Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Rps12-ps18-201ENSMUST00000179420 399 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Rps12-ps15-201ENSMUST00000179567 399 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Rpl31-ps23-201ENSMUST00000180440 388 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Rps12l1-201ENSMUST00000183090 399 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm27970-201ENSMUST00000184854 407 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37376-201ENSMUST00000192176 453 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37502-201ENSMUST00000192981 356 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37191-201ENSMUST00000193346 388 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Trav3n-2-201ENSMUST00000197693 334 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Trav3d-2-201ENSMUST00000199874 334 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43098-201ENSMUST00000199989 1297 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45196-201ENSMUST00000206751 825 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 AC154816.1-201ENSMUST00000222688 634 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Eif2ak2-201ENSMUST00000024884 4313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 4930568G15Rik-201ENSMUST00000193317 3218 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Pramef8-201ENSMUST00000037356 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm4924-203ENSMUST00000210381 3330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm17094-201ENSMUST00000169881 3334 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
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Ccdc88cQ6VGS5 Satb1-214ENSMUST00000176669 4407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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Ccdc88cQ6VGS5 Clrn3-201ENSMUST00000053716 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6820-201ENSMUST00000188803 2173 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Cdh8-203ENSMUST00000128860 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 AC156636.2-201ENSMUST00000218845 4557 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm35850-201ENSMUST00000210956 4653 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Tnik-205ENSMUST00000160307 4404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r181-208ENSMUST00000228842 4491 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Ktn1-210ENSMUST00000187839 7945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm3278-201ENSMUST00000164459 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29198-201ENSMUST00000190102 1512 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28379-202ENSMUST00000187676 2896 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Srpk2-201ENSMUST00000088392 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Slc30a7-201ENSMUST00000067485 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Adamts12-201ENSMUST00000061318 8579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Kbtbd8-201ENSMUST00000032107 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
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