Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Rpl31-ps20-201ENSMUST00000080982 378 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc97Q9DBT3 Aox4-201ENSMUST00000040442 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc97Q9DBT3 Gm37289-201ENSMUST00000195409 1402 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc97Q9DBT3 Taf13-204ENSMUST00000143054 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc97Q9DBT3 Etl4-202ENSMUST00000066509 7197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc97Q9DBT3 Zscan18-201ENSMUST00000046245 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc97Q9DBT3 4921534A09Rik-201ENSMUST00000213976 2495 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc97Q9DBT3 Gm45762-201ENSMUST00000212863 2619 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc97Q9DBT3 Gm37483-201ENSMUST00000194382 1484 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc97Q9DBT3 4933403O08Rik-202ENSMUST00000152343 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc97Q9DBT3 Mum1l1-201ENSMUST00000113041 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc97Q9DBT3 Olfr947-ps1-203ENSMUST00000215471 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc97Q9DBT3 Rdh11-203ENSMUST00000161204 3262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc97Q9DBT3 Magi2-207ENSMUST00000197553 3264 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc97Q9DBT3 Hyal4-201ENSMUST00000031691 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc97Q9DBT3 5031410I06Rik-201ENSMUST00000063524 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc97Q9DBT3 Gm7347-201ENSMUST00000095004 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc97Q9DBT3 Aldh1l2-206ENSMUST00000146640 3938 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc97Q9DBT3 Nedd9-201ENSMUST00000021794 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc97Q9DBT3 Aadat-202ENSMUST00000209338 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc97Q9DBT3 AC166574.5-201ENSMUST00000227438 1432 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc97Q9DBT3 Mir99ahg-208ENSMUST00000182748 3151 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc97Q9DBT3 Vmn1r193-204ENSMUST00000228303 6653 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc97Q9DBT3 Gip-202ENSMUST00000103157 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc97Q9DBT3 Gm10999-201ENSMUST00000108743 207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc97Q9DBT3 Macrod2-203ENSMUST00000110061 887 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc97Q9DBT3 Gm3476-201ENSMUST00000112742 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc97Q9DBT3 Gm12442-201ENSMUST00000118372 338 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc97Q9DBT3 Gm13545-201ENSMUST00000119044 482 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc97Q9DBT3 Gm15762-201ENSMUST00000126447 333 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc97Q9DBT3 Tvp23bos-201ENSMUST00000148598 1011 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc97Q9DBT3 1700027A07Rik-201ENSMUST00000150472 458 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc97Q9DBT3 Atp2b4-208ENSMUST00000167348 243 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc97Q9DBT3 Hist2h2bb-201ENSMUST00000177113 381 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc97Q9DBT3 Gm26729-201ENSMUST00000180744 352 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc97Q9DBT3 4931428L18Rik-203ENSMUST00000187659 423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc97Q9DBT3 Gm29050-202ENSMUST00000190865 502 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc97Q9DBT3 Gm37295-201ENSMUST00000192186 109 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc97Q9DBT3 Gm37556-201ENSMUST00000193877 468 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc97Q9DBT3 Ighv8-1-201ENSMUST00000194897 291 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc97Q9DBT3 Pilrb2-202ENSMUST00000196162 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc97Q9DBT3 Gm44471-201ENSMUST00000197963 100 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc97Q9DBT3 Vmn2r-ps24-201ENSMUST00000199364 858 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc97Q9DBT3 Gm43478-201ENSMUST00000200381 292 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc97Q9DBT3 Olfr1345-ps1-201ENSMUST00000210627 244 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc97Q9DBT3 Gm18645-202ENSMUST00000212222 760 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc97Q9DBT3 Akr1c21-201ENSMUST00000021628 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc97Q9DBT3 Akr1c12-201ENSMUST00000021632 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc97Q9DBT3 AC153801.1-201ENSMUST00000217904 947 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc97Q9DBT3 Gm7986-201ENSMUST00000221336 551 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc97Q9DBT3 