Protein–RNA interactions for Protein: P50405

Sftpb, Pulmonary surfactant-associated protein B, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpbP50405 AC124680.1-201ENSMUST00000223923 1585 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
SftpbP50405 Abca14-201ENSMUST00000084640 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
SftpbP50405 Vmn1r181-203ENSMUST00000226978 4371 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
SftpbP50405 Tmem167b-202ENSMUST00000106622 2752 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
SftpbP50405 Ctps2-202ENSMUST00000101095 1665 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
SftpbP50405 Fam227b-202ENSMUST00000110448 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
SftpbP50405 Mfap3-201ENSMUST00000020830 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
SftpbP50405 Zfp760-201ENSMUST00000073312 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
SftpbP50405 Lrrc49-201ENSMUST00000053171 3086 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
SftpbP50405 Fastkd1-202ENSMUST00000102706 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
SftpbP50405 Olfr1293-ps-201ENSMUST00000102551 888 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
SftpbP50405 Gm4985-201ENSMUST00000118300 1233 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
SftpbP50405 Gm5387-201ENSMUST00000119776 857 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
SftpbP50405 Gm13207-201ENSMUST00000119862 773 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
SftpbP50405 Gm14900-201ENSMUST00000120304 733 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
SftpbP50405 Gm12629-201ENSMUST00000145751 711 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
SftpbP50405 Nrbf2-202ENSMUST00000159002 583 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
SftpbP50405 Gm37294-201ENSMUST00000193461 494 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
SftpbP50405 Gm43089-201ENSMUST00000199162 275 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
SftpbP50405 Olfr726-202ENSMUST00000206834 1256 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
SftpbP50405 Gm35520-201ENSMUST00000209235 784 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
SftpbP50405 Gm7943-201ENSMUST00000212078 1034 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
SftpbP50405 AC131654.1-201ENSMUST00000219675 745 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
SftpbP50405 Gm32235-202ENSMUST00000220286 898 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
SftpbP50405 CT030175.1-201ENSMUST00000220822 408 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
SftpbP50405 AC154558.1-201ENSMUST00000222278 415 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
SftpbP50405 Gm4808-201ENSMUST00000222283 1203 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
SftpbP50405 CT030254.1-201ENSMUST00000225450 1078 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
SftpbP50405 Olfr350-201ENSMUST00000055130 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
SftpbP50405 Gm5436-201ENSMUST00000058103 643 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
SftpbP50405 Gm37940-201ENSMUST00000194243 3251 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
SftpbP50405 AC116950.1-201ENSMUST00000226322 3250 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
SftpbP50405 CT030185.2-201ENSMUST00000222614 1310 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
SftpbP50405 Gm11342-203ENSMUST00000224879 1324 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
SftpbP50405 Kat7-201ENSMUST00000072621 3324 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
SftpbP50405 Stra6l-202ENSMUST00000107782 4009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
SftpbP50405 Tatdn1-201ENSMUST00000110155 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
SftpbP50405 Cntn5-202ENSMUST00000160216 4192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
SftpbP50405 Gm28407-201ENSMUST00000185630 1497 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
SftpbP50405 Gm28108-201ENSMUST00000186747 1497 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
SftpbP50405 Gm28218-202ENSMUST00000186782 1498 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
SftpbP50405 Gm29511-201ENSMUST00000187580 1497 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
SftpbP50405 Gm28367-201ENSMUST00000187942 1496 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
SftpbP50405 Gm29549-202ENSMUST00000189569 1497 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
SftpbP50405 Olfr720-202ENSMUST00000206298 4437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.35
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SftpbP50405 Sytl5-201ENSMUST00000067529 2301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
SftpbP50405 Kcnc2-202ENSMUST00000218445 4033 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
SftpbP50405 Zfp462-203ENSMUST00000098070 10465 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
SftpbP50405 Speer4e-201ENSMUST00000159973 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
SftpbP50405 Noct-202ENSMUST00000144826 9797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
SftpbP50405 Serpinb1b-201ENSMUST00000016951 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
SftpbP50405 Parp6-202ENSMUST00000050483 2631 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SftpbP50405 Gm6337-201ENSMUST00000168088 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SftpbP50405 Nqo2-202ENSMUST00000058978 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SftpbP50405 Gm36660-201ENSMUST00000218323 3871 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SftpbP50405 AA792892-202ENSMUST00000202253 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SftpbP50405 Olfr1333-202ENSMUST00000214477 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SftpbP50405 Lipk-201ENSMUST00000054260 2125 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SftpbP50405 Zfp790-202ENSMUST00000178162 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SftpbP50405 Vmn1r11-202ENSMUST00000226968 2522 ntAPPRIS P2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SftpbP50405 Stk36-203ENSMUST00000113694 629 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
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SftpbP50405 Gm11840-201ENSMUST00000156947 696 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
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SftpbP50405 4930556G22Rik-201ENSMUST00000185689 741 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SftpbP50405 Lamtor3-203ENSMUST00000197064 733 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
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SftpbP50405 Olfr1500-206ENSMUST00000217079 1025 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
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SftpbP50405 AC155709.1-201ENSMUST00000218794 162 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SftpbP50405 Ttk-201ENSMUST00000070326 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SftpbP50405 Gm18908-201ENSMUST00000207125 1483 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SftpbP50405 Asap1-208ENSMUST00000176014 3435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SftpbP50405 Smarca2-242ENSMUST00000208751 1846 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SftpbP50405 C87977-204ENSMUST00000105757 1885 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SftpbP50405 Gm10610-202ENSMUST00000207184 2693 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SftpbP50405 Cnga1-201ENSMUST00000087213 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SftpbP50405 Tceal1-201ENSMUST00000055104 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SftpbP50405 Ceacam2-202ENSMUST00000064862 3087 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SftpbP50405 Plekhg1-201ENSMUST00000042438 7190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SftpbP50405 Yae1d1-201ENSMUST00000099735 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SftpbP50405 Tmem182-201ENSMUST00000114765 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SftpbP50405 Gm13423-201ENSMUST00000117205 888 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SftpbP50405 Gm14295-201ENSMUST00000118012 1213 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SftpbP50405 Gm13983-201ENSMUST00000118018 865 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SftpbP50405 Gm15149-201ENSMUST00000119370 360 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SftpbP50405 Selenok-ps1-201ENSMUST00000125204 785 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SftpbP50405 Gm25057-201ENSMUST00000157366 88 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SftpbP50405 Gm16573-201ENSMUST00000160334 801 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SftpbP50405 Gm6811-201ENSMUST00000169389 1533 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SftpbP50405 Gm20432-201ENSMUST00000173716 250 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SftpbP50405 n-R5s109-201ENSMUST00000179195 119 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
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