Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Trpm3-204ENSMUST00000099564 3653 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Rnf149Q3U2C5 Tmem182-201ENSMUST00000114765 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Rnf149Q3U2C5 Abi1-205ENSMUST00000123948 3067 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Rnf149Q3U2C5 1700011H14Rik-205ENSMUST00000228936 3444 ntAPPRIS P2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
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Rnf149Q3U2C5 Btbd35f9-201ENSMUST00000178219 1497 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Rnf149Q3U2C5 Btbd35f22-201ENSMUST00000178747 1497 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
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Rnf149Q3U2C5 Btbd35f29-201ENSMUST00000179532 1497 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
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Rnf149Q3U2C5 Cxcr4-201ENSMUST00000052172 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
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Rnf149Q3U2C5 Ranbp17-201ENSMUST00000037522 3950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
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Rnf149Q3U2C5 1700054M17Rik-201ENSMUST00000125654 445 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
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Rnf149Q3U2C5 Stau2-209ENSMUST00000145092 564 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Rnf149Q3U2C5 Mir1930-201ENSMUST00000158799 84 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Rnf149Q3U2C5 Bud31-201ENSMUST00000159018 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Rnf149Q3U2C5 Gm8715-201ENSMUST00000162728 531 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Rnf149Q3U2C5 Gm15734-201ENSMUST00000163076 1040 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
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Rnf149Q3U2C5 Gm28425-202ENSMUST00000191542 621 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Rnf149Q3U2C5 Gm38204-201ENSMUST00000194835 619 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
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Rnf149Q3U2C5 Ppargc1a-203ENSMUST00000132734 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
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Rnf149Q3U2C5 Ctage5-217ENSMUST00000176892 2784 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rnf149Q3U2C5 Sp110-201ENSMUST00000093508 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rnf149Q3U2C5 Spire1-202ENSMUST00000082243 4950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rnf149Q3U2C5 Adipor2-201ENSMUST00000032272 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rnf149Q3U2C5 Clca3b-201ENSMUST00000159989 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
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Rnf149Q3U2C5 Pramef12os-201ENSMUST00000133334 767 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
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Rnf149Q3U2C5 2810442N19Rik-202ENSMUST00000161583 919 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
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Rnf149Q3U2C5 Mir6241-201ENSMUST00000184225 103 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Rnf149Q3U2C5 Rpl31-206ENSMUST00000195123 356 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
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Rnf149Q3U2C5 Gm2221-201ENSMUST00000209342 418 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Rnf149Q3U2C5 Gm45725-201ENSMUST00000212962 337 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Rnf149Q3U2C5 4930555G07Rik-201ENSMUST00000218226 634 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Rnf149Q3U2C5 AC155709.1-201ENSMUST00000218794 162 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Rnf149Q3U2C5 AC155834.1-201ENSMUST00000220033 498 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Rnf149Q3U2C5 AC117769.2-201ENSMUST00000224612 469 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
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