Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Ctage5-209ENSMUST00000175912 2885 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 9530086O07Rik-201ENSMUST00000203503 2685 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Olfr432-203ENSMUST00000213381 4533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm11504-201ENSMUST00000120211 173 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm16726-201ENSMUST00000130184 892 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 4933411O13Rik-203ENSMUST00000146849 607 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm11335-201ENSMUST00000148743 1080 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Rian-203ENSMUST00000181527 989 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm26901-201ENSMUST00000181554 1193 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm27782-201ENSMUST00000185059 199 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm29483-201ENSMUST00000188188 1078 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm29605-201ENSMUST00000190800 292 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm37152-201ENSMUST00000193369 1175 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm17895-201ENSMUST00000194028 874 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm8454-201ENSMUST00000196980 811 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm43538-201ENSMUST00000200416 849 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm7452-201ENSMUST00000200764 788 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Vmn1r53-201ENSMUST00000076086 1122 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Olfr417-202ENSMUST00000217962 5662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Sytl4-203ENSMUST00000113297 3306 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm14245-201ENSMUST00000118939 1843 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Ms4a4c-201ENSMUST00000072729 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Galnt5-203ENSMUST00000166729 3812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Acpp-201ENSMUST00000062723 4483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Adgrl2-215ENSMUST00000199750 4399 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 4933405O20Rik-201ENSMUST00000119710 1341 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Ntrk3-202ENSMUST00000039438 3977 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Aox3-201ENSMUST00000040999 4606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm1141-201ENSMUST00000101495 2147 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Mapk10-203ENSMUST00000112847 7196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Lmbrd2-204ENSMUST00000227556 8099 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Olfr398-202ENSMUST00000117510 5135 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Stk36-203ENSMUST00000113694 629 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm22710-201ENSMUST00000116892 125 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm11976-201ENSMUST00000119236 295 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm5387-201ENSMUST00000119776 857 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm14614-201ENSMUST00000119873 384 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm4992-201ENSMUST00000120256 768 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm22276-201ENSMUST00000122469 129 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Ttc39aos1-201ENSMUST00000150239 796 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Nudt12os-202ENSMUST00000152750 849 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm25550-201ENSMUST00000158079 128 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Vmn1r29-201ENSMUST00000168416 1023 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Mir3473e-201ENSMUST00000183932 110 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 2310043O21Rik-201ENSMUST00000185323 622 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm43120-201ENSMUST00000196228 667 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm33651-201ENSMUST00000200405 456 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm16571-202ENSMUST00000203839 585 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm44896-201ENSMUST00000206190 772 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm40685-201ENSMUST00000217861 580 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Nup43-201ENSMUST00000040135 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm5436-201ENSMUST00000058103 643 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Lrrc51-201ENSMUST00000078448 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Gtsf1l-201ENSMUST00000094653 822 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm28431-201ENSMUST00000185592 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm28681-201ENSMUST00000187387 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Dlgap5-208ENSMUST00000180299 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Fam49a-202ENSMUST00000069066 9452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Adgrg6-203ENSMUST00000208429 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 9430053O09Rik-201ENSMUST00000192654 2570 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Mat2a-201ENSMUST00000059472 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm16325-201ENSMUST00000141199 3174 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Olfr802-202ENSMUST00000203785 5535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Erbin-203ENSMUST00000091269 6224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 U2surp-209ENSMUST00000217176 3111 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm40518-202ENSMUST00000214538 4080 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Slf1-201ENSMUST00000151524 3747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Plch1-203ENSMUST00000084105 6245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 AC124414.1-201ENSMUST00000218033 2946 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 AC107742.1-201ENSMUST00000227769 1390 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Hormad1-201ENSMUST00000029754 1385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm43189-201ENSMUST00000196040 3069 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Nrk-202ENSMUST00000113052 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Spire1-201ENSMUST00000045105 5033 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 AC121793.2-201ENSMUST00000217127 2728 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Krtap9-5-201ENSMUST00000105052 1077 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm7821-201ENSMUST00000117111 788 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm12937-201ENSMUST00000118333 448 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm6987-201ENSMUST00000119319 428 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Chchd7-204ENSMUST00000119403 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm13444-201ENSMUST00000119445 522 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm12101-201ENSMUST00000121590 390 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm12540-201ENSMUST00000121938 319 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm12175-201ENSMUST00000122081 345 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 2210411M09Rik-201ENSMUST00000128545 643 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm10130-201ENSMUST00000133235 303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm15527-201ENSMUST00000138259 858 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 1700027A07Rik-201ENSMUST00000150472 458 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Gtsf1-209ENSMUST00000153930 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm26037-201ENSMUST00000158150 311 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm25435-201ENSMUST00000158277 267 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 1110038B12Rik-201ENSMUST00000172501 579 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Ighv2-6-201ENSMUST00000179657 350 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm19480-201ENSMUST00000185547 667 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm29529-201ENSMUST00000187154 714 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm29650-201ENSMUST00000188485 742 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm18849-201ENSMUST00000189861 560 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Gm37621-201ENSMUST00000194716 5531 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 AC136376.1-201ENSMUST00000228496 950 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1386-201ENSMUST00000071905 1128 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
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