Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

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Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Gm5166-201ENSMUST00000121332 573 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Atp5l-ps2-201ENSMUST00000121382 314 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Gm12630-201ENSMUST00000121575 784 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Mir1907-201ENSMUST00000122509 90 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Gm15239-201ENSMUST00000150690 603 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Gm15063-201ENSMUST00000152648 895 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Gm12526-201ENSMUST00000154462 615 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Gm22820-201ENSMUST00000157205 329 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Gm26901-201ENSMUST00000181554 1193 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 6530403H02Rik-203ENSMUST00000183168 843 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Gm27152-201ENSMUST00000183828 99 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Gm28846-201ENSMUST00000189161 368 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Gm18943-201ENSMUST00000207357 1216 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Gm32983-201ENSMUST00000208500 505 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 AC122273.1-202ENSMUST00000213884 695 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 AC172194.1-201ENSMUST00000214246 1020 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Gm18871-201ENSMUST00000218655 745 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Fxyd4-201ENSMUST00000005114 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Olfr1491-201ENSMUST00000052737 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Gm24621-201ENSMUST00000082679 140 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Defb46-201ENSMUST00000095436 174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Olfr633-201ENSMUST00000098188 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Gm10773-201ENSMUST00000218071 3935 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Psg21-202ENSMUST00000182128 2066 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Uba1y-201ENSMUST00000115894 3981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 C87436-201ENSMUST00000050497 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Lhfpl3-201ENSMUST00000196406 2589 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Plch1-203ENSMUST00000084105 6245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Gm42630-201ENSMUST00000195908 3448 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 CT010453.1-201ENSMUST00000226795 2201 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Pole-201ENSMUST00000007296 7163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Slc17a3-204ENSMUST00000166467 4336 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Bbs12-201ENSMUST00000057975 2433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Zfp473-207ENSMUST00000149011 9230 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Gm4787-201ENSMUST00000062182 2474 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Atf2-205ENSMUST00000112010 4037 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Atf2-202ENSMUST00000090802 4016 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Hsf2-201ENSMUST00000079833 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 A2m-201ENSMUST00000032203 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Ttf1-201ENSMUST00000100237 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Cst8-202ENSMUST00000109947 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Tpm3-rs2-201ENSMUST00000116350 323 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Snord88a-201ENSMUST00000116723 90 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Gm4985-201ENSMUST00000118300 1233 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 0610043K17Rik-202ENSMUST00000142581 372 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Gm23968-201ENSMUST00000175047 125 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Gm5345-201ENSMUST00000183076 1014 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Gtpbp4-ps3-201ENSMUST00000184093 136 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Mir7033-201ENSMUST00000184259 81 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Mir6989-201ENSMUST00000184812 65 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Gm27804-201ENSMUST00000185135 119 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Gm29605-201ENSMUST00000190800 292 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 1700094M23Rik-201ENSMUST00000197695 695 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 4930513D17Rik-203ENSMUST00000202800 1159 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Gm34623-201ENSMUST00000210900 977 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Scp2-ps2-202ENSMUST00000213851 609 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 AC160962.1-202ENSMUST00000225859 1116 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 AC151730.1-201ENSMUST00000226106 448 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Sprr2b-201ENSMUST00000061038 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Scimp-201ENSMUST00000074572 617 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Gm26843-201ENSMUST00000212304 2859 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Mir99ahg-214ENSMUST00000183333 3422 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Gm20775-201ENSMUST00000100115 1851 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 AC130217.2-201ENSMUST00000224009 2990 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Slamf7-202ENSMUST00000192024 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Olfr1362-201ENSMUST00000051874 3045 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Gm43189-201ENSMUST00000196040 3069 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Fundc2-201ENSMUST00000033541 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Aass-201ENSMUST00000031707 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Gm3286-202ENSMUST00000200932 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Gm26742-201ENSMUST00000181829 3340 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Zfp790-202ENSMUST00000178162 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Cntn4-206ENSMUST00000113264 5262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Gm28798-201ENSMUST00000186372 2161 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Gm29091-201ENSMUST00000187289 2159 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Ifi207-201ENSMUST00000042610 3422 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Heatr1-201ENSMUST00000059270 6780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Ect2l-201ENSMUST00000095817 2900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Olfr675-202ENSMUST00000210113 3671 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Adgrv1-202ENSMUST00000109565 7094 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Nrk-202ENSMUST00000113052 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Zfp280d-203ENSMUST00000183410 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Gm15475-201ENSMUST00000137673 3757 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Trbv29-201ENSMUST00000103281 353 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Gm11077-201ENSMUST00000111844 84 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Gm14295-201ENSMUST00000118012 1213 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Gm12135-201ENSMUST00000119170 466 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Rps12-ps19-201ENSMUST00000119773 400 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Gm7113-201ENSMUST00000120477 958 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 M6pr-ps-201ENSMUST00000120481 830 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Gm5809-201ENSMUST00000121854 529 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Eif4e1b-203ENSMUST00000126785 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Gm16224-201ENSMUST00000127711 412 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Gm13598-201ENSMUST00000147939 625 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Gm27159-201ENSMUST00000185132 432 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Gm28289-201ENSMUST00000189331 315 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Gm44265-201ENSMUST00000203631 465 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Gm44856-201ENSMUST00000206639 304 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 1810049I09Rik-202ENSMUST00000206760 556 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Usp49Q6P9L4 Mobp-206ENSMUST00000214943 435 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
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