Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm20877-201ENSMUST00000100105 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Gm24790-201ENSMUST00000104285 132 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Gm14158-201ENSMUST00000118409 308 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Gm14745-201ENSMUST00000118480 1096 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Gm6382-201ENSMUST00000118873 942 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Tex35-203ENSMUST00000119526 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Gm4992-201ENSMUST00000120256 768 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Gm11581-201ENSMUST00000122024 763 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Gm11341-201ENSMUST00000122316 447 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Gm16249-201ENSMUST00000124055 1258 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Gm12923-201ENSMUST00000127060 667 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Gm23276-201ENSMUST00000157913 138 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Gm20454-201ENSMUST00000172713 221 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Gm20917-201ENSMUST00000179922 990 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Gm29357-201ENSMUST00000186877 698 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 1700054O19Rik-201ENSMUST00000193604 868 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Gm37285-201ENSMUST00000194465 1139 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Gm6077-201ENSMUST00000196008 499 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Spcs2-203ENSMUST00000207137 881 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Olfr1289-202ENSMUST00000207494 1014 ntAPPRIS P2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 AL929555.1-201ENSMUST00000215283 509 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 D830013O20Rik-202ENSMUST00000221180 683 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Il20-201ENSMUST00000027673 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Olfr109-201ENSMUST00000031086 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Olfr930-201ENSMUST00000058789 1101 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Vmn1r218-201ENSMUST00000074992 897 ntAPPRIS P2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 BC061237-201ENSMUST00000096899 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Lrrc51-202ENSMUST00000098236 949 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 4921511C10Rik-201ENSMUST00000200412 1463 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Gm20121-201ENSMUST00000198547 1594 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Chl1-206ENSMUST00000205098 2464 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Pcmtd2-202ENSMUST00000108754 3499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Xpo4-201ENSMUST00000089482 3456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Fbxw28-202ENSMUST00000112040 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 4930444G20Rik-201ENSMUST00000092672 1773 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Gm43497-201ENSMUST00000201137 2316 ntBASIC7.02□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Hormad2-203ENSMUST00000109949 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 AC125487.2-201ENSMUST00000219810 1300 ntBASIC7.02□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 1810046K07Rik-201ENSMUST00000039959 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.28
Trim71Q1PSW8 Gm14418-201ENSMUST00000108955 1415 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Olfr1285-202ENSMUST00000220153 1430 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Slc17a8-201ENSMUST00000020102 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Gm26806-201ENSMUST00000180403 1519 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Gm37755-201ENSMUST00000195880 2179 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 AC129085.2-201ENSMUST00000223763 2800 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Bnip3l-201ENSMUST00000022634 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Vmn2r118-201ENSMUST00000168440 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Prox1-202ENSMUST00000175916 7913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Nsd2-205ENSMUST00000114399 7786 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Atp6ap1l-201ENSMUST00000109541 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Zfp616-203ENSMUST00000116546 531 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Gm14893-201ENSMUST00000117904 282 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 2210411M09Rik-201ENSMUST00000128545 643 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Gm13746-201ENSMUST00000133981 605 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Gm14974-201ENSMUST00000139112 804 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Gm11672-201ENSMUST00000140380 645 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Gm11335-201ENSMUST00000148743 1080 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Gm22428-201ENSMUST00000158554 132 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Tnfsf10-202ENSMUST00000174840 989 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 4930467D21Rik-202ENSMUST00000181724 570 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Gm27159-201ENSMUST00000185132 432 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Gm42673-201ENSMUST00000202676 337 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Gm43867-201ENSMUST00000203860 525 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Gm36843-201ENSMUST00000209303 627 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Gm31374-202ENSMUST00000214913 914 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Gm40932-202ENSMUST00000221315 511 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 AC150661.1-201ENSMUST00000222563 495 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 AC154834.1-201ENSMUST00000224697 358 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Olfr1457-201ENSMUST00000075170 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Gm24621-201ENSMUST00000082679 140 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Mir135a-1-201ENSMUST00000083473 90 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Gm15789-201ENSMUST00000118992 1359 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Bbx-205ENSMUST00000114488 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Olfr432-203ENSMUST00000213381 4533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Cntn4-204ENSMUST00000113260 2531 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 5430401H09Rik-202ENSMUST00000218836 2620 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Adam28-203ENSMUST00000224039 2638 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Alpk2-201ENSMUST00000035548 7249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 A630001G21Rik-202ENSMUST00000159122 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Gm37138-201ENSMUST00000194564 2089 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Gbp4-201ENSMUST00000100962 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Slc26a5-202ENSMUST00000115176 2768 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Olfr798-202ENSMUST00000204979 3590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Gm8177-201ENSMUST00000181591 1336 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Cacnb4-203ENSMUST00000102761 8039 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Trappc8-201ENSMUST00000025177 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Smarca2-246ENSMUST00000209085 1841 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Elmo1-202ENSMUST00000180626 2020 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Adam3-209ENSMUST00000171438 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Cmah-207ENSMUST00000224657 3124 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Vmn1r188-202ENSMUST00000226680 8374 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Mtus1-201ENSMUST00000051379 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Zfp239-201ENSMUST00000079405 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 4921539H07Rik-201ENSMUST00000197200 2985 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Nr3c2-201ENSMUST00000034031 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Rslcan18-201ENSMUST00000091526 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Ddx24-201ENSMUST00000044923 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Olfr1339-202ENSMUST00000217522 2559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Grik2-207ENSMUST00000218823 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Trim71Q1PSW8 Gm12842-201ENSMUST00000117298 476 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
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