Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Gm43557-201ENSMUST00000197100 2370 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
E130208F15RikQ3UPV3 Tpx2-207ENSMUST00000178997 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
E130208F15RikQ3UPV3 Kpna2-201ENSMUST00000018506 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
E130208F15RikQ3UPV3 Vmn1r35-203ENSMUST00000227354 2319 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
E130208F15RikQ3UPV3 Arl5b-201ENSMUST00000017562 6933 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
E130208F15RikQ3UPV3 Mir674-201ENSMUST00000102421 100 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
E130208F15RikQ3UPV3 Igkv12-38-201ENSMUST00000103371 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
E130208F15RikQ3UPV3 Ighv12-3-201ENSMUST00000103485 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
E130208F15RikQ3UPV3 Iglc2-201ENSMUST00000103749 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
E130208F15RikQ3UPV3 Tpm3-rs2-201ENSMUST00000116350 323 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
E130208F15RikQ3UPV3 Tex35-203ENSMUST00000119526 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
E130208F15RikQ3UPV3 Rps13-ps6-201ENSMUST00000120038 428 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
E130208F15RikQ3UPV3 Gm4992-201ENSMUST00000120256 768 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11689-201ENSMUST00000120766 302 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
E130208F15RikQ3UPV3 Gm4886-201ENSMUST00000121874 1176 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
E130208F15RikQ3UPV3 Gm35202-201ENSMUST00000130083 712 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
E130208F15RikQ3UPV3 Gm24781-201ENSMUST00000157636 117 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
E130208F15RikQ3UPV3 Tnfsf10-202ENSMUST00000174840 989 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
E130208F15RikQ3UPV3 Gm20691-201ENSMUST00000176889 333 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
E130208F15RikQ3UPV3 Esd-209ENSMUST00000177181 835 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
E130208F15RikQ3UPV3 Gm8609-201ENSMUST00000182967 998 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
E130208F15RikQ3UPV3 Stpg4-203ENSMUST00000187078 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
E130208F15RikQ3UPV3 Gm28443-201ENSMUST00000189081 698 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
E130208F15RikQ3UPV3 Gm28289-201ENSMUST00000189331 315 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10640-202ENSMUST00000190947 1134 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
E130208F15RikQ3UPV3 Gm37493-201ENSMUST00000193167 433 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
E130208F15RikQ3UPV3 Gm2453-201ENSMUST00000193383 357 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
E130208F15RikQ3UPV3 Gm38232-201ENSMUST00000193602 411 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
E130208F15RikQ3UPV3 Gm17895-201ENSMUST00000194028 874 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
E130208F15RikQ3UPV3 Gm37285-201ENSMUST00000194465 1139 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
E130208F15RikQ3UPV3 Gm37637-201ENSMUST00000195540 1256 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
E130208F15RikQ3UPV3 4930597L12Rik-201ENSMUST00000196286 911 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
E130208F15RikQ3UPV3 Gm34144-201ENSMUST00000197039 259 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
E130208F15RikQ3UPV3 Gm42443-201ENSMUST00000198084 1155 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
E130208F15RikQ3UPV3 Gm21054-201ENSMUST00000203981 380 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
E130208F15RikQ3UPV3 Helt-202ENSMUST00000210652 1282 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
E130208F15RikQ3UPV3 AL603745.1-201ENSMUST00000215473 532 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
E130208F15RikQ3UPV3 Akr1c13-201ENSMUST00000021634 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
E130208F15RikQ3UPV3 CT030170.6-203ENSMUST00000222523 1295 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
E130208F15RikQ3UPV3 AC123656.1-201ENSMUST00000227121 581 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
E130208F15RikQ3UPV3 AC102676.1-201ENSMUST00000228131 719 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
E130208F15RikQ3UPV3 Vmn1r53-201ENSMUST00000076086 1122 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
E130208F15RikQ3UPV3 Cldn34b2-201ENSMUST00000076671 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr66-201ENSMUST00000079117 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr1129-201ENSMUST00000081034 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp825-203ENSMUST00000221173 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
E130208F15RikQ3UPV3 Zdhhc17-201ENSMUST00000041723 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
E130208F15RikQ3UPV3 Acpp-201ENSMUST00000062723 4483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
E130208F15RikQ3UPV3 Gm37595-201ENSMUST00000192668 1742 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
E130208F15RikQ3UPV3 Pcdh15-237ENSMUST00000193361 7881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
E130208F15RikQ3UPV3 Gla-201ENSMUST00000033621 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
E130208F15RikQ3UPV3 Gramd1b-204ENSMUST00000121357 7334 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr1215-202ENSMUST00000214809 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
E130208F15RikQ3UPV3 Fam205a4-201ENSMUST00000108026 4130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
E130208F15RikQ3UPV3 Alpk2-201ENSMUST00000035548 7249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
E130208F15RikQ3UPV3 Otub2-205ENSMUST00000179684 2890 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
E130208F15RikQ3UPV3 Vmn1r40-205ENSMUST00000228642 2862 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
E130208F15RikQ3UPV3 Psd3-202ENSMUST00000059374 2876 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
E130208F15RikQ3UPV3 Spata31d1d-201ENSMUST00000052978 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
E130208F15RikQ3UPV3 Gm43577-201ENSMUST00000197090 3344 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
E130208F15RikQ3UPV3 Fbln5-203ENSMUST00000222587 2371 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
E130208F15RikQ3UPV3 Clrn3-201ENSMUST00000053716 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr259-202ENSMUST00000213978 4046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr259-204ENSMUST00000216088 4023 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
E130208F15RikQ3UPV3 Kcnc2-202ENSMUST00000218445 4033 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
E130208F15RikQ3UPV3 Krt222-202ENSMUST00000103132 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
E130208F15RikQ3UPV3 Cacnb4-203ENSMUST00000102761 8039 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
E130208F15RikQ3UPV3 Cyld-202ENSMUST00000098519 7954 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45949-201ENSMUST00000221550 1895 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
E130208F15RikQ3UPV3 Gm38322-201ENSMUST00000194074 2300 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
E130208F15RikQ3UPV3 Vmn1r220-202ENSMUST00000226651 6252 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
E130208F15RikQ3UPV3 4933421A08Rik-201ENSMUST00000135313 1638 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45061-201ENSMUST00000204395 2095 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
E130208F15RikQ3UPV3 AC160028.2-201ENSMUST00000218937 2519 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
E130208F15RikQ3UPV3 Vmn1r86-203ENSMUST00000227220 6445 ntAPPRIS P2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
E130208F15RikQ3UPV3 Lctl-202ENSMUST00000118215 1380 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
E130208F15RikQ3UPV3 Bmi1-202ENSMUST00000051929 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
E130208F15RikQ3UPV3 Pde10a-208ENSMUST00000115724 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
E130208F15RikQ3UPV3 Lcp1-209ENSMUST00000145303 3841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
E130208F15RikQ3UPV3 Sytl2-206ENSMUST00000190731 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr3-202ENSMUST00000213988 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
E130208F15RikQ3UPV3 Celf1-207ENSMUST00000111452 7800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
E130208F15RikQ3UPV3 Gm30570-201ENSMUST00000213553 2651 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
E130208F15RikQ3UPV3 CT010453.1-201ENSMUST00000226795 2201 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
E130208F15RikQ3UPV3 Lrtm1-201ENSMUST00000055662 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
E130208F15RikQ3UPV3 Cd180-204ENSMUST00000171267 1787 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
E130208F15RikQ3UPV3 Rrh-201ENSMUST00000029648 1506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
E130208F15RikQ3UPV3 C3ar1-201ENSMUST00000042081 4305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
E130208F15RikQ3UPV3 Efcab14-201ENSMUST00000074425 4300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
E130208F15RikQ3UPV3 Cep112-202ENSMUST00000106715 1161 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
E130208F15RikQ3UPV3 Sult2a7-201ENSMUST00000108524 897 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13983-201ENSMUST00000118018 865 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
E130208F15RikQ3UPV3 Gm4985-201ENSMUST00000118300 1233 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
E130208F15RikQ3UPV3 Gm14870-201ENSMUST00000118414 156 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15349-201ENSMUST00000121154 204 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5166-201ENSMUST00000121332 573 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15932-201ENSMUST00000135068 535 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13982-201ENSMUST00000138372 755 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11962-201ENSMUST00000145746 255 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
E130208F15RikQ3UPV3 4930405H06Rik-201ENSMUST00000159244 791 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 134.6 ms