Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Elovl2-201ENSMUST00000021793 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rpusd3Q14AI6 Gm10280-201ENSMUST00000212238 2006 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rpusd3Q14AI6 Csnk1g1-213ENSMUST00000206528 1740 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rpusd3Q14AI6 Gm37234-201ENSMUST00000193259 1441 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Rpusd3Q14AI6 Akr1c20-202ENSMUST00000080361 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Rpusd3Q14AI6 Zbed4-ps2-201ENSMUST00000187003 3448 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Rpusd3Q14AI6 Lrrtm4-208ENSMUST00000147663 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rpusd3Q14AI6 Gm45297-201ENSMUST00000209893 3483 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Rpusd3Q14AI6 Gm29021-201ENSMUST00000185451 1498 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rpusd3Q14AI6 Gm29071-201ENSMUST00000185729 1488 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rpusd3Q14AI6 Gm28799-201ENSMUST00000186506 1498 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rpusd3Q14AI6 Gm28663-201ENSMUST00000186567 1498 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rpusd3Q14AI6 Gm28470-201ENSMUST00000186912 1498 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rpusd3Q14AI6 Gm28971-201ENSMUST00000187506 1498 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rpusd3Q14AI6 Gm28733-202ENSMUST00000187597 1498 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rpusd3Q14AI6 Gm28820-201ENSMUST00000188530 1498 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rpusd3Q14AI6 Gm29606-202ENSMUST00000188564 1498 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
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Rpusd3Q14AI6 Gm28152-201ENSMUST00000188694 1498 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rpusd3Q14AI6 Gm28771-202ENSMUST00000189399 1499 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
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Rpusd3Q14AI6 Gm29122-203ENSMUST00000189609 1498 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rpusd3Q14AI6 Gm28613-201ENSMUST00000189627 1498 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rpusd3Q14AI6 Gm28816-202ENSMUST00000189686 1498 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rpusd3Q14AI6 Gm29584-202ENSMUST00000190181 1498 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
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Rpusd3Q14AI6 Gm28124-202ENSMUST00000191099 1498 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rpusd3Q14AI6 Gm29217-202ENSMUST00000191270 1498 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rpusd3Q14AI6 Gm28332-203ENSMUST00000191389 1498 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rpusd3Q14AI6 Gm37346-201ENSMUST00000191665 1498 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rpusd3Q14AI6 Gm37454-202ENSMUST00000193918 1498 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rpusd3Q14AI6 Gm38371-202ENSMUST00000193996 1498 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rpusd3Q14AI6 Gm37434-203ENSMUST00000194239 1498 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rpusd3Q14AI6 Gm37840-202ENSMUST00000194805 1498 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rpusd3Q14AI6 Gm37687-203ENSMUST00000195020 1498 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rpusd3Q14AI6 Gm37071-203ENSMUST00000195814 1498 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rpusd3Q14AI6 Ncr1-201ENSMUST00000006792 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rpusd3Q14AI6 Them5-202ENSMUST00000198083 1378 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rpusd3Q14AI6 Gm30849-201ENSMUST00000214503 1379 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rpusd3Q14AI6 Gimap9-201ENSMUST00000054050 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rpusd3Q14AI6 Cx3cr1-202ENSMUST00000177637 3156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rpusd3Q14AI6 Mir697-201ENSMUST00000102316 109 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Rpusd3Q14AI6 Gm13030-201ENSMUST00000105805 655 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
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Rpusd3Q14AI6 Gm11903-201ENSMUST00000118958 727 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Rpusd3Q14AI6 Gm15316-201ENSMUST00000121082 421 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Rpusd3Q14AI6 Amy2-ps1-201ENSMUST00000122117 1117 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Rpusd3Q14AI6 Gm12525-201ENSMUST00000125412 554 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rpusd3Q14AI6 Gm14764-201ENSMUST00000147130 313 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rpusd3Q14AI6 Gm12031-201ENSMUST00000156150 627 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rpusd3Q14AI6 Gm24735-201ENSMUST00000158859 118 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Rpusd3Q14AI6 Gm16113-201ENSMUST00000159629 372 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Rpusd3Q14AI6 Gm8715-201ENSMUST00000162728 531 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Rpusd3Q14AI6 Obox3-204ENSMUST00000173912 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
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Rpusd3Q14AI6 Gm4956-202ENSMUST00000178869 672 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
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Rpusd3Q14AI6 4930471E15Rik-201ENSMUST00000221147 626 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rpusd3Q14AI6 CT030705.2-201ENSMUST00000225301 556 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
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Rpusd3Q14AI6 Ceacam14-201ENSMUST00000023953 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rpusd3Q14AI6 Scp2d1-201ENSMUST00000028918 760 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rpusd3Q14AI6 Olfr862-201ENSMUST00000073765 1035 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rpusd3Q14AI6 3110018I06Rik-201ENSMUST00000082269 1005 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rpusd3Q14AI6 Gm7731-201ENSMUST00000091759 470 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Rpusd3Q14AI6 Olfr653-201ENSMUST00000098174 1046 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rpusd3Q14AI6 Dclre1c-201ENSMUST00000061852 7075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rpusd3Q14AI6 Ros1-202ENSMUST00000218452 6960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rpusd3Q14AI6 Gm28320-201ENSMUST00000187777 2273 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Rpusd3Q14AI6 Slc25a40-202ENSMUST00000170496 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rpusd3Q14AI6 9930111J21Rik2-201ENSMUST00000093152 2403 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rpusd3Q14AI6 9930111J21Rik1-201ENSMUST00000093153 2403 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rpusd3Q14AI6 Eif4a2-203ENSMUST00000115341 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rpusd3Q14AI6 Gm30382-203ENSMUST00000199503 1858 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rpusd3Q14AI6 Olfr97-205ENSMUST00000214848 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rpusd3Q14AI6 AC153501.1-201ENSMUST00000218156 1860 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rpusd3Q14AI6 Etv1-202ENSMUST00000159334 3981 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rpusd3Q14AI6 Il12a-201ENSMUST00000029345 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rpusd3Q14AI6 Gm10475-201ENSMUST00000084713 1796 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Rpusd3Q14AI6 Arsk-201ENSMUST00000120573 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Rpusd3Q14AI6 Zwint-202ENSMUST00000105431 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Rpusd3Q14AI6 Trrap-201ENSMUST00000038980 12344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Rpusd3Q14AI6 Rfx4-203ENSMUST00000095388 3274 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Rpusd3Q14AI6 Gm6602-201ENSMUST00000198910 1927 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Rpusd3Q14AI6 Zfp935-204ENSMUST00000223247 1949 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
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