Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Gm9788-201ENSMUST00000057038 906 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Gm24621-201ENSMUST00000082679 140 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 n-R5s156-201ENSMUST00000083377 105 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Mir455-201ENSMUST00000093594 82 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Gm10825-201ENSMUST00000180537 4478 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Gm26581-201ENSMUST00000181953 4479 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Trrap-201ENSMUST00000038980 12344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Gm1527-201ENSMUST00000099170 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Smarca2-242ENSMUST00000208751 1846 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Gm37186-201ENSMUST00000195629 2861 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Gm38124-201ENSMUST00000191710 2581 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Mfap3-201ENSMUST00000020830 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 AU020206-202ENSMUST00000206358 3009 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Klhl13-203ENSMUST00000115316 3064 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Gcnt2-203ENSMUST00000110191 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Gm45358-201ENSMUST00000209492 2305 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Mbd3l2-202ENSMUST00000213777 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Gm3139-203ENSMUST00000202642 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Gabrg1-201ENSMUST00000031119 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Phxr4-202ENSMUST00000216590 1391 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Gm25546-201ENSMUST00000103977 132 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Gm13423-201ENSMUST00000117205 888 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Gm14513-201ENSMUST00000117403 123 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Gm16418-201ENSMUST00000118577 171 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Gm11681-201ENSMUST00000127337 870 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Cfap100-205ENSMUST00000135757 289 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Gm25277-201ENSMUST00000157266 324 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Lrmda-206ENSMUST00000162540 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Gm20549-201ENSMUST00000174804 429 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Gm4308-201ENSMUST00000179735 914 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Gm5300-201ENSMUST00000182201 1003 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Gm4301-201ENSMUST00000186197 914 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Ms4a12-201ENSMUST00000186228 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Nabp1-206ENSMUST00000188051 680 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Gm28501-201ENSMUST00000188729 421 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Gm4312-201ENSMUST00000190264 914 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Txndc9-203ENSMUST00000192960 472 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Gm38291-201ENSMUST00000193671 259 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Gm20926-201ENSMUST00000194457 696 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Gm43098-201ENSMUST00000199989 1297 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Gm43377-201ENSMUST00000201640 455 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Gm44770-201ENSMUST00000205395 1264 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 AC131660.1-201ENSMUST00000215630 1062 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 AC163661.1-201ENSMUST00000216546 910 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Gm18628-201ENSMUST00000220584 475 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 AC211878.1-201ENSMUST00000221668 474 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Cfap126-201ENSMUST00000027959 1034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Prl3d3-201ENSMUST00000073601 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Cd40-203ENSMUST00000081310 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Cldn34b3-201ENSMUST00000096389 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Mum1l1-202ENSMUST00000113042 4182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Gm40518-202ENSMUST00000214538 4080 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Gm43189-201ENSMUST00000196040 3069 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Il21-201ENSMUST00000029273 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 CT030181.1-201ENSMUST00000089534 3549 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Fastkd1-202ENSMUST00000102706 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Smc5-201ENSMUST00000087556 5683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Rnase4-201ENSMUST00000022428 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
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H2-Eb1P04230 Pcbp2-203ENSMUST00000108838 2775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
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H2-Eb1P04230 4933440M02Rik-201ENSMUST00000061823 3801 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Nexn-201ENSMUST00000046045 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
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H2-Eb1P04230 AC158938.1-201ENSMUST00000225372 6720 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Map2-203ENSMUST00000114012 5119 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Ankfy1-206ENSMUST00000155998 8030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Serpinb1b-201ENSMUST00000016951 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
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H2-Eb1P04230 Vmn2r-ps54-202ENSMUST00000150147 2952 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Gm37876-201ENSMUST00000194490 1591 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Dock7-214ENSMUST00000205650 6297 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 4931406B18Rik-203ENSMUST00000163619 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
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H2-Eb1P04230 Gm28407-201ENSMUST00000185630 1497 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Gm28108-201ENSMUST00000186747 1497 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Gm28218-202ENSMUST00000186782 1498 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Gm29511-201ENSMUST00000187580 1497 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Gm28367-201ENSMUST00000187942 1496 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Gm29549-202ENSMUST00000189569 1497 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Gm34121-201ENSMUST00000206188 1490 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Rab11fip2-203ENSMUST00000171986 5363 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Zfp74-202ENSMUST00000108205 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Olfr720-204ENSMUST00000217642 4832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Gm17491-201ENSMUST00000180411 2311 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Gm10447-201ENSMUST00000084653 2307 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Ptprc-204ENSMUST00000182755 4611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Kcnc2-202ENSMUST00000218445 4033 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Gm43961-201ENSMUST00000203289 1872 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Gm14584-201ENSMUST00000118956 637 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Gm11653-201ENSMUST00000119992 1009 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 1700025O08Rik-201ENSMUST00000123729 456 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Gm12718-202ENSMUST00000156144 660 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Gm17149-201ENSMUST00000164712 375 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Igkv4-53-201ENSMUST00000166380 292 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Gm5456-201ENSMUST00000170706 844 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Gm20432-201ENSMUST00000173716 250 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Gm17045-201ENSMUST00000178600 844 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
H2-Eb1P04230 Gm28620-201ENSMUST00000190463 439 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms