Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Sh3bgr-207ENSMUST00000171181 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Gm28340-201ENSMUST00000189218 202 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Gm10640-202ENSMUST00000190947 1134 ntTSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Gm34342-201ENSMUST00000192139 335 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Gm2453-201ENSMUST00000193383 357 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Gm38232-201ENSMUST00000193602 411 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Gm17895-201ENSMUST00000194028 874 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Helt-202ENSMUST00000210652 1282 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Gm17997-201ENSMUST00000211801 840 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Gm4042-201ENSMUST00000216946 637 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 CT030657.2-201ENSMUST00000220710 792 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Gm11541-201ENSMUST00000069852 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Gm10555-201ENSMUST00000193178 1791 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Zdhhc9-202ENSMUST00000088935 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Vwde-201ENSMUST00000054530 3979 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Nlrp1c-ps-202ENSMUST00000174668 3422 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 4933427D14Rik-201ENSMUST00000108505 1495 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 AC139754.2-201ENSMUST00000218037 1455 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Sox6-204ENSMUST00000166877 8079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Ankrd66-201ENSMUST00000178772 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Gm38276-201ENSMUST00000192446 1343 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Gm43285-201ENSMUST00000196563 3592 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Olfr1215-202ENSMUST00000214809 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Gm2309-201ENSMUST00000149994 1941 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Heph-203ENSMUST00000113838 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Rrh-201ENSMUST00000029648 1506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Iglc2-201ENSMUST00000103749 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Gm26079-201ENSMUST00000104066 133 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Gm14870-201ENSMUST00000118414 156 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Gtsf1-209ENSMUST00000153930 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Gm22311-201ENSMUST00000158006 110 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Six3os1-204ENSMUST00000161688 567 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Gm3585-201ENSMUST00000173438 875 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Trav21-dv12-201ENSMUST00000180938 360 ntAPPRIS P1 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Mir6908-201ENSMUST00000184056 63 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Mir6987-201ENSMUST00000184789 73 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Gm37285-201ENSMUST00000194465 1139 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Gm42543-201ENSMUST00000198756 353 ntAPPRIS P1 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Gm44896-201ENSMUST00000206190 772 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Scp2-ps2-202ENSMUST00000213851 609 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 AC108846.4-201ENSMUST00000216783 341 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 AC153955.3-201ENSMUST00000216787 646 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Gm35619-201ENSMUST00000222548 600 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 AC151730.1-201ENSMUST00000226106 448 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Defb46-201ENSMUST00000095436 174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Bglap2-201ENSMUST00000098956 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Ccdc66-201ENSMUST00000050480 2457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Zfp934-209ENSMUST00000222746 2206 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Gm9894-201ENSMUST00000171257 2904 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Akr1e1-202ENSMUST00000110691 3288 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Gm37595-201ENSMUST00000192668 1742 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Gm28993-201ENSMUST00000186236 1499 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Gm37870-201ENSMUST00000192349 1499 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Gm37467-202ENSMUST00000192785 1499 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Gm37252-201ENSMUST00000195063 1499 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Gm38013-202ENSMUST00000195453 1499 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Gm37286-201ENSMUST00000195885 1499 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Mdm4-202ENSMUST00000067429 3490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Olfr1390-202ENSMUST00000215014 2875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 BC064078-202ENSMUST00000131176 2299 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Vmn1r176-204ENSMUST00000227129 2955 ntAPPRIS P1 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Vmn1r176-207ENSMUST00000228793 2959 ntAPPRIS P1 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Nmur2-201ENSMUST00000037682 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Gdap10-201ENSMUST00000180613 5003 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Asb4-201ENSMUST00000043294 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Bclaf1-202ENSMUST00000092678 5307 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Vmn2r104-201ENSMUST00000168050 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Gm37107-201ENSMUST00000195326 2552 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Olfr571-203ENSMUST00000215773 5153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Ttc41-202ENSMUST00000075632 4366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Serpina9-201ENSMUST00000058464 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Depdc1a-202ENSMUST00000106041 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Gsdmc4-201ENSMUST00000063530 1988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Gm26843-201ENSMUST00000212304 2859 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Vmn1r196-205ENSMUST00000228557 5790 ntAPPRIS P2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 P2ry14-203ENSMUST00000196081 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Ighv12-3-201ENSMUST00000103485 353 ntAPPRIS P1 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Gm2178-201ENSMUST00000104927 357 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Tpm3-rs2-201ENSMUST00000116350 323 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Gm14614-201ENSMUST00000119873 384 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Gm5834-201ENSMUST00000126680 1026 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Gm25395-201ENSMUST00000157343 272 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Rsl24d1-204ENSMUST00000169399 841 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Gm20691-201ENSMUST00000176889 333 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Gm27159-201ENSMUST00000185132 432 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 4930568A12Rik-202ENSMUST00000188292 926 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Gm28846-201ENSMUST00000189161 368 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Gm28620-201ENSMUST00000190463 439 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 2310046K23Rik-201ENSMUST00000193521 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Gm43377-201ENSMUST00000201640 455 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Gm18012-201ENSMUST00000204558 773 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Gm45693-201ENSMUST00000211391 1157 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Gm31036-201ENSMUST00000212925 521 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Sfrp4-204ENSMUST00000222992 1062 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Olfr303-201ENSMUST00000053958 1040 ntAPPRIS P1 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Olfr299-201ENSMUST00000057734 993 ntAPPRIS P1 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Olfr420-201ENSMUST00000068403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Plb1-201ENSMUST00000101376 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 Slamf7-202ENSMUST00000192024 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Ccdc47Q9D024 AC107742.1-201ENSMUST00000227769 1390 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
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