AC159205.2-201ENSMUST00000223759 816 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc97Q9DBT3 AC154335.1-201ENSMUST00000224744 395 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc97Q9DBT3 AC165154.2-201ENSMUST00000227310 336 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc97Q9DBT3 Serpinb3d-201ENSMUST00000023861 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc97Q9DBT3 Rps29-201ENSMUST00000037023 390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc97Q9DBT3 Olfr670-201ENSMUST00000050482 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc97Q9DBT3 Olfr715-201ENSMUST00000076958 1131 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc97Q9DBT3 Gm6807-201ENSMUST00000077435 888 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc97Q9DBT3 Gm25810-201ENSMUST00000082752 108 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc97Q9DBT3 Vmn1r198-201ENSMUST00000091733 903 ntAPPRIS P2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc97Q9DBT3 Olfr1211-201ENSMUST00000099808 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc97Q9DBT3 Olfr1390-202ENSMUST00000215014 2875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc97Q9DBT3 Arhgap1-201ENSMUST00000090614 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc97Q9DBT3 Gm42894-201ENSMUST00000200788 3390 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc97Q9DBT3 Igf1os-202ENSMUST00000146581 2595 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc97Q9DBT3 Adgrl3-207ENSMUST00000118078 4871 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc97Q9DBT3 E330035G20Rik-202ENSMUST00000223323 3578 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc97Q9DBT3 Gm5590-202ENSMUST00000186976 2315 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc97Q9DBT3 Palmd-202ENSMUST00000119557 3305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc97Q9DBT3 Gm44102-201ENSMUST00000204031 1666 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc97Q9DBT3 Aph1c-202ENSMUST00000169282 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc97Q9DBT3 Gramd1c-204ENSMUST00000214098 2046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ccdc97Q9DBT3 Catsperg2-209ENSMUST00000209126 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Ccdc97Q9DBT3 AC117232.2-201ENSMUST00000219469 2917 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Ccdc97Q9DBT3 Lipk-203ENSMUST00000225505 2083 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Ccdc97Q9DBT3 Ncoa2-203ENSMUST00000081713 8171 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Ccdc97Q9DBT3 Pde10a-207ENSMUST00000115722 3673 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Ccdc97Q9DBT3 Gm38366-201ENSMUST00000193127 1934 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
Ccdc97Q9DBT3 Gm20356-201ENSMUST00000193390 2477 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Ccdc97Q9DBT3 Ect2-203ENSMUST00000108300 4086 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Ccdc97Q9DBT3 Stat1-201ENSMUST00000070968 5151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc97Q9DBT3 Obox3-206ENSMUST00000174443 1979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc97Q9DBT3 Abca6-201ENSMUST00000044003 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc97Q9DBT3 F2rl2-201ENSMUST00000022182 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc97Q9DBT3 C430042M11Rik-201ENSMUST00000180515 1617 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc97Q9DBT3 Iglv1-201ENSMUST00000103746 391 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc97Q9DBT3 Gm25725-201ENSMUST00000104528 130 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc97Q9DBT3 Ccdc47-202ENSMUST00000106865 704 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc97Q9DBT3 Gm6746-201ENSMUST00000108774 483 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc97Q9DBT3 Csn1s2b-203ENSMUST00000113279 745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc97Q9DBT3 Rhox4g-201ENSMUST00000115166 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc97Q9DBT3 Gm14480-201ENSMUST00000118521 433 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc97Q9DBT3 Gm11245-201ENSMUST00000119419 1037 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc97Q9DBT3 Gm12757-201ENSMUST00000119465 800 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc97Q9DBT3 Gm12849-201ENSMUST00000120013 739 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc97Q9DBT3 Gm14202-201ENSMUST00000120121 311 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc97Q9DBT3 Gm11796-201ENSMUST00000120208 972 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc97Q9DBT3 Gm15644-201ENSMUST00000121764 387 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc97Q9DBT3 Gm25271-201ENSMUST00000157273 290 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Ccdc97Q9DBT3 Clec2i-204ENSMUST00000160867 933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms