Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 4930568G15Rik-201ENSMUST00000193317 3218 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Gm37187-201ENSMUST00000193425 341 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Gm7270-201ENSMUST00000195818 1128 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Adgrl2-212ENSMUST00000198779 4592 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Gm36448-201ENSMUST00000199916 438 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Gm7663-201ENSMUST00000201151 1240 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Stx3-206ENSMUST00000211047 870 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Olfr303-205ENSMUST00000216409 4106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 AC154219.1-201ENSMUST00000220764 1262 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 AC123656.1-201ENSMUST00000227121 581 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 AC166574.7-201ENSMUST00000228502 704 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Mir196a-1-201ENSMUST00000083612 102 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 A830082K12Rik-207ENSMUST00000183171 4176 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Ptprj-201ENSMUST00000111493 7124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 D430042O09Rik-201ENSMUST00000069660 6148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Olfr1386-202ENSMUST00000204518 2553 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Vmn1r51-201ENSMUST00000072859 2567 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Gm38178-201ENSMUST00000194502 2471 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Dusp3-202ENSMUST00000107172 4445 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Zfp521-201ENSMUST00000025288 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Hmgn5-201ENSMUST00000033597 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 AC131747.2-201ENSMUST00000226121 1895 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Slc22a8-202ENSMUST00000170817 3398 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Trappc13-206ENSMUST00000179891 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Gstz1-201ENSMUST00000063117 1656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 7420700N18Rik-201ENSMUST00000209524 1644 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Olfr1391-202ENSMUST00000215671 3235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Adam28-202ENSMUST00000111072 3025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Dapp1-203ENSMUST00000136613 2950 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Fbxw19-201ENSMUST00000076617 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Zbtb38-201ENSMUST00000093798 4091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Gm22530-201ENSMUST00000158820 118 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Igkv4-53-201ENSMUST00000166380 292 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Vmn2r-ps37-201ENSMUST00000174682 1044 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Gm9658-201ENSMUST00000182757 1012 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Gm45122-201ENSMUST00000206376 784 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Gm7802-201ENSMUST00000216464 262 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 AC154431.2-201ENSMUST00000225215 1055 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 AC140288.1-201ENSMUST00000226329 503 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Vmn1r180-201ENSMUST00000173816 5060 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Cep85-202ENSMUST00000121566 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Gm12292-201ENSMUST00000122911 2433 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Lgi1-209ENSMUST00000199812 2262 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Haus2-202ENSMUST00000110706 3055 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Dip2b-203ENSMUST00000108971 8127 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Olfr1338-202ENSMUST00000214922 2947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Lingo2-201ENSMUST00000065173 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Kcnk10-202ENSMUST00000221240 7460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Gm340-201ENSMUST00000172371 3729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Fcrl5-204ENSMUST00000193229 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Hnrnpa3-203ENSMUST00000111962 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 AC159264.1-201ENSMUST00000224844 4257 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Med12l-202ENSMUST00000040325 10159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Olfr860-201ENSMUST00000086482 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Gm37090-201ENSMUST00000195694 4105 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Gm44777-201ENSMUST00000205941 4052 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Zfp773-202ENSMUST00000211240 4073 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Olfr292-201ENSMUST00000080165 3211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Krt222-202ENSMUST00000103132 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Il1b-201ENSMUST00000028881 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Mir466j-201ENSMUST00000116876 122 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Gm23884-201ENSMUST00000122687 294 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Tctex1d1-203ENSMUST00000125417 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Zfp286os-201ENSMUST00000128292 713 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Gm22552-201ENSMUST00000157796 337 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Gm20429-202ENSMUST00000174168 820 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Gm22548-201ENSMUST00000174899 78 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Gm29289-201ENSMUST00000188358 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Slamf7-205ENSMUST00000194791 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Gm18290-201ENSMUST00000202900 844 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 4930435C17Rik-202ENSMUST00000210759 974 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Gm19212-201ENSMUST00000216642 862 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Defb42-201ENSMUST00000067990 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Bex6-201ENSMUST00000099990 764 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Akap13-205ENSMUST00000207750 12597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Ctnnd1-219ENSMUST00000111693 6255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Tbc1d24-205ENSMUST00000168378 4350 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 AC122346.1-201ENSMUST00000225266 3732 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 B3gnt5-207ENSMUST00000164397 4872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Zfp729a-201ENSMUST00000012314 9455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Lpin1-204ENSMUST00000221230 4114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Poln-201ENSMUST00000042954 2897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 C2cd3-201ENSMUST00000051777 7803 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Celf2-204ENSMUST00000114924 8738 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 BC080695-201ENSMUST00000105765 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Sorbs2-201ENSMUST00000067065 6337 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Sox6-210ENSMUST00000206034 8668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Zfp263-207ENSMUST00000162207 2452 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Gm14635-202ENSMUST00000146535 1409 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Gm37735-201ENSMUST00000193995 1406 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Olfr1032-202ENSMUST00000079298 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 AC116476.1-201ENSMUST00000226274 2318 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Olfr1418-202ENSMUST00000214796 4046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Gm38412-201ENSMUST00000199205 3895 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Klrb1-201ENSMUST00000112110 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Gm12565-201ENSMUST00000119004 649 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Gm15959-201ENSMUST00000121724 368 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Olfr349-ps1-201ENSMUST00000121879 609 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Tmem216-205ENSMUST00000145210 774 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
PtprbB2RU80 Gm25387-201ENSMUST00000157813 132 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.6 ms