Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Skiv2l2-201ENSMUST00000022281 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Lrrc63-201ENSMUST00000022574 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Vmn1r84-204ENSMUST00000227427 2880 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Gm3286-202ENSMUST00000200932 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Nsrp1-201ENSMUST00000102494 3114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Rtel1-205ENSMUST00000108815 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Ncor2-201ENSMUST00000055256 7780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
PtprkP35822 Zfp971-201ENSMUST00000108925 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Smim24-202ENSMUST00000118206 949 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Gm23995-201ENSMUST00000158060 129 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Rpl28-ps4-201ENSMUST00000170447 377 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Gm25065-201ENSMUST00000177914 132 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Gm25891-201ENSMUST00000180050 132 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Gm29159-201ENSMUST00000187969 379 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
PtprkP35822 1810006J02Rik-202ENSMUST00000191060 523 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Gm43160-201ENSMUST00000196453 421 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Gm35013-201ENSMUST00000197218 832 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Gm19033-201ENSMUST00000208516 964 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Gm38590-201ENSMUST00000209515 970 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Gm45732-201ENSMUST00000212460 586 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Gm39336-201ENSMUST00000214933 260 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Gm36423-204ENSMUST00000222446 541 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
PtprkP35822 AC154657.1-201ENSMUST00000226394 775 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
PtprkP35822 AC116591.1-201ENSMUST00000227919 351 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Olfr137-201ENSMUST00000057394 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
PtprkP35822 4930432M17Rik-201ENSMUST00000098646 525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Zfp970-201ENSMUST00000099002 794 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Gm14391-201ENSMUST00000099028 473 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Rreb1-201ENSMUST00000037232 8395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Wdr63-201ENSMUST00000160285 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
PtprkP35822 4933406C10Rik-202ENSMUST00000181670 1633 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Mapk8-205ENSMUST00000111945 5756 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Hcrtr2-201ENSMUST00000063140 3761 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Olfr1306-202ENSMUST00000214844 1893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Olfr11-202ENSMUST00000205631 3265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Fam198b-201ENSMUST00000029567 6627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Tial1-211ENSMUST00000165023 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Ccdc141-207ENSMUST00000164114 6222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Trim30d-201ENSMUST00000033211 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Gm42653-201ENSMUST00000200644 2839 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Gm14173-201ENSMUST00000117690 278 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Gm13528-201ENSMUST00000139288 410 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Gm17198-201ENSMUST00000171792 1154 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Gm8895-201ENSMUST00000172300 1223 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Gm18833-201ENSMUST00000173218 862 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Gm37376-201ENSMUST00000192176 453 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
PtprkP35822 4930480K02Rik-201ENSMUST00000203679 1054 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Olfr228-201ENSMUST00000216534 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Tmem45b-204ENSMUST00000217007 783 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PtprkP35822 AC166105.1-201ENSMUST00000227512 482 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Olfr1076-201ENSMUST00000076263 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Magea3-201ENSMUST00000079867 963 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Papolg-201ENSMUST00000020513 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Gm15880-201ENSMUST00000142678 2884 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Kcnj15-208ENSMUST00000113862 5705 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Adgrl4-201ENSMUST00000046977 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Vmn2r85-201ENSMUST00000171811 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Gm13490-201ENSMUST00000143870 2409 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Slco5a1-207ENSMUST00000188454 8463 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Glb1l2-201ENSMUST00000040398 3701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PtprkP35822 AC132465.2-201ENSMUST00000218673 2728 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Rdh1-201ENSMUST00000073639 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Gm12043-201ENSMUST00000131570 2788 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Csrnp3-201ENSMUST00000053910 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Olfr1045-202ENSMUST00000215763 2960 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Nyap2-205ENSMUST00000137862 3393 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprkP35822 5330411O13Rik-201ENSMUST00000205759 1544 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Gm44215-201ENSMUST00000204910 2711 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Sub1-202ENSMUST00000110504 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Gm14512-201ENSMUST00000117924 230 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Mrps36-ps2-201ENSMUST00000118658 309 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Gm14294-201ENSMUST00000119749 751 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Gm11852-201ENSMUST00000120806 222 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Gm7931-201ENSMUST00000121537 271 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Gm15956-201ENSMUST00000153352 502 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Gm22724-201ENSMUST00000158091 127 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Tnik-202ENSMUST00000159308 3831 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprkP35822 1700120O09Rik-201ENSMUST00000177127 977 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Gm27240-201ENSMUST00000183616 677 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Gm28777-201ENSMUST00000191402 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Gm10610-203ENSMUST00000208877 1206 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprkP35822 1190001M18Rik-201ENSMUST00000215937 1270 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprkP35822 AC134537.2-201ENSMUST00000217770 575 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprkP35822 AC153937.2-201ENSMUST00000218485 632 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Ctag2-201ENSMUST00000033524 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Uqcrh-ps1-201ENSMUST00000038391 270 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Rpl23a-ps1-201ENSMUST00000085632 465 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Gm5949-201ENSMUST00000213468 1421 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Tti1-202ENSMUST00000109522 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Rreb1-210ENSMUST00000149745 4320 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Cbll1-203ENSMUST00000101499 3900 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Gm37022-201ENSMUST00000192517 2254 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Sema6a-202ENSMUST00000076043 4123 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Gm33843-201ENSMUST00000219313 1637 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprkP35822 AC135119.1-202ENSMUST00000228435 2203 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Olfr130-203ENSMUST00000217390 5959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprkP35822 AC123629.1-201ENSMUST00000225669 1364 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprkP35822 Lcp1-206ENSMUST00000131802 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms