Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Slc17a8-201ENSMUST00000020102 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7337-202ENSMUST00000181439 2655 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Phf6-202ENSMUST00000101587 3639 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Lilrb4a-201ENSMUST00000217706 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Slc2a2-201ENSMUST00000029240 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Lama2-201ENSMUST00000092639 9614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1426-207ENSMUST00000220005 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Zbtb38-201ENSMUST00000093798 4091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 Cep85l-204ENSMUST00000220376 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Ccdc88cQ6VGS5 RMST_1.1-210ENSMUST00000219606 2891 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn2r-ps133-201ENSMUST00000176979 2569 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9048-201ENSMUST00000177744 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9040-201ENSMUST00000177762 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9044-201ENSMUST00000179851 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9046-201ENSMUST00000218329 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12169-201ENSMUST00000109228 1065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm21719-201ENSMUST00000115940 693 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11920-201ENSMUST00000118491 563 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Rpl21-ps9-201ENSMUST00000119897 482 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14900-201ENSMUST00000120304 733 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14300-201ENSMUST00000120800 946 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11879-201ENSMUST00000121885 702 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12409-201ENSMUST00000147231 646 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26901-201ENSMUST00000181554 1193 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29160-201ENSMUST00000190094 699 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 1700066C05Rik-201ENSMUST00000191029 407 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37189-201ENSMUST00000192131 298 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37493-201ENSMUST00000193167 433 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 4933401H06Rik-201ENSMUST00000199058 827 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Klk1b10-ps-201ENSMUST00000205895 783 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45486-201ENSMUST00000211767 1109 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 AC160138.1-201ENSMUST00000217965 588 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 AC155929.4-201ENSMUST00000218493 491 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Klrb1a-201ENSMUST00000032512 1274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Krtap13-1-201ENSMUST00000060494 748 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Ptch1-202ENSMUST00000192155 7002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Cd209a-201ENSMUST00000012847 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm18409-201ENSMUST00000218988 2506 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 A930017M01Rik-201ENSMUST00000081361 2884 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Kcnmb2-205ENSMUST00000192429 2357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10309-201ENSMUST00000095186 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Cfap44-201ENSMUST00000099742 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Pi4ka-201ENSMUST00000036161 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Pramel4-203ENSMUST00000094520 2297 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Slamf7-202ENSMUST00000192024 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37255-201ENSMUST00000193302 3060 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6337-201ENSMUST00000168088 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Mapk10-205ENSMUST00000128869 2518 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Ccdc162-210ENSMUST00000189488 7260 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Cfhr2-201ENSMUST00000094489 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Ccdc191-203ENSMUST00000132859 3779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm20751-201ENSMUST00000210260 1270 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
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Ccdc88cQ6VGS5 Sptlc3-201ENSMUST00000047370 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1106-202ENSMUST00000213781 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1106-203ENSMUST00000217650 2573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29660-201ENSMUST00000185631 2166 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29309-201ENSMUST00000186251 2166 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29632-201ENSMUST00000190335 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28538-201ENSMUST00000190919 2166 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5431-203ENSMUST00000109212 3063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Lpp-201ENSMUST00000038053 15647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm35835-201ENSMUST00000214447 4589 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Cacna1e-203ENSMUST00000187541 14921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 E030032P16Rik-201ENSMUST00000198813 2931 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr716-204ENSMUST00000213367 3585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Slc17a4-201ENSMUST00000021769 1604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37234-201ENSMUST00000193259 1441 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Epb41l2-219ENSMUST00000220290 4345 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 D330045A20Rik-202ENSMUST00000113030 3736 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Igsf1-201ENSMUST00000033442 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9403-201ENSMUST00000196299 2181 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 4921539E11Rik-201ENSMUST00000030245 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Rps12-ps10-201ENSMUST00000117447 399 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Rps12-ps16-201ENSMUST00000118529 399 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6401-202ENSMUST00000164232 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm17079-201ENSMUST00000167231 666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Rps12-ps13-201ENSMUST00000178365 399 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Rps12-ps11-201ENSMUST00000178427 399 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Rps12-ps12-201ENSMUST00000179020 399 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Rps12-ps17-201ENSMUST00000179067 399 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Rps12-ps6-201ENSMUST00000179239 399 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Gm17048-201ENSMUST00000179266 847 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc88cQ6VGS5 Rps12-ps14-201ENSMUST00000179356 399 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
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