Protein–RNA interactions for Protein: A2AM80

Fam43b, Family with sequence similarity 43, member B, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam43bA2AM80 Sprr1b-201ENSMUST00000062160 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Fam43bA2AM80 Serpinb9d-201ENSMUST00000067198 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Fam43bA2AM80 Gm28392-201ENSMUST00000077630 393 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Fam43bA2AM80 Rhox3h-201ENSMUST00000096457 1053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Fam43bA2AM80 BC061237-201ENSMUST00000096899 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Fam43bA2AM80 Fam205c-201ENSMUST00000055944 1655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Fam43bA2AM80 Vangl1-202ENSMUST00000159388 3207 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Fam43bA2AM80 Vmn1r34-203ENSMUST00000226910 2982 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Fam43bA2AM80 March1-201ENSMUST00000039540 2733 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Fam43bA2AM80 Wdr66-206ENSMUST00000163092 4009 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Fam43bA2AM80 Magea10-201ENSMUST00000088481 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Fam43bA2AM80 CT009480.3-201ENSMUST00000224051 3032 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Fam43bA2AM80 Atp13a4-208ENSMUST00000182627 4238 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Fam43bA2AM80 Rtel1-201ENSMUST00000048608 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Fam43bA2AM80 Gjc3-201ENSMUST00000077119 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Fam43bA2AM80 Senp1-201ENSMUST00000044189 6575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Fam43bA2AM80 Tmem167-203ENSMUST00000161568 8689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Fam43bA2AM80 Med12l-202ENSMUST00000040325 10159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Fam43bA2AM80 Pramef8-201ENSMUST00000037356 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Fam43bA2AM80 Helz-203ENSMUST00000106746 13147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Fam43bA2AM80 BC028471-203ENSMUST00000202022 4113 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Fam43bA2AM80 Adcy10-201ENSMUST00000027852 5210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Fam43bA2AM80 Zc3h12c-202ENSMUST00000213645 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Fam43bA2AM80 Plcb1-201ENSMUST00000070724 3853 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Fam43bA2AM80 Gm2065-201ENSMUST00000194697 2757 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Fam43bA2AM80 Prg4-203ENSMUST00000111902 3636 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Fam43bA2AM80 Mmp3-201ENSMUST00000034497 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Fam43bA2AM80 Gm8812-201ENSMUST00000118496 412 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Fam43bA2AM80 Gm14727-201ENSMUST00000118526 525 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Fam43bA2AM80 Vamp7-ps-201ENSMUST00000120334 655 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Fam43bA2AM80 Gm11343-201ENSMUST00000120579 599 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Fam43bA2AM80 Rpl15-ps1-201ENSMUST00000120694 564 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Fam43bA2AM80 Gm14721-201ENSMUST00000121381 525 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Fam43bA2AM80 Gm15845-201ENSMUST00000130244 996 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Fam43bA2AM80 Gm15963-201ENSMUST00000131387 876 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Fam43bA2AM80 4930527B05Rik-201ENSMUST00000141593 602 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Fam43bA2AM80 Gm14093-201ENSMUST00000145579 364 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Fam43bA2AM80 Gm24286-201ENSMUST00000157632 128 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Fam43bA2AM80 Gm22262-201ENSMUST00000158713 86 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Fam43bA2AM80 Gm8439-201ENSMUST00000171482 420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Fam43bA2AM80 Gm42421-201ENSMUST00000172367 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Fam43bA2AM80 Mir3473a-201ENSMUST00000175011 78 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Fam43bA2AM80 Obox3-ps3-201ENSMUST00000177242 1004 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Fam43bA2AM80 Gm28923-201ENSMUST00000187755 322 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Fam43bA2AM80 Gm29349-201ENSMUST00000188692 174 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Fam43bA2AM80 D530018E20Rik-201ENSMUST00000205107 958 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Fam43bA2AM80 Gm28710-202ENSMUST00000211738 2987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Fam43bA2AM80 4930471E15Rik-201ENSMUST00000221147 626 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Fam43bA2AM80 Sprr3-201ENSMUST00000058142 1222 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Fam43bA2AM80 Olfr66-201ENSMUST00000079117 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Fam43bA2AM80 Tcl1b2-201ENSMUST00000081379 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Fam43bA2AM80 Gm24207-201ENSMUST00000082781 108 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Fam43bA2AM80 Olfr1314-201ENSMUST00000099598 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Fam43bA2AM80 Olfr1087-201ENSMUST00000099877 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Fam43bA2AM80 Gimd1-203ENSMUST00000212594 1432 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Fam43bA2AM80 Ccdc127-201ENSMUST00000022063 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Fam43bA2AM80 Gm15930-201ENSMUST00000156603 2037 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Fam43bA2AM80 Olfr947-ps1-202ENSMUST00000214936 2168 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Fam43bA2AM80 Mgam-202ENSMUST00000201148 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Fam43bA2AM80 Mgam-201ENSMUST00000071535 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Fam43bA2AM80 Hps5-203ENSMUST00000107654 4422 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Fam43bA2AM80 Gm18422-202ENSMUST00000203798 2214 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Fam43bA2AM80 Vmn1r52-204ENSMUST00000227578 2370 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Fam43bA2AM80 Wdr7-201ENSMUST00000072726 7109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Fam43bA2AM80 CT025566.1-202ENSMUST00000224800 2511 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Fam43bA2AM80 Prkaa1-201ENSMUST00000051186 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Fam43bA2AM80 Vmn2r-ps120-201ENSMUST00000176341 2409 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Fam43bA2AM80 Gja10-201ENSMUST00000056517 2117 ntAPPRIS P2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Fam43bA2AM80 Obox3-206ENSMUST00000174443 1979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Fam43bA2AM80 Carf-209ENSMUST00000187978 5463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Fam43bA2AM80 Ate1-208ENSMUST00000216011 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Fam43bA2AM80 CR974429.2-201ENSMUST00000221883 1696 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Fam43bA2AM80 Gm20489-201ENSMUST00000117736 1350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Fam43bA2AM80 Olfr698-202ENSMUST00000214306 4006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Fam43bA2AM80 Gm10693-201ENSMUST00000144146 2037 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Fam43bA2AM80 Cyp2j13-201ENSMUST00000030305 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Fam43bA2AM80 Dtna-202ENSMUST00000115832 6295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Fam43bA2AM80 Glyat-201ENSMUST00000044976 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Fam43bA2AM80 Gm22774-201ENSMUST00000102084 109 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Fam43bA2AM80 Snord65-201ENSMUST00000104269 72 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Fam43bA2AM80 Mir466i-201ENSMUST00000116924 121 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Fam43bA2AM80 Gm9311-201ENSMUST00000118042 1269 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Fam43bA2AM80 Gm14869-201ENSMUST00000119007 884 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Fam43bA2AM80 Gm25843-201ENSMUST00000122582 314 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Fam43bA2AM80 Gm23657-201ENSMUST00000122623 294 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Fam43bA2AM80 Gm16224-201ENSMUST00000127711 412 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Fam43bA2AM80 Gm15743-201ENSMUST00000129645 242 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Fam43bA2AM80 Gm11916-201ENSMUST00000132759 650 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Fam43bA2AM80 Gm12082-201ENSMUST00000138164 600 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Fam43bA2AM80 Gm20461-201ENSMUST00000174600 305 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Fam43bA2AM80 Gm17660-202ENSMUST00000178967 337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Fam43bA2AM80 Trav21-dv12-201ENSMUST00000180938 360 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Fam43bA2AM80 Gm27042-201ENSMUST00000181109 1097 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Fam43bA2AM80 Gm27360-201ENSMUST00000183487 80 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Fam43bA2AM80 Mir7212-201ENSMUST00000184098 61 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Fam43bA2AM80 Gm28952-201ENSMUST00000189285 681 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Fam43bA2AM80 Gm29605-201ENSMUST00000190800 292 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Fam43bA2AM80 Gm8924-201ENSMUST00000197405 1132 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Fam43bA2AM80 Gm21040-201ENSMUST00000199493 1132 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Fam43bA2AM80 Gm18469-201ENSMUST00000208850 439 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms