Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Gm6083-201ENSMUST00000075518 357 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
VdrP48281 Vmn1r33-201ENSMUST00000079678 1036 ntAPPRIS P1 BASIC7.74□□□□□ -1.17
VdrP48281 Olfr552-201ENSMUST00000098223 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.74□□□□□ -1.17
VdrP48281 Olfr1135-201ENSMUST00000099853 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.74□□□□□ -1.17
VdrP48281 Gm26561-201ENSMUST00000180743 1413 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
VdrP48281 Olfr947-ps1-203ENSMUST00000215471 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
VdrP48281 Zbed4-ps3-201ENSMUST00000187149 3244 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
VdrP48281 Cops2-203ENSMUST00000110463 3392 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
VdrP48281 Vmn1r213-203ENSMUST00000228031 3367 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
VdrP48281 Psmf1-201ENSMUST00000042452 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
VdrP48281 AC158799.1-204ENSMUST00000217441 1321 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
VdrP48281 AC121094.1-201ENSMUST00000224766 1345 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
VdrP48281 1810013D15Rik-203ENSMUST00000196971 1450 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
VdrP48281 6720489N17Rik-203ENSMUST00000223338 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
VdrP48281 Fasl-201ENSMUST00000000834 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
VdrP48281 Dppa2-201ENSMUST00000097175 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
VdrP48281 Rapgef5-205ENSMUST00000222105 2677 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
VdrP48281 Rasgrf1-202ENSMUST00000034912 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
VdrP48281 Ranbp3l-201ENSMUST00000053308 3017 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
VdrP48281 March1-201ENSMUST00000039540 2733 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
VdrP48281 Gm37772-201ENSMUST00000191635 1394 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
VdrP48281 Olfr417-202ENSMUST00000217962 5662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
VdrP48281 Pde1c-202ENSMUST00000114327 6821 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
VdrP48281 Gm26555-202ENSMUST00000180882 3726 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
VdrP48281 Cops2-202ENSMUST00000110462 1853 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
VdrP48281 Eaf2-202ENSMUST00000075946 1878 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
VdrP48281 Gm30122-202ENSMUST00000218662 1556 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
VdrP48281 Lrp2-201ENSMUST00000080953 15460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
VdrP48281 Gm8005-201ENSMUST00000167326 1401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
VdrP48281 Btbd3-201ENSMUST00000075410 4940 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
VdrP48281 Rps27a-201ENSMUST00000102844 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
VdrP48281 Gm12445-201ENSMUST00000117947 885 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
VdrP48281 Gm15220-201ENSMUST00000120730 379 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
VdrP48281 Gm11765-201ENSMUST00000121173 1205 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
VdrP48281 Gm6977-201ENSMUST00000121568 512 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
VdrP48281 Snhg12-203ENSMUST00000128131 614 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
VdrP48281 Olfr636-ps1-201ENSMUST00000134827 935 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
VdrP48281 Gm15941-204ENSMUST00000135401 726 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
VdrP48281 Gm13872-203ENSMUST00000147082 657 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
VdrP48281 Gm23385-201ENSMUST00000158592 295 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
VdrP48281 Gm16554-201ENSMUST00000159471 460 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
VdrP48281 Gm21962-201ENSMUST00000166899 1017 ntAPPRIS P1 BASIC7.73□□□□□ -1.17
VdrP48281 Vmn1r23-201ENSMUST00000175817 997 ntAPPRIS P1 BASIC7.73□□□□□ -1.17
VdrP48281 Gm5698-201ENSMUST00000178317 724 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
VdrP48281 Rnf170-ps-201ENSMUST00000181188 859 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
VdrP48281 Gm8993-201ENSMUST00000182182 983 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
VdrP48281 4933400F21Rik-201ENSMUST00000186098 1007 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
VdrP48281 Gm28237-201ENSMUST00000186563 641 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
VdrP48281 Eif4a2-224ENSMUST00000187168 1238 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
VdrP48281 Gm6197-201ENSMUST00000192273 454 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
VdrP48281 Gm7496-201ENSMUST00000192573 1034 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
VdrP48281 Gm37825-201ENSMUST00000193141 904 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
VdrP48281 Gm37148-201ENSMUST00000195097 716 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
VdrP48281 Gm18131-201ENSMUST00000199241 449 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
VdrP48281 Igkv8-22-201ENSMUST00000199501 367 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
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VdrP48281 Gm18012-201ENSMUST00000204558 773 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
VdrP48281 Gm6329-201ENSMUST00000209210 936 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
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VdrP48281 AC124585.1-201ENSMUST00000213334 953 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
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VdrP48281 4930555G21Rik-201ENSMUST00000221718 537 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
VdrP48281 Gm3333-202ENSMUST00000221763 1044 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
VdrP48281 AC105407.3-201ENSMUST00000224161 648 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
VdrP48281 Spcs1-206ENSMUST00000228736 702 ntAPPRIS P1 BASIC7.73□□□□□ -1.17
VdrP48281 1700001C02Rik-201ENSMUST00000031078 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
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VdrP48281 Mill2-202ENSMUST00000072415 1075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
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VdrP48281 Csrnp3-201ENSMUST00000053910 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
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VdrP48281 4931403G20Rik-201ENSMUST00000180861 1699 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
VdrP48281 Smad5-202ENSMUST00000109874 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
VdrP48281 Adgrv1-202ENSMUST00000109565 7094 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
VdrP48281 Olfr1555-ps1-201ENSMUST00000207679 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
VdrP48281 Dennd2c-204ENSMUST00000173206 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
VdrP48281 4930480K23Rik-201ENSMUST00000180465 3326 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
VdrP48281 Gm43369-201ENSMUST00000196373 1552 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
VdrP48281 Haus2-203ENSMUST00000124187 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
VdrP48281 Gimd1-203ENSMUST00000212594 1432 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
VdrP48281 Slc6a18-202ENSMUST00000109679 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
VdrP48281 4930428E07Rik-202ENSMUST00000222922 3799 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
VdrP48281 Enpep-201ENSMUST00000029658 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
VdrP48281 Gm7489-201ENSMUST00000100666 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
VdrP48281 Lipo4-201ENSMUST00000112511 1188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
VdrP48281 Gm15186-201ENSMUST00000119345 563 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
VdrP48281 Gm12955-201ENSMUST00000119689 957 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
VdrP48281 Gm15193-201ENSMUST00000120224 865 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
VdrP48281 Gm14528-201ENSMUST00000120615 231 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
VdrP48281 Gm11258-201ENSMUST00000121086 1218 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
VdrP48281 Gm12692-201ENSMUST00000121092 546 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
VdrP48281 4930439A04Rik-201ENSMUST00000137241 739 ntTSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
VdrP48281 4930445N08Rik-201ENSMUST00000156925 313 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
VdrP48281 Gm23663-201ENSMUST00000158045 80 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
VdrP48281 Gm6401-202ENSMUST00000164232 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
VdrP48281 Gm17079-201ENSMUST00000167231 666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
VdrP48281 Gm24824-201ENSMUST00000175097 78 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
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