Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Celf2-204ENSMUST00000114924 8738 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 Gm23311-201ENSMUST00000104152 134 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 Slmap-204ENSMUST00000112330 3962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 Rpl12-ps1-201ENSMUST00000116168 498 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 Gm13930-201ENSMUST00000118569 368 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 Gm11245-201ENSMUST00000119419 1037 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 Gm12244-201ENSMUST00000119500 291 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 Gm16249-201ENSMUST00000124055 1258 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 1700047F07Rik-202ENSMUST00000143064 463 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 Gm24343-201ENSMUST00000158708 111 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 Gm23450-201ENSMUST00000178285 91 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 Dleu2-207ENSMUST00000182756 3530 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 Gm27299-201ENSMUST00000184593 103 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 Zfp799-202ENSMUST00000201499 651 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 Gm34829-202ENSMUST00000216017 1131 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 AC153821.2-201ENSMUST00000220253 468 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 AC126685.1-201ENSMUST00000221001 121 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 Gm5928-201ENSMUST00000221839 466 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 AC164436.1-201ENSMUST00000227074 772 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 Alpk1-206ENSMUST00000198955 4498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 Nlrp1c-ps-202ENSMUST00000174668 3422 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 Impg1-202ENSMUST00000113250 2965 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 Gm6614-202ENSMUST00000181628 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 Trmt5-201ENSMUST00000116420 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 Adam28-202ENSMUST00000111072 3025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 Exph5-201ENSMUST00000051014 5957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 Mapk9-204ENSMUST00000109178 1302 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 Ptprz1-206ENSMUST00000202579 6871 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 Olfr305-204ENSMUST00000216700 3734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 Kcne4-202ENSMUST00000187432 1813 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 Ttc21b-202ENSMUST00000125446 4061 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 Dock10-209ENSMUST00000190983 6672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 Gm14935-201ENSMUST00000121528 1708 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 Gm4876-203ENSMUST00000139701 2225 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 Gm43876-201ENSMUST00000203831 3229 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 Amy2b-201ENSMUST00000120184 1577 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 Bglap3-202ENSMUST00000107542 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 Zc4h2-202ENSMUST00000119640 2075 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 Gm26861-201ENSMUST00000180807 5278 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 CAAA01119292.1-201ENSMUST00000226763 2766 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 Mir760-201ENSMUST00000103257 119 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 Gm11271-201ENSMUST00000116054 440 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 Gm14018-201ENSMUST00000119042 455 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 Gm14580-201ENSMUST00000119122 718 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 Gm15311-201ENSMUST00000119682 282 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 Gm15305-201ENSMUST00000120354 288 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 Pcnp-204ENSMUST00000122253 792 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 Gm12827-201ENSMUST00000132690 660 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 Gm12860-201ENSMUST00000148457 957 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 Gm5125-201ENSMUST00000148614 624 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 Gm24435-201ENSMUST00000157886 110 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 Gm22518-201ENSMUST00000158267 68 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 Gm25904-201ENSMUST00000158491 143 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 Gm16231-201ENSMUST00000160432 319 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 Gm20491-201ENSMUST00000173765 1241 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 Mir5110-201ENSMUST00000175537 87 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 Gm25244-201ENSMUST00000178089 132 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 7530428D23Rik-201ENSMUST00000191725 765 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 Gm44970-201ENSMUST00000206318 314 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 Gm9315-201ENSMUST00000222696 908 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 Gm6575-201ENSMUST00000222946 697 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 Gm7252-201ENSMUST00000223284 456 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 AC114572.1-201ENSMUST00000227262 300 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 AC154806.1-203ENSMUST00000227370 1032 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 Vmn1r41-205ENSMUST00000227630 827 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 AW822073-201ENSMUST00000075305 555 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 Tek-202ENSMUST00000073939 4549 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 Gm37855-201ENSMUST00000192571 3700 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 Gm34294-201ENSMUST00000191912 4263 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 Nfib-202ENSMUST00000064770 8429 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 Tmem232-202ENSMUST00000086722 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 Qsox2-202ENSMUST00000091263 4011 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 Olfr311-203ENSMUST00000216473 2961 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 Cdhr3-201ENSMUST00000095774 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 Olfr92-202ENSMUST00000214994 2073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 Gm44661-201ENSMUST00000208830 3503 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 Olfr1085-202ENSMUST00000213279 5191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 Celf1-207ENSMUST00000111452 7800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 Cltc-201ENSMUST00000060766 6163 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 Gramd1b-204ENSMUST00000121357 7334 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 C130089K02Rik-201ENSMUST00000194534 6960 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 Itpr1-205ENSMUST00000203615 9761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 Gm15813-201ENSMUST00000142286 2541 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 Ccr2-203ENSMUST00000168841 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 AC161884.1-201ENSMUST00000225436 2174 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 Crispld1-202ENSMUST00000159958 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 Ccdc83-202ENSMUST00000107220 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 Gm13416-201ENSMUST00000117264 1612 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 C030029H02Rik-202ENSMUST00000210356 2980 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 Stat4-201ENSMUST00000027277 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Actn1Q7TPR4 Trbv13-2-201ENSMUST00000103270 340 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Gm24473-201ENSMUST00000104483 131 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Gm4342-201ENSMUST00000118982 367 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Rpl21-ps9-201ENSMUST00000119897 482 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Gm16152-201ENSMUST00000131663 872 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 4930551O13Rik-201ENSMUST00000145585 1065 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Lrmda-203ENSMUST00000159777 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Gm3140-201ENSMUST00000163523 481 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Gm27998-201ENSMUST00000184902 361 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Actn1Q7TPR4 Gm29357-201ENSMUST00000186877 698 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms