Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Vezt-204ENSMUST00000119818 11138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Gm12800-201ENSMUST00000075999 1455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Gm37914-201ENSMUST00000195317 2679 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Vmn1r90-208ENSMUST00000227788 7018 ntAPPRIS P2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Mtus1-205ENSMUST00000118835 6426 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 4933440M02Rik-201ENSMUST00000061823 3801 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Gramd1c-203ENSMUST00000179565 3159 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 4933400F21Rik-203ENSMUST00000187295 2633 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Cnot2-203ENSMUST00000105267 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Iars-202ENSMUST00000164260 3789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Fanci-201ENSMUST00000036865 4645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Lilrb4a-201ENSMUST00000217706 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Gm15228-201ENSMUST00000142044 3440 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Gm6811-201ENSMUST00000169389 1533 ntAPPRIS P1 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Gm10568-201ENSMUST00000193244 1634 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Sv2b-204ENSMUST00000206344 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Gm43842-201ENSMUST00000202890 2982 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Hibch-201ENSMUST00000044478 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Gm26981-201ENSMUST00000182453 3169 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Sntg1-210ENSMUST00000191683 4510 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Olfr971-202ENSMUST00000214242 2027 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Olfr720-204ENSMUST00000217642 4832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Abcd2-201ENSMUST00000069511 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Cfap61-206ENSMUST00000133433 3998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 2700078F05Rik-201ENSMUST00000194331 3244 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Gm21284-201ENSMUST00000205532 3736 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Gm25344-201ENSMUST00000104503 132 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Gm13983-201ENSMUST00000118018 865 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Tex35-203ENSMUST00000119526 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Gm25617-201ENSMUST00000179548 133 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 1700109K24Rik-201ENSMUST00000181870 1045 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Gm27156-201ENSMUST00000184589 754 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Gm42464-202ENSMUST00000198111 774 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Gm5717-201ENSMUST00000198243 1062 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Gm25617-202ENSMUST00000198387 132 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Gm43263-201ENSMUST00000201619 560 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Erh-204ENSMUST00000218364 665 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 CT030170.6-203ENSMUST00000222523 1295 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 AC115735.5-201ENSMUST00000228386 397 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Kpna2-201ENSMUST00000018506 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Gm28431-201ENSMUST00000185592 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Gm28681-201ENSMUST00000187387 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Olfr1500-205ENSMUST00000216287 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Kcnmb2-205ENSMUST00000192429 2357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Cyb5r2-201ENSMUST00000052438 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Gm44584-201ENSMUST00000208395 2880 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 RMST_1.1-210ENSMUST00000219606 2891 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Gm44723-201ENSMUST00000207369 4000 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Tial1-211ENSMUST00000165023 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Olfr266-203ENSMUST00000216610 1520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Gm13872-202ENSMUST00000143995 1408 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Gm14635-202ENSMUST00000146535 1409 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Gm29825-201ENSMUST00000214237 3775 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Kcnip4-208ENSMUST00000176978 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Cavin4-201ENSMUST00000030033 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 AC154576.1-202ENSMUST00000223966 3320 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 AC134577.3-201ENSMUST00000226490 3000 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Kars-ps1-201ENSMUST00000122077 1767 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Gm43335-201ENSMUST00000198299 3276 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Gm24869-201ENSMUST00000104072 128 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Gm24888-201ENSMUST00000104387 130 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Rps12-ps19-201ENSMUST00000119773 400 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Gm13877-201ENSMUST00000120614 417 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Gm11498-201ENSMUST00000120660 949 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Atp5l-ps2-201ENSMUST00000121382 314 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Gm5456-201ENSMUST00000170706 844 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Gm20429-202ENSMUST00000174168 820 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Gm20690-201ENSMUST00000177341 315 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Gm17045-201ENSMUST00000178600 844 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Gm4221-202ENSMUST00000181765 2988 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Gm8609-201ENSMUST00000182967 998 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Mir6337-201ENSMUST00000184194 105 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Gm27970-201ENSMUST00000184854 407 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Ighv1-21-201ENSMUST00000194856 351 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Gm37637-201ENSMUST00000195540 1256 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Gm34144-201ENSMUST00000197039 259 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 1700028E10Rik-204ENSMUST00000201853 767 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Olfr451-ps1-201ENSMUST00000205127 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Gm31409-201ENSMUST00000209894 710 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 AC163661.1-201ENSMUST00000216546 910 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Gm18040-201ENSMUST00000217922 827 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 AC108437.1-201ENSMUST00000222170 776 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Gm7712-201ENSMUST00000222214 337 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 AC132954.2-201ENSMUST00000222400 403 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 AC132260.1-201ENSMUST00000225499 734 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Olfr1129-201ENSMUST00000081034 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Gm23054-201ENSMUST00000082804 162 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Vmn1r220-204ENSMUST00000227950 6238 ntAPPRIS P1 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Zranb3-203ENSMUST00000112538 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Grik2-202ENSMUST00000105484 3992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Gm43187-201ENSMUST00000200652 2397 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Adam28-202ENSMUST00000111072 3025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Gm26806-201ENSMUST00000180403 1519 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Olfr119-201ENSMUST00000080483 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 1700015I17Rik-201ENSMUST00000209585 2099 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Cenpe-201ENSMUST00000062893 7910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Gm8177-201ENSMUST00000181591 1336 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 1810064F22Rik-203ENSMUST00000188595 2307 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Olfr398-203ENSMUST00000214334 5348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Ccdc47Q9D024 Gabrg1-201ENSMUST00000031119 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
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