg20aQ9DC33 Gm7341-201ENSMUST00000192183 926 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Hmg20aQ9DC33 Gm8454-201ENSMUST00000196980 811 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Hmg20aQ9DC33 Gm30676-202ENSMUST00000214464 793 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Hmg20aQ9DC33 AC151971.2-201ENSMUST00000217540 909 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Hmg20aQ9DC33 AC159462.2-201ENSMUST00000217559 463 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Hmg20aQ9DC33 AC133948.2-201ENSMUST00000217850 378 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Hmg20aQ9DC33 4930555G07Rik-201ENSMUST00000218226 634 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Hmg20aQ9DC33 RMST_1.1-213ENSMUST00000220288 792 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Hmg20aQ9DC33 CT030166.4-201ENSMUST00000220640 404 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Hmg20aQ9DC33 Gm18940-201ENSMUST00000222518 871 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Hmg20aQ9DC33 CT030182.4-201ENSMUST00000223647 645 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Hmg20aQ9DC33 Tpbpb-202ENSMUST00000223698 746 ntAPPRIS P2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Hmg20aQ9DC33 AC158981.1-201ENSMUST00000226943 1205 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Hmg20aQ9DC33 Gm20900-201ENSMUST00000078729 472 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Hmg20aQ9DC33 BC147527-201ENSMUST00000081558 504 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Hmg20aQ9DC33 Gm22504-201ENSMUST00000082963 139 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Hmg20aQ9DC33 Gpr15-201ENSMUST00000089318 1290 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Hmg20aQ9DC33 Olfr1247-201ENSMUST00000099771 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Hmg20aQ9DC33 2900079G21Rik-204ENSMUST00000163302 2764 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Hmg20aQ9DC33 Olfr1505-202ENSMUST00000216623 3567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Hmg20aQ9DC33 1700019D03Rik-203ENSMUST00000114493 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Hmg20aQ9DC33 Krcc1-202ENSMUST00000168700 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Hmg20aQ9DC33 Gm17094-201ENSMUST00000169881 3334 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Hmg20aQ9DC33 Gm37100-201ENSMUST00000193344 1353 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Hmg20aQ9DC33 Gm19084-201ENSMUST00000222939 1762 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Hmg20aQ9DC33 AC098728.1-202ENSMUST00000226656 2198 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Hmg20aQ9DC33 Olfr101-202ENSMUST00000214376 2989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Hmg20aQ9DC33 Ryr3-210ENSMUST00000208151 15370 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Hmg20aQ9DC33 Pus10-201ENSMUST00000020520 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Hmg20aQ9DC33 Gm43025-201ENSMUST00000201764 1886 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Hmg20aQ9DC33 2700049A03Rik-201ENSMUST00000045907 4507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hmg20aQ9DC33 4933440M02Rik-201ENSMUST00000061823 3801 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hmg20aQ9DC33 Wdr35-202ENSMUST00000111113 4312 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hmg20aQ9DC33 Kcnc2-202ENSMUST00000218445 4033 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hmg20aQ9DC33 Mbnl1-207ENSMUST00000192607 4552 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hmg20aQ9DC33 AC165260.6-206ENSMUST00000223884 3698 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
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Hmg20aQ9DC33 Gm12344-201ENSMUST00000117087 329 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hmg20aQ9DC33 Gm11259-201ENSMUST00000120554 715 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hmg20aQ9DC33 Gm11954-201ENSMUST00000121403 349 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hmg20aQ9DC33 Gm11545-201ENSMUST00000146507 375 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hmg20aQ9DC33 Tvp23bos-201ENSMUST00000148598 1011 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
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Hmg20aQ9DC33 1700109K24Rik-201ENSMUST00000181870 1045 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
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Hmg20aQ9DC33 AF067063-202ENSMUST00000195234 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hmg20aQ9DC33 Gm37126-201ENSMUST00000195289 883 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hmg20aQ9DC33 2200002A13Rik-201ENSMUST00000206633 709 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
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Hmg20aQ9DC33 Slc9a9-201ENSMUST00000033463 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hmg20aQ9DC33 Serpinb9-202ENSMUST00000063191 3472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hmg20aQ9DC33 Gm1966-201ENSMUST00000184540 7293 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hmg20aQ9DC33 Gria4-204ENSMUST00000212533 5207 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hmg20aQ9DC33 Gimap9-201ENSMUST00000054050 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hmg20aQ9DC33 AC120375.1-201ENSMUST00000227034 3612 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hmg20aQ9DC33 Prkag2os2-201ENSMUST00000123610 1432 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hmg20aQ9DC33 Skint7-204ENSMUST00000163281 1423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hmg20aQ9DC33 Polk-210ENSMUST00000222389 1404 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hmg20aQ9DC33 Olfr39-202ENSMUST00000212983 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hmg20aQ9DC33 Tti1-202ENSMUST00000109522 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hmg20aQ9DC33 Omg-201ENSMUST00000164465 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hmg20aQ9DC33 Smgc-202ENSMUST00000100293 2878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hmg20aQ9DC33 Ifi205-201ENSMUST00000059226 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hmg20aQ9DC33 Parp4-201ENSMUST00000161553 6387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hmg20aQ9DC33 Tnfaip6-201ENSMUST00000065927 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hmg20aQ9DC33 Gm44093-201ENSMUST00000204381 1802 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Hmg20aQ9DC33 9330175M20Rik-201ENSMUST00000189867 2552 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hmg20aQ9DC33 Gm38062-201ENSMUST00000192541 1856 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Hmg20aQ9DC33 Gm43503-201ENSMUST00000200033 3408 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Hmg20aQ9DC33 Pira2-201ENSMUST00000108615 3462 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hmg20aQ9DC33 Gm15922-201ENSMUST00000118068 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hmg20aQ9DC33 Pter-203ENSMUST00000134794 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hmg20aQ9DC33 Ncf2-202ENSMUST00000186568 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
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