Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Btbd3-201ENSMUST00000075410 4940 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Gm43410-201ENSMUST00000197510 2234 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Gsdmc-201ENSMUST00000110125 2405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Gm26340-201ENSMUST00000102365 99 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Trdv2-2-201ENSMUST00000103678 397 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Gm23979-201ENSMUST00000104071 128 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Gm12531-201ENSMUST00000126099 487 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Gm12827-201ENSMUST00000132690 660 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 1700057H21Rik-201ENSMUST00000152467 383 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Tnfsf10-202ENSMUST00000174840 989 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 4930532G15Rik-201ENSMUST00000180632 699 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Gm27299-201ENSMUST00000184593 103 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 0610031O16Rik-204ENSMUST00000185122 825 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Gm29206-201ENSMUST00000189321 827 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Gm19088-201ENSMUST00000198800 566 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Ighv1-83-201ENSMUST00000199643 351 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Gm44374-201ENSMUST00000199821 140 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Gm4872-201ENSMUST00000205210 1299 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Gm45356-201ENSMUST00000209274 823 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Gm17950-201ENSMUST00000214617 646 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 AC153567.1-201ENSMUST00000218424 1263 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Gm17849-201ENSMUST00000219788 853 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 AC174082.2-201ENSMUST00000222094 543 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 4933412O06Rik-201ENSMUST00000222681 1123 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 AC107663.1-201ENSMUST00000224257 468 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 AC135086.1-201ENSMUST00000228621 817 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Vmn1r37-201ENSMUST00000077482 909 ntAPPRIS P2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Olfr1305-201ENSMUST00000099608 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Gm26608-202ENSMUST00000181503 1362 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Vmn2r88-201ENSMUST00000022438 2574 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Gm37967-201ENSMUST00000195634 2665 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Pcmtd2-202ENSMUST00000108754 3499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Olfr60-205ENSMUST00000216027 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Fktn-203ENSMUST00000128667 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Gm44121-201ENSMUST00000205169 2006 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Gm12021-201ENSMUST00000121061 1746 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Nudt5-201ENSMUST00000026927 4764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Arhgap6-203ENSMUST00000112127 3973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Kcnj1-202ENSMUST00000172015 3075 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Focad-201ENSMUST00000097992 5791 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Zfp74-202ENSMUST00000108205 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Cnga1-202ENSMUST00000126799 2061 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Olfr54-202ENSMUST00000215409 4782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Tcaf3-201ENSMUST00000069023 3110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Spag9-203ENSMUST00000075695 6910 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Gm42885-201ENSMUST00000200763 4214 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Gm14896-201ENSMUST00000121311 1351 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Gstm6-203ENSMUST00000106683 745 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Gm4911-201ENSMUST00000119388 945 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
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Grik3B1AS29 Gm13740-201ENSMUST00000120590 310 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Gm11472-201ENSMUST00000121305 556 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Gm11609-201ENSMUST00000121926 793 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 4933416E03Rik-201ENSMUST00000133091 1126 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Gm13211-201ENSMUST00000141649 697 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
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Grik3B1AS29 Gm22223-201ENSMUST00000157360 125 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Gm25722-201ENSMUST00000157498 279 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
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Grik3B1AS29 Gm22523-201ENSMUST00000158696 100 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Gm3344-201ENSMUST00000169610 603 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Scnm1-202ENSMUST00000173462 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Mir199b-201ENSMUST00000175066 110 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 D13Ertd608e-201ENSMUST00000179131 417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Klk1b7-ps-202ENSMUST00000183762 619 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Gm27972-201ENSMUST00000184720 137 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Gm21877-201ENSMUST00000185640 694 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Ms4a5-202ENSMUST00000186937 816 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Scgb1b17-201ENSMUST00000187081 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Scgb1b10-201ENSMUST00000187257 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Scgb1b15-201ENSMUST00000189118 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 AL929555.1-201ENSMUST00000215283 509 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 AC164881.1-201ENSMUST00000215648 664 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 AC132260.1-201ENSMUST00000225499 734 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 AC132833.4-201ENSMUST00000228313 203 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Il20-201ENSMUST00000027673 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Ms4a4b-201ENSMUST00000035258 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Ms4a5-201ENSMUST00000067673 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Gm14548-201ENSMUST00000070639 2128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Olfr305-202ENSMUST00000213255 3749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Olfr510-202ENSMUST00000213979 2898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 C330024D21Rik-202ENSMUST00000202634 2020 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Gja6-201ENSMUST00000069417 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Zc3h11a-204ENSMUST00000191896 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 AC113031.7-201ENSMUST00000228609 1928 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 AC135119.1-204ENSMUST00000228036 2663 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Itga1-201ENSMUST00000061673 10967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Adar-201ENSMUST00000029563 3753 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Gm43128-201ENSMUST00000202212 1621 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Gm10735-201ENSMUST00000099162 2943 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Gm16123-201ENSMUST00000118647 1517 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Olfr119-201ENSMUST00000080483 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Sox6-210ENSMUST00000206034 8668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Rab1a-206ENSMUST00000163483 2657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Cmah-207ENSMUST00000224657 3124 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Slc15a1-201ENSMUST00000088386 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Gm38070-201ENSMUST00000191850 6480 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Sin3a-201ENSMUST00000049169 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Grik3B1AS29 Gm44553-201ENSMUST00000206316 2037 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
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