Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Sirpb1c-202ENSMUST00000108349 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 4933421A08Rik-201ENSMUST00000135313 1638 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Ccdc158-201ENSMUST00000060930 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 4933411E08Rik-201ENSMUST00000217950 1689 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Adam4-201ENSMUST00000085319 2504 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Gm25724-201ENSMUST00000104531 117 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Gm2178-201ENSMUST00000104927 357 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Gm14864-201ENSMUST00000116164 1087 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Rps12-ps7-201ENSMUST00000117169 385 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Gm12677-201ENSMUST00000118668 426 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Gm5319-201ENSMUST00000118965 873 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Gm4911-201ENSMUST00000119388 945 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Gm11198-201ENSMUST00000119771 974 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Gm14202-201ENSMUST00000120121 311 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Gm13837-201ENSMUST00000126326 337 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Gm7613-201ENSMUST00000139070 487 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Gm13175-201ENSMUST00000139479 466 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Gm10364-202ENSMUST00000153034 1001 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Gm24286-201ENSMUST00000157632 128 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Gm16298-201ENSMUST00000161107 420 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Vmn1r155-201ENSMUST00000177632 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Gm9285-201ENSMUST00000177691 697 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Vmn1r137-201ENSMUST00000177884 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Vmn1r130-201ENSMUST00000177936 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Gm2888-202ENSMUST00000178577 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Gm4956-202ENSMUST00000178869 672 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Vmn1r107-201ENSMUST00000179079 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Vmn1r165-201ENSMUST00000179594 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 1700003P14Rik-201ENSMUST00000185602 1078 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Scgb1b5-ps-201ENSMUST00000189491 280 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Gm18985-201ENSMUST00000196472 1079 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Gm43057-201ENSMUST00000196789 429 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Gm18430-201ENSMUST00000197534 682 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Gm32585-201ENSMUST00000198586 764 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Tsg101-ps-201ENSMUST00000201023 1170 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Gm44823-201ENSMUST00000204775 1107 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 D530018E20Rik-201ENSMUST00000205107 958 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Gm45279-201ENSMUST00000210315 391 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Olfr258-ps1-202ENSMUST00000218625 1085 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 AC122486.1-201ENSMUST00000221562 196 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Gm36607-201ENSMUST00000222750 1087 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 AC154323.2-201ENSMUST00000226557 1151 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 AC151902.1-201ENSMUST00000227800 375 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Olfr836-201ENSMUST00000074986 955 ntAPPRIS P2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Olfr1503-ps1-201ENSMUST00000076614 803 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Prl3d1-201ENSMUST00000082079 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Gm16020-201ENSMUST00000084281 210 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Gm25099-201ENSMUST00000093716 116 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Olfr295-202ENSMUST00000215365 6013 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Olfr1264-202ENSMUST00000216616 4311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Pard3-203ENSMUST00000108752 3497 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Trim16-203ENSMUST00000108703 3574 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 AC158115.1-201ENSMUST00000222830 3182 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Eci2-203ENSMUST00000110251 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Ank3-239ENSMUST00000183148 7404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Gm43335-201ENSMUST00000198299 3276 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Gm6710-201ENSMUST00000109011 1445 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Gm42864-201ENSMUST00000198371 1436 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Gm38412-201ENSMUST00000199205 3895 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Sp1-201ENSMUST00000001326 7754 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Gm28600-202ENSMUST00000189502 1495 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Enpp6-201ENSMUST00000039840 4970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Ccdc127-201ENSMUST00000022063 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Olfr972-203ENSMUST00000216167 1522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Gm42671-201ENSMUST00000198013 1604 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Olfr957-202ENSMUST00000216177 1726 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Olfr798-202ENSMUST00000204979 3590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Tsix-201ENSMUST00000152916 4306 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Tshr-202ENSMUST00000021346 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Oscp1-201ENSMUST00000035497 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Ccdc47-202ENSMUST00000106865 704 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Gm13141-201ENSMUST00000117417 456 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Gm12713-201ENSMUST00000118404 764 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Gm5601-201ENSMUST00000118909 972 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Olfr397-201ENSMUST00000121280 1091 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Gm5166-201ENSMUST00000121332 573 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Gm14369-201ENSMUST00000121355 285 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Gm12920-201ENSMUST00000121818 1186 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Sox5it-201ENSMUST00000144026 1207 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Gm12600-201ENSMUST00000146704 708 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Gm12504-202ENSMUST00000148026 306 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Gm12514-202ENSMUST00000150455 699 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Spink10-205ENSMUST00000162365 1076 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Gm9672-201ENSMUST00000166437 425 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Gm3585-201ENSMUST00000173438 875 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Mir3471-2-201ENSMUST00000174896 102 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Gm27972-201ENSMUST00000184720 137 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Gm28958-201ENSMUST00000185864 703 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Gm28707-201ENSMUST00000186134 558 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 4930403P22Rik-201ENSMUST00000192234 713 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 4930566N20Rik-201ENSMUST00000195173 1199 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Obox4-ps7-201ENSMUST00000196144 505 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Gm44342-201ENSMUST00000196874 129 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Eif4e-202ENSMUST00000196990 856 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Gm5711-201ENSMUST00000197896 421 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Gm44383-201ENSMUST00000198940 129 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Tshb-206ENSMUST00000200041 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Gm43377-201ENSMUST00000201640 455 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Gm17834-201ENSMUST00000204322 891 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Hoxc11P31313 Gm8168-201ENSMUST00000209631 948 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
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