Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Stra6l-201ENSMUST00000030011 3606 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 Dmtf1-202ENSMUST00000095017 3498 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 E330035G20Rik-202ENSMUST00000223323 3578 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 Igkv6-23-201ENSMUST00000103386 369 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 Gm13641-201ENSMUST00000117993 473 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 Gm11624-201ENSMUST00000118579 1041 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 Gm12181-201ENSMUST00000121448 531 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 Gm25906-201ENSMUST00000158489 126 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 Gm16139-201ENSMUST00000160015 420 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 Rpap3-ps1-201ENSMUST00000190928 454 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 Gpr19-210ENSMUST00000203762 498 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 Tmem45b-204ENSMUST00000217007 783 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 Nsd2-204ENSMUST00000114397 5738 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 Als2cr12-203ENSMUST00000188772 1382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 AC156645.1-201ENSMUST00000223066 5194 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 Pnpla8-202ENSMUST00000122902 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 AC121793.2-201ENSMUST00000217127 2728 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 Ddx6-201ENSMUST00000170489 6065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 Trim30b-204ENSMUST00000164410 3042 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 Pan2-203ENSMUST00000218315 4379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 Ano3-201ENSMUST00000099623 6705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 Clec2g-201ENSMUST00000000254 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 Adgrl3-206ENSMUST00000118034 4947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 Kif9-203ENSMUST00000197248 3184 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 Zfp941-202ENSMUST00000106052 3851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 Cyfip1-202ENSMUST00000085255 4195 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 Il1f9-201ENSMUST00000057567 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 Nrk-201ENSMUST00000064937 6604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 Ganab-201ENSMUST00000096246 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 AC132596.1-201ENSMUST00000223043 2263 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 Olfr1189-202ENSMUST00000213679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 Gm31410-201ENSMUST00000217302 4048 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 Lrrc72-202ENSMUST00000122115 934 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 Gm16269-201ENSMUST00000160532 409 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 Mup7-203ENSMUST00000166098 1033 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 Gm8604-201ENSMUST00000183150 965 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 Mir6952-201ENSMUST00000185092 61 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 Gm2453-201ENSMUST00000193383 357 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 Gm44312-201ENSMUST00000203536 469 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 Gm44105-201ENSMUST00000204401 308 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 4930553I21Rik-201ENSMUST00000214016 580 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 Mrpl42-203ENSMUST00000218893 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 CT025667.1-201ENSMUST00000225872 382 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 AC159979.1-201ENSMUST00000227927 342 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 Olfr726-201ENSMUST00000072370 966 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 Mup4-201ENSMUST00000075973 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 Olfr777-201ENSMUST00000080313 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 Mup13-202ENSMUST00000098042 984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 Alkbh8-201ENSMUST00000053407 3603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 Nsun6-202ENSMUST00000076435 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 Gm16142-201ENSMUST00000130584 2850 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 Olfr118-202ENSMUST00000215811 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 Olfr180-203ENSMUST00000206168 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 Olfr551-202ENSMUST00000213540 5440 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 Zfp14-203ENSMUST00000207873 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 Tfap2b-201ENSMUST00000027059 5863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 Sdk2-201ENSMUST00000041627 11287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 Ehf-202ENSMUST00000111174 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 Slc15a2-208ENSMUST00000165531 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 Tpp1-201ENSMUST00000033184 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 Adgrl3-205ENSMUST00000117985 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 Adgrl3-212ENSMUST00000120144 4999 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 Gm39566-201ENSMUST00000210714 3908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 Zfp652-202ENSMUST00000107717 10433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 Gm10280-201ENSMUST00000212238 2006 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 AC159308.1-201ENSMUST00000216615 1351 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 Ssr1-201ENSMUST00000021864 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 Gm36930-201ENSMUST00000195431 2376 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 Gm16074-201ENSMUST00000119524 444 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 Gm16208-201ENSMUST00000128476 471 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 Gm20738-201ENSMUST00000177666 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 Gm20823-201ENSMUST00000179949 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 Gm20865-202ENSMUST00000181163 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 Gm29049-201ENSMUST00000185705 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 Gm20816-202ENSMUST00000187846 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 Gm20809-202ENSMUST00000187943 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 Gm21728-201ENSMUST00000188442 695 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 Gm21889-201ENSMUST00000188487 695 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 Gm20932-201ENSMUST00000189115 694 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 Gm21920-201ENSMUST00000190042 695 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 Gm28171-201ENSMUST00000190100 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 Gm20867-202ENSMUST00000190987 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 Gm37375-201ENSMUST00000193859 387 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 Gm37385-201ENSMUST00000195223 387 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 Gm8929-201ENSMUST00000197781 1132 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 Gm43798-201ENSMUST00000202056 394 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 Gm45473-201ENSMUST00000211452 616 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 Gm3942-201ENSMUST00000218495 666 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 CT030254.1-201ENSMUST00000225450 1078 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 Stxbp3-ps-201ENSMUST00000090527 758 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 Cd36-202ENSMUST00000165232 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 U2surp-201ENSMUST00000078374 3520 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 Ect2l-204ENSMUST00000208948 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 Inpp5f-203ENSMUST00000118605 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 Gm38077-201ENSMUST00000193657 3245 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 Ctage5-217ENSMUST00000176892 2784 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 Pld1-202ENSMUST00000120834 4849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 Gm37735-201ENSMUST00000193995 1406 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 Tardbp-202ENSMUST00000084125 7477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Top2aQ01320 Nav2-216ENSMUST00000184945 10665 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms