Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm37252-201ENSMUST00000195063 1499 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm38013-202ENSMUST00000195453 1499 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm37286-201ENSMUST00000195885 1499 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm43523-201ENSMUST00000197397 2878 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Olfr118-202ENSMUST00000215811 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm34639-201ENSMUST00000222648 2241 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Kpna2-201ENSMUST00000018506 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm37212-201ENSMUST00000192582 3650 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Zfa-ps-202ENSMUST00000180673 3420 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm38137-201ENSMUST00000193735 1401 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Olfr753-ps1-203ENSMUST00000208970 2764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Sox6-204ENSMUST00000166877 8079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Cr2-208ENSMUST00000195120 6212 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Akap5-202ENSMUST00000154078 6685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm15217-201ENSMUST00000111826 733 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm14606-201ENSMUST00000117078 1155 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm13265-201ENSMUST00000118090 421 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm13679-201ENSMUST00000118678 484 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm15484-201ENSMUST00000118871 828 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Prkd3-203ENSMUST00000118991 1265 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm13604-201ENSMUST00000119332 482 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm14563-201ENSMUST00000120571 354 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm11925-201ENSMUST00000121375 535 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm11295-201ENSMUST00000121379 803 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm25057-201ENSMUST00000157366 88 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm7420-201ENSMUST00000162836 842 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Gypc-201ENSMUST00000172434 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Six3os1-213ENSMUST00000177487 537 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Trav9n-3-201ENSMUST00000177705 575 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Faiml-201ENSMUST00000178051 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Trav9d-3-201ENSMUST00000178252 575 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm12424-201ENSMUST00000179673 447 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm18848-201ENSMUST00000182069 792 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Mir7685-201ENSMUST00000183555 62 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Mir6409-201ENSMUST00000184957 92 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm28493-201ENSMUST00000188427 604 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm19185-201ENSMUST00000196365 643 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm43595-201ENSMUST00000196464 1071 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm17833-201ENSMUST00000197629 1065 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Mir1897-202ENSMUST00000198006 79 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Tmigd3-206ENSMUST00000199977 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 BC024386-203ENSMUST00000209817 825 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm31409-201ENSMUST00000209894 710 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm18192-201ENSMUST00000210174 941 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm30619-201ENSMUST00000213962 686 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 AC115793.1-201ENSMUST00000216605 215 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm19217-201ENSMUST00000218238 328 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 AC160931.1-201ENSMUST00000223298 413 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 AC131745.3-201ENSMUST00000223582 554 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 AC154573.2-201ENSMUST00000224174 378 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Olfr574-201ENSMUST00000052997 1041 ntAPPRIS P2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm14548-201ENSMUST00000070639 2128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Cd40-203ENSMUST00000081310 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Olfr641-201ENSMUST00000098183 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Ncf2-202ENSMUST00000186568 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Iqcm-202ENSMUST00000121983 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm28112-201ENSMUST00000190898 1875 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm42992-201ENSMUST00000197043 6836 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Sirpb1c-203ENSMUST00000108350 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Vmn2r6-201ENSMUST00000165012 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Vmn2r7-203ENSMUST00000168072 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 D830032E09Rik-202ENSMUST00000189497 1632 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm6818-201ENSMUST00000190556 2558 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm37100-201ENSMUST00000193344 1353 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Fv1-201ENSMUST00000094481 1380 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Kif27-201ENSMUST00000043605 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 C030017G13Rik-201ENSMUST00000202959 2331 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm17767-202ENSMUST00000190169 3049 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Slc22a29-205ENSMUST00000222533 1473 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Hdlbp-204ENSMUST00000186164 3808 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Azin1-201ENSMUST00000065308 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm26789-201ENSMUST00000181342 2502 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Ugt2a2-201ENSMUST00000079811 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm42496-201ENSMUST00000197976 3241 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Olfr39-202ENSMUST00000212983 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Galnt13-201ENSMUST00000068595 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Zfp455-201ENSMUST00000117110 2556 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Wdr64-202ENSMUST00000171939 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 9330111N05Rik-201ENSMUST00000180409 1407 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Adam34-202ENSMUST00000212185 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Ttll6-202ENSMUST00000167258 3205 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm12324-201ENSMUST00000130837 3753 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Clec12a-201ENSMUST00000065289 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Enpp2-203ENSMUST00000171545 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 C230099D08Rik-201ENSMUST00000215772 2727 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Zfp973-201ENSMUST00000108985 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 1700060C20Rik-201ENSMUST00000109506 605 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm17170-201ENSMUST00000112785 316 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm14870-201ENSMUST00000118414 156 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm15040-201ENSMUST00000118561 1241 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Rps12-ps19-201ENSMUST00000119773 400 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm13740-201ENSMUST00000120590 310 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Olfr360-201ENSMUST00000120704 954 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm13237-201ENSMUST00000122151 635 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Zfp113-202ENSMUST00000132318 488 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 4930513N10Rik-202ENSMUST00000132616 490 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Stau2-209ENSMUST00000145092 564 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm15647-201ENSMUST00000160178 691 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Fabp7-202ENSMUST00000165013 880 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Sft2d1Q5SSN7 Scgb1b27-202ENSMUST00000173387 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
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