Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Gm6436-201ENSMUST00000077163 451 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1510-201ENSMUST00000079459 1014 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm7982-202ENSMUST00000136313 1536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Osbpl9-213ENSMUST00000160271 2604 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Dock9-208ENSMUST00000212376 8107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1513-202ENSMUST00000215147 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Kars-ps1-201ENSMUST00000122077 1767 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm37913-201ENSMUST00000192925 2544 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Trim16-203ENSMUST00000108703 3574 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm4924-203ENSMUST00000210381 3330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Oscp1-201ENSMUST00000035497 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm44068-201ENSMUST00000204049 2128 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Cd44-201ENSMUST00000005218 5614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Tbp-211ENSMUST00000162505 12794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Cytip-201ENSMUST00000028175 6110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Tmprss11f-201ENSMUST00000116553 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm765-201ENSMUST00000164491 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Nlrp1b-201ENSMUST00000094046 3525 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Olfr358-201ENSMUST00000100146 1059 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Igkv9-120-201ENSMUST00000103316 353 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Spaca7-201ENSMUST00000010579 762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm12874-201ENSMUST00000117190 913 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm16249-201ENSMUST00000124055 1258 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Eif4e1b-203ENSMUST00000126785 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm15122-201ENSMUST00000135434 462 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm7613-201ENSMUST00000139070 487 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm15564-201ENSMUST00000144134 545 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Cldn34a-201ENSMUST00000164764 636 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm18447-201ENSMUST00000187501 307 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm29156-201ENSMUST00000187764 499 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm4856-201ENSMUST00000192696 1091 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm44225-201ENSMUST00000203582 186 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm44252-201ENSMUST00000204187 330 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm44856-201ENSMUST00000206639 304 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Spaca7-202ENSMUST00000209428 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Olfr291-201ENSMUST00000211582 1159 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm18618-201ENSMUST00000222211 473 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 CT009711.2-201ENSMUST00000225352 934 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Orm1-201ENSMUST00000030044 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Orm2-201ENSMUST00000075341 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 n-R5s95-201ENSMUST00000082684 118 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Cntrl-204ENSMUST00000113033 1817 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm42544-201ENSMUST00000197868 3242 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 5330409N07Rik-201ENSMUST00000222069 3518 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Tlr4-202ENSMUST00000107365 1866 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm12299-201ENSMUST00000138819 2327 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm38412-201ENSMUST00000199205 3895 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Pde4b-207ENSMUST00000106908 4304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1278-205ENSMUST00000215210 6901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Cfap221-201ENSMUST00000037840 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Angptl1-201ENSMUST00000027885 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Foxp2-209ENSMUST00000131414 1381 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Cd69-201ENSMUST00000032259 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Zfp729a-201ENSMUST00000012314 9455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 AC153729.1-201ENSMUST00000214055 2562 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Nsun6-202ENSMUST00000076435 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Pum2-216ENSMUST00000178015 5874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Dclre1c-201ENSMUST00000061852 7075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Igkv12-44-201ENSMUST00000103367 401 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Tex28-202ENSMUST00000114328 1421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Rpl12-ps1-201ENSMUST00000116168 498 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm8312-201ENSMUST00000119380 618 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 1700054M17Rik-201ENSMUST00000125654 445 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Prlr-204ENSMUST00000128450 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm13963-201ENSMUST00000143525 892 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Snx10-207ENSMUST00000179365 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 1810053B23Rik-202ENSMUST00000185364 590 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 2310008N11Rik-201ENSMUST00000189978 568 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm37234-201ENSMUST00000193259 1441 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm37255-201ENSMUST00000193302 3060 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm6525-201ENSMUST00000193882 1029 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 AC122844.1-201ENSMUST00000195971 107 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm43063-201ENSMUST00000198198 1081 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm43031-201ENSMUST00000198500 1887 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm19088-201ENSMUST00000198800 566 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm44770-201ENSMUST00000205395 1264 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Klk1b10-ps-201ENSMUST00000205895 783 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm45394-201ENSMUST00000209240 1175 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 2310008N11Rik-203ENSMUST00000210732 601 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm2788-207ENSMUST00000211055 1078 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm32568-201ENSMUST00000212782 1421 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 AC108401.2-201ENSMUST00000220316 346 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm19340-201ENSMUST00000221995 345 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 AC154481.1-201ENSMUST00000223532 331 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 AC107663.1-201ENSMUST00000224257 468 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 CT030645.2-201ENSMUST00000224321 1012 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Olfr922-201ENSMUST00000051004 1132 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm6419-201ENSMUST00000097166 429 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Stra6l-202ENSMUST00000107782 4009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Adgre1-201ENSMUST00000004850 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Zfp811-202ENSMUST00000200914 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Mbnl3-204ENSMUST00000136404 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm29398-201ENSMUST00000186355 1491 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm37725-201ENSMUST00000193965 2125 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Reep3-202ENSMUST00000217841 2925 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Vwc2l-201ENSMUST00000053922 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Bbx-201ENSMUST00000066037 4523 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1173-202ENSMUST00000216887 5363 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm14976-201ENSMUST00000117055 1394 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Peak1-204ENSMUST00000188142 7524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89 ms