Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Gm9575-201ENSMUST00000122140 1339 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Ighv12-3-201ENSMUST00000103485 353 ntAPPRIS P1 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Gm25760-201ENSMUST00000103989 132 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Zfp973-201ENSMUST00000108985 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Gm6382-201ENSMUST00000118873 942 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Gm12243-201ENSMUST00000128521 821 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Gm35202-201ENSMUST00000130083 712 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Gm10130-201ENSMUST00000133235 303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Gm15527-201ENSMUST00000138259 858 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Gad1os-201ENSMUST00000151851 889 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 4430402I18Rik-206ENSMUST00000164777 1066 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Gm8922-201ENSMUST00000170057 1167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Gm26910-201ENSMUST00000180450 698 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Gm8609-201ENSMUST00000182967 998 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Gm27299-201ENSMUST00000184593 103 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Scgb1b16-ps-201ENSMUST00000186029 275 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 1700028B04Rik-201ENSMUST00000186274 555 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Scgb1b14-ps-201ENSMUST00000188286 275 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Gm28289-201ENSMUST00000189331 315 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Ighv1-21-201ENSMUST00000194856 351 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Gm42464-202ENSMUST00000198111 774 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Gm45693-201ENSMUST00000211391 1157 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Gm7769-201ENSMUST00000212900 933 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Gm35454-202ENSMUST00000214817 1101 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Gm36278-201ENSMUST00000217030 918 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Erh-204ENSMUST00000218364 665 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 AC132260.1-201ENSMUST00000225499 734 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Vmn1r30-201ENSMUST00000078890 1053 ntAPPRIS P1 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 n-R5s217-201ENSMUST00000083341 116 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Itih5-201ENSMUST00000026886 7900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Slf1-201ENSMUST00000151524 3747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Sema6d-205ENSMUST00000103238 3165 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Mlh3-203ENSMUST00000220854 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Gm42613-201ENSMUST00000199975 1931 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 AC155243.1-201ENSMUST00000220141 2262 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Gm5454-201ENSMUST00000052030 1453 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Colec10-201ENSMUST00000036737 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 9930111J21Rik2-202ENSMUST00000101295 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Pdzph1-201ENSMUST00000025064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Wdr76-201ENSMUST00000028676 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Gm44763-201ENSMUST00000208287 2019 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 CT009480.2-201ENSMUST00000225152 3369 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Vmn2r96-201ENSMUST00000165692 2343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Nr1h5-202ENSMUST00000196135 1344 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Olfr702-201ENSMUST00000080899 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 C2cd3-201ENSMUST00000051777 7803 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Igkv5-43-201ENSMUST00000103368 379 ntAPPRIS P1 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Apc-ps1-201ENSMUST00000119356 470 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Vmn1r207-ps-201ENSMUST00000119931 1073 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Gm11504-201ENSMUST00000120211 173 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Gm5578-201ENSMUST00000121490 1236 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Gm11787-201ENSMUST00000121996 1050 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Gm13982-201ENSMUST00000138372 755 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Gm10364-202ENSMUST00000153034 1001 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Pantr1-203ENSMUST00000176154 514 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Ms4a12-201ENSMUST00000186228 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Scgb1b5-ps-201ENSMUST00000189491 280 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Gm37376-201ENSMUST00000192176 453 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Gm36932-201ENSMUST00000195226 929 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Gm4751-201ENSMUST00000200620 1105 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Gm7452-201ENSMUST00000200764 788 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Gm45607-201ENSMUST00000211143 678 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Olfr258-ps1-202ENSMUST00000218625 1085 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 4933433N18Rik-201ENSMUST00000222134 1220 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Il20-201ENSMUST00000027673 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 n-R5s41-201ENSMUST00000083025 119 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Vmn1r12-202ENSMUST00000226866 6639 ntAPPRIS P2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Olfr846-202ENSMUST00000214810 4342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Gm40770-201ENSMUST00000220040 1502 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Lrp2-201ENSMUST00000080953 15460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Tpp1-201ENSMUST00000033184 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Olfr193-203ENSMUST00000208455 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 CT030159.2-201ENSMUST00000221233 1742 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Sytl4-203ENSMUST00000113297 3306 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Rlim-201ENSMUST00000070705 7429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Ptprd-219ENSMUST00000174531 4509 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Olfr97-204ENSMUST00000214622 1573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Olfr97-201ENSMUST00000073667 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Ppfia2-203ENSMUST00000217854 8885 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Amot-202ENSMUST00000112836 6957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Olfr691-202ENSMUST00000213290 2327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Clasp1-212ENSMUST00000189262 6918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Rnu11-201ENSMUST00000104135 134 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Gm14847-201ENSMUST00000121978 519 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Gm11335-201ENSMUST00000148743 1080 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Ttc39aos1-201ENSMUST00000150239 796 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Gm23632-201ENSMUST00000175289 125 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Gm28929-201ENSMUST00000185330 1193 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Gm28340-201ENSMUST00000189218 202 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Gm17895-201ENSMUST00000194028 874 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Gm37285-201ENSMUST00000194465 1139 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Gm43538-201ENSMUST00000200416 849 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Gm43459-201ENSMUST00000202093 331 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Gm44896-201ENSMUST00000206190 772 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Gm19324-201ENSMUST00000213229 1169 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Gtsf1l-201ENSMUST00000094653 822 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Gm40518-202ENSMUST00000214538 4080 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Efcab14-201ENSMUST00000074425 4300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Rs1-201ENSMUST00000033650 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Pkp1P97350 Ripk1-203ENSMUST00000167374 6472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
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