Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Gm18655-201ENSMUST00000214802 1090 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 Mplkip-202ENSMUST00000221480 582 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm10126-201ENSMUST00000221732 168 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm8616-201ENSMUST00000222175 1037 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 AC160114.3-201ENSMUST00000222256 560 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 AC154380.1-201ENSMUST00000226804 720 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 Lyrm1-201ENSMUST00000054440 752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm6054-201ENSMUST00000078052 378 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 Olfr220-201ENSMUST00000085861 978 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm7731-201ENSMUST00000091759 470 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 AC151530.1-203ENSMUST00000223343 2591 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 Mapk9-204ENSMUST00000109178 1302 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm31267-201ENSMUST00000218941 1397 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 Ifi44l-201ENSMUST00000046739 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm13749-201ENSMUST00000133244 1432 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm20655-202ENSMUST00000181428 2946 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 AC187103.1-201ENSMUST00000224641 1475 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 Dlx6os1-201ENSMUST00000159568 4608 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm45424-201ENSMUST00000210575 3300 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 Zfp607a-202ENSMUST00000205534 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 AC124516.1-201ENSMUST00000221845 3544 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 Kcnj16-206ENSMUST00000180023 3701 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 AC105407.2-201ENSMUST00000223707 3911 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1353-201ENSMUST00000039718 1992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1311-203ENSMUST00000215321 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 Impact-201ENSMUST00000025290 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm26416-201ENSMUST00000104280 134 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm25498-201ENSMUST00000104424 129 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm17184-201ENSMUST00000111864 462 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm8430-201ENSMUST00000119780 471 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm15538-201ENSMUST00000121410 313 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 Slf1-201ENSMUST00000151524 3747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 Fcor-201ENSMUST00000159364 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm17212-201ENSMUST00000166666 259 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm23162-201ENSMUST00000175081 121 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm26581-201ENSMUST00000181953 4479 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm5787-201ENSMUST00000183049 1038 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm27684-201ENSMUST00000183778 80 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm28894-201ENSMUST00000185214 615 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm28965-201ENSMUST00000186015 1500 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm3121-201ENSMUST00000187086 406 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm37369-201ENSMUST00000194179 615 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm37907-201ENSMUST00000195644 846 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm31049-201ENSMUST00000201516 1302 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 4933406L23Rik-201ENSMUST00000203567 1509 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm43964-201ENSMUST00000203570 301 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm5586-201ENSMUST00000206264 795 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 Olfr720-202ENSMUST00000206298 4437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm44984-201ENSMUST00000207802 394 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm34533-201ENSMUST00000209249 552 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm45360-201ENSMUST00000210698 1405 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 Olfr108-202ENSMUST00000218675 1038 ntAPPRIS P2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm18503-201ENSMUST00000220340 728 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 AC129308.2-203ENSMUST00000224109 2385 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 AC164436.1-201ENSMUST00000227074 772 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r176-204ENSMUST00000227129 2955 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 Ftmt-201ENSMUST00000025388 1451 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 1700011L22Rik-201ENSMUST00000034109 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 Olfr743-201ENSMUST00000071294 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 Defa35-201ENSMUST00000078121 398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 Olfr108-201ENSMUST00000078207 1038 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 Rps27a-ps2-201ENSMUST00000078766 467 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 n-R5s29-201ENSMUST00000082836 119 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 Serpinb5-201ENSMUST00000086701 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 C3ar1-201ENSMUST00000042081 4305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 Xpo7-203ENSMUST00000226448 3663 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm37086-201ENSMUST00000193082 3452 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 Zbed4-ps2-201ENSMUST00000187003 3448 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 Naip6-201ENSMUST00000042220 6705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 Sgip1-205ENSMUST00000106882 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm43421-201ENSMUST00000200044 2905 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 Platr25-202ENSMUST00000220733 2859 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 Slamf1-201ENSMUST00000015460 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 A730009L09Rik-201ENSMUST00000209558 2512 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm4876-203ENSMUST00000139701 2225 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 Eif4a2-203ENSMUST00000115341 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 Fat4-201ENSMUST00000061260 16109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 Olfr348-204ENSMUST00000215199 3557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 P2ry14-203ENSMUST00000196081 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r8-202ENSMUST00000227706 1563 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 Lrrtm4-208ENSMUST00000147663 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 Kif27-201ENSMUST00000043605 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm14367-201ENSMUST00000119214 1497 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 Btbd35f9-201ENSMUST00000178219 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 Btbd35f22-201ENSMUST00000178747 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 Btbd35f30-201ENSMUST00000179069 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 Btbd35f25-201ENSMUST00000179086 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 Btbd35f6-201ENSMUST00000179466 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 Btbd35f29-201ENSMUST00000179532 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 Btbd35f8-201ENSMUST00000180004 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 Btbd35f26-201ENSMUST00000180197 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 Dlg1-206ENSMUST00000115205 4364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 Trpm3-203ENSMUST00000087576 6740 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 Cbll1-202ENSMUST00000085487 1332 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm26016-201ENSMUST00000104403 129 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 Uros-202ENSMUST00000106144 1045 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm13798-201ENSMUST00000118285 139 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 Gm12601-201ENSMUST00000118994 846 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 Olfr360-201ENSMUST00000120704 954 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Rprd1bQ9CSU0 BC064078-201ENSMUST00000122939 570 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.6 ms