Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Tmem182-201ENSMUST00000114765 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Rpusd3Q14AI6 Ncoa7-212ENSMUST00000217644 2256 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Rpusd3Q14AI6 Nedd4-207ENSMUST00000184333 4034 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Rpusd3Q14AI6 Son-205ENSMUST00000122302 2449 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Rpusd3Q14AI6 Abca15-202ENSMUST00000121265 5335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Rpusd3Q14AI6 Abca15-201ENSMUST00000076272 5335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Rpusd3Q14AI6 Gm22774-201ENSMUST00000102084 109 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Rpusd3Q14AI6 Mir708-201ENSMUST00000102189 109 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Rpusd3Q14AI6 Igkv1-122-201ENSMUST00000103314 383 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Rpusd3Q14AI6 Gm26416-201ENSMUST00000104280 134 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Rpusd3Q14AI6 Gm11858-201ENSMUST00000117935 838 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Rpusd3Q14AI6 Gm15048-201ENSMUST00000118201 954 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Rpusd3Q14AI6 Tmem216-203ENSMUST00000123788 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Rpusd3Q14AI6 Gm11962-201ENSMUST00000145746 255 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Rpusd3Q14AI6 A430048G15Rik-201ENSMUST00000149965 627 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Rpusd3Q14AI6 Gm25969-201ENSMUST00000157166 132 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Rpusd3Q14AI6 Gm24228-201ENSMUST00000158829 129 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Rpusd3Q14AI6 Pid1-205ENSMUST00000176720 450 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Rpusd3Q14AI6 Gm27001-201ENSMUST00000182252 936 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Rpusd3Q14AI6 Gm17750-201ENSMUST00000182477 529 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Rpusd3Q14AI6 Gm27782-201ENSMUST00000185059 199 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Rpusd3Q14AI6 Platr10-201ENSMUST00000190602 1026 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Rpusd3Q14AI6 Gm31925-202ENSMUST00000194266 537 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Rpusd3Q14AI6 Pilrb2-202ENSMUST00000196162 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Rpusd3Q14AI6 Klrb1-ps1-202ENSMUST00000203057 414 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Rpusd3Q14AI6 Gm43964-201ENSMUST00000203570 301 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Rpusd3Q14AI6 Gm2221-201ENSMUST00000209342 418 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Rpusd3Q14AI6 AC131660.1-201ENSMUST00000215630 1062 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Rpusd3Q14AI6 AC123043.1-201ENSMUST00000221068 645 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Rpusd3Q14AI6 AC127242.3-201ENSMUST00000222009 580 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Rpusd3Q14AI6 AC165157.1-201ENSMUST00000222981 580 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Rpusd3Q14AI6 Lalba-201ENSMUST00000023726 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Rpusd3Q14AI6 Sry-201ENSMUST00000091178 1188 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Rpusd3Q14AI6 Slamf1-201ENSMUST00000015460 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Rpusd3Q14AI6 Gm44046-201ENSMUST00000203145 2678 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Rpusd3Q14AI6 Osbpl9-219ENSMUST00000194478 2903 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Rpusd3Q14AI6 Gm44039-201ENSMUST00000204192 2246 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Rpusd3Q14AI6 Exph5-201ENSMUST00000051014 5957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Rpusd3Q14AI6 Gm44895-201ENSMUST00000206670 1538 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Rpusd3Q14AI6 Kif9-203ENSMUST00000197248 3184 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Rpusd3Q14AI6 Olfr720-204ENSMUST00000217642 4832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Rpusd3Q14AI6 Pcdh15-214ENSMUST00000129404 6857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Rpusd3Q14AI6 Ctps2-202ENSMUST00000101095 1665 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Rpusd3Q14AI6 Vmn2r9-201ENSMUST00000170419 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Rpusd3Q14AI6 Psd3-201ENSMUST00000038959 11319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Rpusd3Q14AI6 Gm9049-201ENSMUST00000178998 2409 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Rpusd3Q14AI6 Gm9045-201ENSMUST00000219760 2409 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Rpusd3Q14AI6 Stc1-201ENSMUST00000014957 4197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
Rpusd3Q14AI6 Cct8-203ENSMUST00000175977 1470 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
Rpusd3Q14AI6 Gm44676-201ENSMUST00000208520 3055 ntBASIC5.71□□□□□ -1.49
Rpusd3Q14AI6 Olfr286-201ENSMUST00000073612 3821 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.49
Rpusd3Q14AI6 Fbxo3-204ENSMUST00000111136 4211 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
Rpusd3Q14AI6 Olfr1250-202ENSMUST00000111527 4386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Rpusd3Q14AI6 Hus1-201ENSMUST00000020683 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Rpusd3Q14AI6 Usp29-201ENSMUST00000054055 2610 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Rpusd3Q14AI6 BC053393-201ENSMUST00000050937 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Rpusd3Q14AI6 Dnajc5b-202ENSMUST00000118735 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Rpusd3Q14AI6 Gm14631-201ENSMUST00000119067 594 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Rpusd3Q14AI6 Gm15081-201ENSMUST00000119794 844 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Rpusd3Q14AI6 Gm13735-201ENSMUST00000120217 670 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Rpusd3Q14AI6 Atp5l-ps2-201ENSMUST00000121382 314 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Rpusd3Q14AI6 Gm16984-201ENSMUST00000130003 982 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Rpusd3Q14AI6 Gm15642-201ENSMUST00000148057 311 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Rpusd3Q14AI6 Gm16138-201ENSMUST00000159341 821 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Rpusd3Q14AI6 Gm3760-201ENSMUST00000167475 804 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Rpusd3Q14AI6 Obox3-ps3-201ENSMUST00000177242 1004 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Rpusd3Q14AI6 Gm3047-202ENSMUST00000177998 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Rpusd3Q14AI6 Gm8297-203ENSMUST00000178389 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Rpusd3Q14AI6 Gm4373-201ENSMUST00000178571 556 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Rpusd3Q14AI6 Gm3460-202ENSMUST00000178927 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Rpusd3Q14AI6 Gm21103-203ENSMUST00000179042 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Rpusd3Q14AI6 Gm8159-203ENSMUST00000179231 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Rpusd3Q14AI6 Gm3029-202ENSMUST00000179327 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Rpusd3Q14AI6 Gm34342-201ENSMUST00000192139 335 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Rpusd3Q14AI6 Ighv1-21-201ENSMUST00000194856 351 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Rpusd3Q14AI6 Gm42883-201ENSMUST00000202594 222 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Rpusd3Q14AI6 Gm6681-201ENSMUST00000205215 607 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Rpusd3Q14AI6 Gm18907-201ENSMUST00000209719 932 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Rpusd3Q14AI6 Gm20751-201ENSMUST00000210260 1270 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Rpusd3Q14AI6 4930434F21Rik-201ENSMUST00000214381 742 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Rpusd3Q14AI6 Gm40685-201ENSMUST00000217861 580 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Rpusd3Q14AI6 Gm31763-203ENSMUST00000219739 1025 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Rpusd3Q14AI6 AC166258.1-201ENSMUST00000219823 893 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Rpusd3Q14AI6 CT030184.2-201ENSMUST00000223064 263 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Rpusd3Q14AI6 Gm34047-201ENSMUST00000223547 606 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Rpusd3Q14AI6 AC122937.2-201ENSMUST00000228258 1051 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Rpusd3Q14AI6 Tnfrsf22-202ENSMUST00000084396 564 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Rpusd3Q14AI6 AU023762-203ENSMUST00000209897 2179 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Rpusd3Q14AI6 Vmn1r184-203ENSMUST00000227232 8472 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Rpusd3Q14AI6 Prrc2c-209ENSMUST00000182593 9022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Rpusd3Q14AI6 Gm44215-201ENSMUST00000204910 2711 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Rpusd3Q14AI6 Xlr3b-201ENSMUST00000101486 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Rpusd3Q14AI6 AC129308.2-203ENSMUST00000224109 2385 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Rpusd3Q14AI6 Gla-201ENSMUST00000033621 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Rpusd3Q14AI6 Clock-205ENSMUST00000202651 9744 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Rpusd3Q14AI6 Vmn1r86-203ENSMUST00000227220 6445 ntAPPRIS P2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Rpusd3Q14AI6 Gm28440-201ENSMUST00000186328 1499 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Rpusd3Q14AI6 Sspo-202ENSMUST00000169350 15571 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Rpusd3Q14AI6 Lingo2-203ENSMUST00000108122 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Rpusd3Q14AI6 Vmn1r176-204ENSMUST00000227129 2955 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.3 ms