Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Gm21048-201ENSMUST00000202470 1166 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Gm43894-201ENSMUST00000203274 688 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Gm8479-201ENSMUST00000203825 718 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Gm5418-201ENSMUST00000206932 528 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Gm44911-201ENSMUST00000208436 1062 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Sult2a7-204ENSMUST00000211740 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Gm19885-201ENSMUST00000212853 343 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Gm20234-201ENSMUST00000214134 717 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 AC165106.1-201ENSMUST00000227580 408 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Gm2531-201ENSMUST00000075609 512 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Gtsf1l-201ENSMUST00000094653 822 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Vmn1r50-202ENSMUST00000089417 2059 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Olfr1348-210ENSMUST00000214383 2582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Gja10-201ENSMUST00000056517 2117 ntAPPRIS P2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Cyp4a10-201ENSMUST00000058785 2109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 AC153143.1-201ENSMUST00000222966 1340 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Mlh3-203ENSMUST00000220854 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Iqch-201ENSMUST00000042322 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 6430584L05Rik-201ENSMUST00000204412 3151 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Gstz1-201ENSMUST00000063117 1656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Srrm4os-201ENSMUST00000126959 3360 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Gm21284-201ENSMUST00000205532 3736 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Chil3-201ENSMUST00000063062 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Gm45949-201ENSMUST00000221550 1895 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Gm4876-203ENSMUST00000139701 2225 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Zfp934-209ENSMUST00000222746 2206 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 E330034G19Rik-204ENSMUST00000162224 1350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Cmah-208ENSMUST00000224819 9482 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 9930111J21Rik2-202ENSMUST00000101295 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Usp29Q9ES63 Mdga2-210ENSMUST00000222167 2871 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 Mdga2-213ENSMUST00000223141 2850 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 Ubtfl1-201ENSMUST00000098973 1649 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 Rps13-ps6-201ENSMUST00000120038 428 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 Gm7113-201ENSMUST00000120477 958 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 Gm14038-201ENSMUST00000121500 807 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 Gm12175-201ENSMUST00000122081 345 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 Gm12531-201ENSMUST00000126099 487 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 Sp3os-203ENSMUST00000137941 628 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 4930440I19Rik-202ENSMUST00000145972 676 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 Gm23756-201ENSMUST00000157582 114 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 4930486I03Rik-201ENSMUST00000161509 788 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 Vmn1r29-201ENSMUST00000168416 1023 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 Gm22990-201ENSMUST00000175427 89 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 Gm19815-201ENSMUST00000175818 335 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 Gm21761-201ENSMUST00000179502 516 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 Gm27295-201ENSMUST00000184264 153 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 Scgb1b5-ps-201ENSMUST00000189491 280 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 Gm28620-201ENSMUST00000190463 439 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 Gm29508-202ENSMUST00000191414 710 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 Gm38256-201ENSMUST00000192097 950 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 Ighv5-5-201ENSMUST00000193826 329 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 Gm42443-201ENSMUST00000198084 1155 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 Gm42963-201ENSMUST00000202943 1217 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 Gm17918-201ENSMUST00000205315 574 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 Gm44694-201ENSMUST00000205317 1298 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 Gm32983-201ENSMUST00000208500 505 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 Gm45693-201ENSMUST00000211391 1157 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 Gm36756-201ENSMUST00000222011 1214 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 Rpl37a-201ENSMUST00000059980 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 Smurf2-206ENSMUST00000167787 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 Mef2c-227ENSMUST00000199432 3498 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 Svs2-202ENSMUST00000109374 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 4930532G15Rik-202ENSMUST00000195314 1457 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 Fbxw19-201ENSMUST00000076617 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 Gm37730-201ENSMUST00000192432 2211 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 Gm36388-201ENSMUST00000191663 1675 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 Matr3-205ENSMUST00000186796 1854 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 Eaf2-202ENSMUST00000075946 1878 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 Tek-202ENSMUST00000073939 4549 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 Agtpbp1-202ENSMUST00000109830 2879 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 Gm37216-201ENSMUST00000193817 3478 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 Gm44843-201ENSMUST00000208320 1396 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 Ep400-201ENSMUST00000041558 10608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 Dcx-201ENSMUST00000033642 9074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 Depdc1a-202ENSMUST00000106041 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 Zfp317-203ENSMUST00000213725 2354 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 Srgap1-201ENSMUST00000020322 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 Mef2c-213ENSMUST00000197681 2753 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 Cyb5r2-201ENSMUST00000052438 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 AL450321.1-201ENSMUST00000220600 3550 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 Plch1-206ENSMUST00000159676 6560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 Gm33167-201ENSMUST00000201933 2643 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 Mbnl3-204ENSMUST00000136404 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 Pole2-202ENSMUST00000221411 1641 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 Gm9839-201ENSMUST00000195252 1437 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 Olfr11-202ENSMUST00000205631 3265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 Asb4-201ENSMUST00000043294 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 Celf1-207ENSMUST00000111452 7800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 BC064078-202ENSMUST00000131176 2299 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 Grip1-208ENSMUST00000138410 3532 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 C87436-201ENSMUST00000050497 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 Gm15621-201ENSMUST00000119162 364 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 Apc-ps1-201ENSMUST00000119356 470 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 Gm15564-201ENSMUST00000144134 545 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 Gm10364-202ENSMUST00000153034 1001 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 Gm4997-201ENSMUST00000154056 360 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 Gm15940-201ENSMUST00000156011 817 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 Vmn2r-ps66-201ENSMUST00000173203 1256 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 Gm20429-202ENSMUST00000174168 820 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp29Q9ES63 Gm23968-201ENSMUST00000175047 125 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms