Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Cfhr2-202ENSMUST00000194186 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Gm44112-201ENSMUST00000204787 372 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 E230032D23Rik-201ENSMUST00000207189 848 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Gm19092-201ENSMUST00000209036 969 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Gm38430-201ENSMUST00000209888 1240 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 AC102582.2-201ENSMUST00000214658 1137 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 CT030657.2-201ENSMUST00000220710 792 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 AC116591.1-201ENSMUST00000227919 351 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Prl3d3-201ENSMUST00000073601 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Olfr1129-201ENSMUST00000081034 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Cdc42bpa-202ENSMUST00000097450 5160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Gm29198-201ENSMUST00000190102 1512 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Mttp-201ENSMUST00000029805 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 RMST_1.1-210ENSMUST00000219606 2891 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Olfr1220-203ENSMUST00000213288 4223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Gm38082-201ENSMUST00000192800 6882 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Trappc8-206ENSMUST00000225661 5191 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Itch-202ENSMUST00000109685 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 9430053O09Rik-201ENSMUST00000192654 2570 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Zranb3-203ENSMUST00000112538 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Pcdh15-204ENSMUST00000105426 6802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Rbmy-201ENSMUST00000100360 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Gm10256-202ENSMUST00000188114 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Gm21708-203ENSMUST00000190283 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Kcnc2-202ENSMUST00000218445 4033 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Tgif1-211ENSMUST00000186358 1455 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Ugt2b38-201ENSMUST00000072818 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Pcsk1-201ENSMUST00000022075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Abcc9-201ENSMUST00000073173 7433 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Gm43176-201ENSMUST00000199653 2989 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Rabgap1l-202ENSMUST00000028052 6338 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Vmn1r188-202ENSMUST00000226680 8374 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Igkv12-38-201ENSMUST00000103371 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Fxyd1-203ENSMUST00000108110 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Rps12-ps7-201ENSMUST00000117169 385 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Gm4985-201ENSMUST00000118300 1233 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Gm11976-201ENSMUST00000119236 295 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Gm13604-201ENSMUST00000119332 482 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Gm16224-201ENSMUST00000127711 412 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Gm11657-201ENSMUST00000137175 337 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Gm16196-201ENSMUST00000137730 464 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Gm25395-201ENSMUST00000157343 272 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Gm22094-201ENSMUST00000158976 117 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Pid1-205ENSMUST00000176720 450 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Rian-203ENSMUST00000181527 989 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Gm27295-201ENSMUST00000184264 153 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Gm21292-202ENSMUST00000190329 1225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 1110002O04Rik-201ENSMUST00000194261 566 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Gm9517-201ENSMUST00000195021 874 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Gm43546-201ENSMUST00000196721 943 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Igkv4-77-201ENSMUST00000199410 352 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Gm19590-201ENSMUST00000201551 1195 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Gm43599-201ENSMUST00000202680 528 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Gm42713-201ENSMUST00000202709 945 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Gm45136-201ENSMUST00000205793 943 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Gm45181-201ENSMUST00000207878 449 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Gm45394-201ENSMUST00000209240 1175 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Gm4042-201ENSMUST00000216946 637 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Olfr1500-206ENSMUST00000217079 1025 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 AC161275.1-201ENSMUST00000224668 208 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 AC132260.1-201ENSMUST00000225499 734 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 CT030238.3-201ENSMUST00000227352 875 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Scimp-201ENSMUST00000074572 617 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Klra2-202ENSMUST00000088867 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Cfap54-211ENSMUST00000212902 9516 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Bivm-201ENSMUST00000035991 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Gm20655-202ENSMUST00000181428 2946 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Ank3-240ENSMUST00000183169 6870 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Gm43864-201ENSMUST00000204452 4028 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Gm44889-203ENSMUST00000208346 1589 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Gm38077-201ENSMUST00000193657 3245 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Gbp10-201ENSMUST00000065588 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Fundc2-201ENSMUST00000033541 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Gm136-201ENSMUST00000095129 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 AC139754.2-201ENSMUST00000218037 1455 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Gm17094-201ENSMUST00000169881 3334 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Acpp-201ENSMUST00000062723 4483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Cavin4-201ENSMUST00000030033 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Rbms3-205ENSMUST00000111772 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Tnik-206ENSMUST00000160518 3996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Ndst3-201ENSMUST00000029602 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Alkbh8-202ENSMUST00000165105 2256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Gm38156-201ENSMUST00000194601 2260 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Gm22256-201ENSMUST00000102291 107 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Trappc1-202ENSMUST00000102601 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Rpl31-ps10-201ENSMUST00000116034 378 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Gm22710-201ENSMUST00000116892 125 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Gm14631-201ENSMUST00000119067 594 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Rpl31-ps11-201ENSMUST00000119898 377 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Rpl31-ps12-201ENSMUST00000119957 375 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Gm13735-201ENSMUST00000120217 670 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Gm9359-201ENSMUST00000163721 1221 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Gm6611-201ENSMUST00000163830 1272 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Gm6401-202ENSMUST00000164232 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Gm24157-201ENSMUST00000175265 111 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Obox4-ps31-201ENSMUST00000177210 1137 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Elmo1-202ENSMUST00000180626 2020 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 4930532G15Rik-201ENSMUST00000180632 699 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Rpl31-ps8-201ENSMUST00000181935 378 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Ttc39dQ0VF76 Gm37380-201ENSMUST00000193752 397 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms