Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Gm21693-201ENSMUST00000178531 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
VdrP48281 Gm17174-201ENSMUST00000178962 671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
VdrP48281 Gm21677-201ENSMUST00000179508 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
VdrP48281 Gm21708-201ENSMUST00000180310 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
VdrP48281 Mir6919-201ENSMUST00000185146 62 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
VdrP48281 1810022K09Rik-204ENSMUST00000186870 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
VdrP48281 Gm28191-201ENSMUST00000189112 211 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
VdrP48281 Tmem167-ps1-201ENSMUST00000191236 214 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
VdrP48281 Gm37799-201ENSMUST00000194018 547 ntTSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
VdrP48281 Gm37555-201ENSMUST00000195711 542 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
VdrP48281 Gm43608-201ENSMUST00000197703 687 ntTSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
VdrP48281 Sult1c2-ps1-201ENSMUST00000200231 164 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
VdrP48281 Igkv13-82-201ENSMUST00000200308 346 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
VdrP48281 Gm8686-201ENSMUST00000203028 388 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
VdrP48281 Gm45672-201ENSMUST00000209700 768 ntTSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
VdrP48281 Gm33178-201ENSMUST00000212090 257 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
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VdrP48281 Mbd3l1-203ENSMUST00000215255 708 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
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VdrP48281 AC132468.1-201ENSMUST00000224706 499 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
VdrP48281 AC122877.1-201ENSMUST00000228873 218 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
VdrP48281 Arhgef38-201ENSMUST00000054105 814 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
VdrP48281 Ino80c-201ENSMUST00000055012 909 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
VdrP48281 Krtap3-1-201ENSMUST00000055502 604 ntAPPRIS P1 BASIC7.72□□□□□ -1.17
VdrP48281 Fate1-201ENSMUST00000066116 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
VdrP48281 Xlr4b-203ENSMUST00000081827 1077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
VdrP48281 Tcl1b3-201ENSMUST00000090990 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
VdrP48281 Gm3383-201ENSMUST00000096171 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
VdrP48281 Olfr1099-201ENSMUST00000099871 1031 ntAPPRIS P1 BASIC7.72□□□□□ -1.17
VdrP48281 Rgs4-201ENSMUST00000027991 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
VdrP48281 Nova1-201ENSMUST00000021438 7154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
VdrP48281 C130083A15Rik-201ENSMUST00000205707 1460 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
VdrP48281 Gm43313-201ENSMUST00000201398 2235 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
VdrP48281 9130023H24Rik-201ENSMUST00000078816 3574 ntAPPRIS P1 BASIC7.72□□□□□ -1.17
VdrP48281 Gabpb2-205ENSMUST00000136139 8661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
VdrP48281 Gm6494-201ENSMUST00000218604 2298 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
VdrP48281 Sema3d-205ENSMUST00000197927 3207 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
VdrP48281 Gm20609-201ENSMUST00000177104 1527 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
VdrP48281 Cd53-201ENSMUST00000038845 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
VdrP48281 Bpifc-201ENSMUST00000061699 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
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VdrP48281 1700029I15Rik-202ENSMUST00000111280 416 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
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VdrP48281 5033426E14Rik-201ENSMUST00000212462 783 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
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VdrP48281 Olfr1255-201ENSMUST00000057369 933 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
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VdrP48281 Ighv1-13-201ENSMUST00000095364 294 ntAPPRIS P1 BASIC7.71□□□□□ -1.18
VdrP48281 Gm156-201ENSMUST00000095409 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
VdrP48281 Sap30bp-203ENSMUST00000140991 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
VdrP48281 AC154141.1-201ENSMUST00000208403 4136 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
VdrP48281 Sspo-206ENSMUST00000212740 15408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
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