Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Phc3-204ENSMUST00000108255 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Nyap2-203ENSMUST00000123285 7501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Reep3-202ENSMUST00000217841 2925 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Akap9-201ENSMUST00000044492 13123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Cpsf6-201ENSMUST00000069168 6526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 E330035G20Rik-202ENSMUST00000223323 3578 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Nxt2-203ENSMUST00000112914 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Gm9226-201ENSMUST00000188352 3489 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Gm9573-201ENSMUST00000164502 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 B130024G19Rik-203ENSMUST00000190320 5451 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Eif4a2-203ENSMUST00000115341 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Vmn1r218-202ENSMUST00000226692 10430 ntAPPRIS P2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Gm43022-201ENSMUST00000197067 4268 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Slc7a11-201ENSMUST00000029297 9223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Olfr1278-203ENSMUST00000213727 6744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Sbf2-208ENSMUST00000166020 5481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Sema3a-202ENSMUST00000095012 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Gm13176-201ENSMUST00000117910 477 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Gm13265-201ENSMUST00000118090 421 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Gm15596-201ENSMUST00000121139 784 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Gm12451-201ENSMUST00000121636 633 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Gm15164-201ENSMUST00000122203 271 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Gm4997-201ENSMUST00000154056 360 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Vmn1r190-ps-201ENSMUST00000155950 903 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Gm24781-201ENSMUST00000157636 117 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 G930045G22Rik-202ENSMUST00000161723 673 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Gm3344-201ENSMUST00000169610 603 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Gm4152-201ENSMUST00000172675 259 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Gm20617-202ENSMUST00000177332 758 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Gm26738-201ENSMUST00000181312 601 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Gm27010-201ENSMUST00000182727 863 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 2310043O21Rik-201ENSMUST00000185323 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Gm43383-201ENSMUST00000195981 469 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Gm36448-201ENSMUST00000199916 438 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 1700028E10Rik-204ENSMUST00000201853 767 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Fxyd4-204ENSMUST00000203433 670 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Gm35188-201ENSMUST00000218869 535 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 4933412O06Rik-201ENSMUST00000222681 1123 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Fxyd4-201ENSMUST00000005114 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Tceal8-201ENSMUST00000060101 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Mir484-201ENSMUST00000093566 67 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Mup8-201ENSMUST00000095058 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Olfr66-202ENSMUST00000216303 3080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Actl11-201ENSMUST00000085073 3993 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Nexn-201ENSMUST00000046045 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Rad21l-202ENSMUST00000180195 1659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Gm26786-201ENSMUST00000180410 6243 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 AC158988.1-201ENSMUST00000226731 2624 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Atp10d-201ENSMUST00000094710 2365 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Tcf7l2-201ENSMUST00000041717 3590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Scyl3-203ENSMUST00000161908 3718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Gm30329-201ENSMUST00000211572 3077 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 AC135083.2-201ENSMUST00000228599 1456 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Gm37786-201ENSMUST00000191714 3225 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Vmn1r54-202ENSMUST00000226921 3234 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Olfr971-202ENSMUST00000214242 2027 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Olfr131-203ENSMUST00000215940 1614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Gm15789-201ENSMUST00000118992 1359 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 E330034G19Rik-204ENSMUST00000162224 1350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Gm36640-201ENSMUST00000203686 5934 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Gm30698-201ENSMUST00000214789 3198 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Mrps25-203ENSMUST00000140438 6073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Cyp4a10-202ENSMUST00000094886 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Plk4-202ENSMUST00000167556 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Olfr239-203ENSMUST00000214406 3773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Rnu11-201ENSMUST00000104135 134 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Olfr585-201ENSMUST00000104881 1030 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Klra3-202ENSMUST00000111998 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Crisp4-202ENSMUST00000115340 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Rps13-ps6-201ENSMUST00000120038 428 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Gm15750-201ENSMUST00000120970 616 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Gm12101-201ENSMUST00000121590 390 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Gm11609-201ENSMUST00000121926 793 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Gm13669-201ENSMUST00000122366 457 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Gm15265-202ENSMUST00000143287 814 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Gm25550-201ENSMUST00000158079 128 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Gm6133-201ENSMUST00000164064 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Gm11107-201ENSMUST00000165414 505 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Gm6061-201ENSMUST00000175860 492 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Gm10428-201ENSMUST00000178750 399 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Olr1-203ENSMUST00000182784 570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Gm31925-202ENSMUST00000194266 537 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 9530003J23Rik-201ENSMUST00000020392 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Hddc3-209ENSMUST00000206480 454 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Gm5324-201ENSMUST00000208115 476 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Olfr1155-203ENSMUST00000215903 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 AC154573.2-201ENSMUST00000224174 378 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 AC154806.1-203ENSMUST00000227370 1032 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Orm1-201ENSMUST00000030044 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Gsta4-201ENSMUST00000034903 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Nup43-201ENSMUST00000040135 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 1700014D04Rik-201ENSMUST00000055343 795 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Krtap13-1-201ENSMUST00000060494 748 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Orm2-201ENSMUST00000075341 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Zfp865-202ENSMUST00000076791 1129 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 1700084J12Rik-201ENSMUST00000079057 734 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Gm22053-201ENSMUST00000083394 200 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Olfr461-201ENSMUST00000089490 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
SrpraQ9DBG7 Olfr652-201ENSMUST00000098175 1061 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms