Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 9030607J07Rik-201ENSMUST00000202228 1622 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 Pcm1-204ENSMUST00000211247 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 Epb41l5-203ENSMUST00000163147 3370 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 Gm27166-201ENSMUST00000184476 1930 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 A330076C08Rik-202ENSMUST00000223513 1937 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 Trmt5-201ENSMUST00000116420 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 Ighv5-16-201ENSMUST00000103458 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 Ighv11-2-201ENSMUST00000103468 461 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 Gm12310-201ENSMUST00000118013 492 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 Gm12604-201ENSMUST00000118382 380 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 Gm11517-201ENSMUST00000119491 387 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 Gm12773-201ENSMUST00000120134 587 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 Gm14898-201ENSMUST00000120202 645 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 Gm14054-201ENSMUST00000120744 704 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 Dmrtc1a-203ENSMUST00000120808 1061 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 Gm6977-201ENSMUST00000121568 512 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 Gm15488-201ENSMUST00000121682 670 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 Ufm1-202ENSMUST00000122330 637 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 Gm15991-201ENSMUST00000127631 942 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 Gm15092-201ENSMUST00000138467 574 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 Tmem27-201ENSMUST00000015545 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 Lrrc9-203ENSMUST00000161284 3817 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 Gm8624-202ENSMUST00000165677 669 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 Gm43518-201ENSMUST00000166129 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 Tph1-205ENSMUST00000168335 578 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 Ankrd55-204ENSMUST00000168684 1005 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 Vmn1r-ps24-201ENSMUST00000175772 900 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 Pid1-203ENSMUST00000175996 892 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 4931403E22Rik-201ENSMUST00000177048 668 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 Gm21698-201ENSMUST00000178487 666 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 Gm7976-201ENSMUST00000181507 1242 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 Mark1-ps3-201ENSMUST00000184922 694 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 1700028B04Rik-201ENSMUST00000186274 555 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 Ly6a-204ENSMUST00000187994 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 Gm5103-201ENSMUST00000192081 1086 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 Gm36965-201ENSMUST00000193797 394 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 Gm6057-201ENSMUST00000195927 314 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 Obox4-ps5-201ENSMUST00000196368 397 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 Igkv8-34-201ENSMUST00000196959 365 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 Gm18131-201ENSMUST00000199241 449 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 Obox4-ps10-201ENSMUST00000199376 504 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 9230114K14Rik-204ENSMUST00000199805 695 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 Gm43493-201ENSMUST00000199837 202 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 Gm40292-201ENSMUST00000202383 553 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 Gm43979-201ENSMUST00000203179 475 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 Gm44018-201ENSMUST00000204471 407 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 Gm43934-201ENSMUST00000205095 388 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 Gm17997-201ENSMUST00000211801 840 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 Gm45789-201ENSMUST00000213038 364 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 AL772265.1-201ENSMUST00000214379 305 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
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PdgfaP20033 Gm18510-201ENSMUST00000219335 1096 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 Gm18243-201ENSMUST00000220756 887 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 Mplkip-202ENSMUST00000221480 582 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 AC124712.1-201ENSMUST00000221833 445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 CT954323.2-201ENSMUST00000222056 213 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 Cinp-209ENSMUST00000222457 723 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 AC110380.1-201ENSMUST00000226987 389 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 CT030662.1-201ENSMUST00000227380 232 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 Ceacam14-201ENSMUST00000023953 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 Guca2a-201ENSMUST00000024015 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
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PdgfaP20033 Snora9-201ENSMUST00000082579 133 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 Gm24046-201ENSMUST00000083111 165 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
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PdgfaP20033 Dmrtc1c2-202ENSMUST00000087899 717 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
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PdgfaP20033 Zfp263-207ENSMUST00000162207 2452 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
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PdgfaP20033 E330034G19Rik-203ENSMUST00000161740 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 9530027J09Rik-201ENSMUST00000180584 1684 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 Pus10-201ENSMUST00000020520 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 Med12l-202ENSMUST00000040325 10159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 2700046A07Rik-202ENSMUST00000067450 2101 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 Ddx24-201ENSMUST00000044923 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 Mpp7-201ENSMUST00000115869 4975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 Olfr305-204ENSMUST00000216700 3734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 Slc4a4-202ENSMUST00000113218 3269 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 Olfr1166-201ENSMUST00000099833 1628 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 Gm45183-201ENSMUST00000207937 1497 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 Ccdc170-202ENSMUST00000138112 3350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 Zmat4-206ENSMUST00000207301 4207 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 Gm45358-201ENSMUST00000209492 2305 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 Cux1-201ENSMUST00000004097 12862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 Sspo-206ENSMUST00000212740 15408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 Zfp941-202ENSMUST00000106052 3851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 Itk-201ENSMUST00000020664 4272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 Gja5-201ENSMUST00000072600 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PdgfaP20033 Gm23131-201ENSMUST00000104253 132 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
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