Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 AC125328.1-201ENSMUST00000226812 2265 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
NischQ80TM9 Arpp21-210ENSMUST00000159451 2805 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NischQ80TM9 Mroh2a-202ENSMUST00000113130 7491 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NischQ80TM9 Oat-rs1-201ENSMUST00000122186 1311 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
NischQ80TM9 F930017D23Rik-201ENSMUST00000099888 1836 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
NischQ80TM9 Mfap1b-201ENSMUST00000056732 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
NischQ80TM9 Pramel5-202ENSMUST00000105752 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
NischQ80TM9 9430053O09Rik-201ENSMUST00000192654 2570 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
NischQ80TM9 Cd47-202ENSMUST00000114496 867 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
NischQ80TM9 Gm13998-201ENSMUST00000120952 335 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
NischQ80TM9 1600025M17Rik-201ENSMUST00000138262 666 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
NischQ80TM9 Gm27227-201ENSMUST00000183413 633 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.23
NischQ80TM9 Gm8581-201ENSMUST00000188636 890 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
NischQ80TM9 Gm35013-201ENSMUST00000197218 832 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
NischQ80TM9 Gm19060-201ENSMUST00000201959 421 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
NischQ80TM9 AC122251.2-201ENSMUST00000227341 603 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
NischQ80TM9 Gm15354-201ENSMUST00000132019 1772 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
NischQ80TM9 Cwc22-202ENSMUST00000111818 3255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
NischQ80TM9 AC132465.2-201ENSMUST00000218673 2728 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NischQ80TM9 BC051142-202ENSMUST00000097348 1732 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NischQ80TM9 Arhgap21-210ENSMUST00000154230 6972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NischQ80TM9 Sbno1-216ENSMUST00000199808 10161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NischQ80TM9 Slc25a53-202ENSMUST00000113069 3189 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NischQ80TM9 Gm15093-201ENSMUST00000179021 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NischQ80TM9 Csrnp3-201ENSMUST00000053910 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NischQ80TM9 Gm38366-201ENSMUST00000193127 1934 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
NischQ80TM9 Gm15401-203ENSMUST00000156497 378 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NischQ80TM9 Gm5218-201ENSMUST00000172270 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NischQ80TM9 Gm7713-201ENSMUST00000181201 1007 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
NischQ80TM9 Gm29050-202ENSMUST00000190865 502 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NischQ80TM9 Prl8a8-204ENSMUST00000224072 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NischQ80TM9 Olfr352-201ENSMUST00000065416 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NischQ80TM9 Ikbkg-217ENSMUST00000164101 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NischQ80TM9 Ikbkg-218ENSMUST00000180230 6785 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NischQ80TM9 C1s1-203ENSMUST00000160505 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NischQ80TM9 Oxtr-202ENSMUST00000204027 3721 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NischQ80TM9 Gm37951-201ENSMUST00000192963 3032 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
NischQ80TM9 Ifi207-202ENSMUST00000127730 3145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NischQ80TM9 Cyp2j7-201ENSMUST00000162514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NischQ80TM9 5330411O13Rik-201ENSMUST00000205759 1544 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NischQ80TM9 Gstz1-201ENSMUST00000063117 1656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NischQ80TM9 Myo6-205ENSMUST00000127779 4067 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NischQ80TM9 Gm20486-201ENSMUST00000101544 128 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
NischQ80TM9 Lrrc51-205ENSMUST00000106965 743 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NischQ80TM9 Gm13890-201ENSMUST00000117578 390 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
NischQ80TM9 Gm6541-201ENSMUST00000165542 561 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
NischQ80TM9 Gm43105-201ENSMUST00000202987 459 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
NischQ80TM9 AC156037.1-201ENSMUST00000221133 127 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
NischQ80TM9 AC125543.3-201ENSMUST00000221991 126 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
NischQ80TM9 Sec24a-201ENSMUST00000038210 3800 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NischQ80TM9 A930038B10Rik-201ENSMUST00000180412 4084 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NischQ80TM9 Olfr286-201ENSMUST00000073612 3821 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NischQ80TM9 Arhgap6-203ENSMUST00000112127 3973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NischQ80TM9 Ano4-210ENSMUST00000182790 4018 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NischQ80TM9 Gm8855-201ENSMUST00000118888 878 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
NischQ80TM9 Tbata-207ENSMUST00000140456 953 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NischQ80TM9 Tbata-208ENSMUST00000143207 982 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NischQ80TM9 Gm23031-201ENSMUST00000157998 119 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
NischQ80TM9 Gm2012-202ENSMUST00000163263 892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NischQ80TM9 Gm6121-202ENSMUST00000167438 893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NischQ80TM9 Stk-ps1-201ENSMUST00000173340 1074 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
NischQ80TM9 Gm45724-201ENSMUST00000213031 420 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
NischQ80TM9 CT009600.1-201ENSMUST00000228771 337 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
NischQ80TM9 n-R5s36-201ENSMUST00000082998 119 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
NischQ80TM9 Tmprss15-202ENSMUST00000060402 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NischQ80TM9 Cyfip2-202ENSMUST00000093166 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NischQ80TM9 Trpm8-201ENSMUST00000040210 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NischQ80TM9 Gas7-204ENSMUST00000108682 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NischQ80TM9 Birc6-202ENSMUST00000180037 15768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NischQ80TM9 Sptlc3-202ENSMUST00000110083 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NischQ80TM9 Scoc-201ENSMUST00000081506 1791 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NischQ80TM9 Nsun6-202ENSMUST00000076435 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NischQ80TM9 Usp8-202ENSMUST00000110416 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NischQ80TM9 Trav14-3-201ENSMUST00000103589 384 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NischQ80TM9 Gm22952-201ENSMUST00000116720 120 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
NischQ80TM9 Gm11528-201ENSMUST00000156822 914 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NischQ80TM9 Gm28237-201ENSMUST00000186563 641 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NischQ80TM9 Gm22053-201ENSMUST00000083394 200 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
NischQ80TM9 Vmn1r44-212ENSMUST00000228183 1838 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
NischQ80TM9 Oxgr1-201ENSMUST00000058213 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NischQ80TM9 D5Ertd577e-202ENSMUST00000202481 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NischQ80TM9 Depdc5-205ENSMUST00000120902 5195 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NischQ80TM9 Kirrel3os-201ENSMUST00000066604 3799 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NischQ80TM9 Gm7970-201ENSMUST00000167615 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NischQ80TM9 Gm8229-201ENSMUST00000168161 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NischQ80TM9 Olfr551-202ENSMUST00000213540 5440 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NischQ80TM9 Cdip1-201ENSMUST00000004173 3953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NischQ80TM9 Sh2d4b-201ENSMUST00000070328 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NischQ80TM9 9830004L10Rik-201ENSMUST00000185548 2177 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NischQ80TM9 Nsun4-202ENSMUST00000030475 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NischQ80TM9 Mup3-202ENSMUST00000107472 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NischQ80TM9 Ccdc32-202ENSMUST00000110833 732 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NischQ80TM9 Gm11731-201ENSMUST00000139704 670 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NischQ80TM9 Gm8929-201ENSMUST00000197781 1132 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
NischQ80TM9 Gm43263-201ENSMUST00000201619 560 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NischQ80TM9 AC192333.6-201ENSMUST00000224565 725 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
NischQ80TM9 Olfr491-201ENSMUST00000053179 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NischQ80TM9 Gm43421-201ENSMUST00000200044 2905 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
NischQ80TM9 Kng1-201ENSMUST00000023589 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NischQ80TM9 Gm36527-201ENSMUST00000195500 3029 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
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