Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp35M0QWN7 Gm22226-201ENSMUST00000157355 109 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Gm23082-201ENSMUST00000157852 133 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 n-R5s93-201ENSMUST00000180091 119 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Gm8357-201ENSMUST00000181115 1011 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Mir3473g-201ENSMUST00000183494 136 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Gm28117-201ENSMUST00000188472 371 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Gm28060-201ENSMUST00000191554 189 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Gm37950-201ENSMUST00000191616 364 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 4930403P22Rik-201ENSMUST00000192234 713 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Gm4856-201ENSMUST00000192696 1091 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Gm18529-201ENSMUST00000193025 1257 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Gm37689-201ENSMUST00000193139 275 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Gm37079-201ENSMUST00000194114 2135 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Vmn1r-ps7-201ENSMUST00000202355 928 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Gm45497-201ENSMUST00000211701 740 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Tecr-214ENSMUST00000212990 648 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Olfr258-ps1-202ENSMUST00000218625 1085 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Gm19238-201ENSMUST00000221936 1260 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 1700040E09Rik-201ENSMUST00000222440 606 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Gm8075-202ENSMUST00000223088 682 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 AL671874.1-201ENSMUST00000223746 1123 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 AC122035.2-201ENSMUST00000228698 462 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Eci2-203ENSMUST00000110251 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Dthd1-201ENSMUST00000170704 2427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Cdk14-204ENSMUST00000115452 1567 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Heph-201ENSMUST00000033553 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Gm10558-201ENSMUST00000147494 1661 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Dcp2-201ENSMUST00000025350 8616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Rfc1-206ENSMUST00000204965 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 4833423E24Rik-201ENSMUST00000099923 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Nxpe2-201ENSMUST00000034527 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Sec24c-202ENSMUST00000223751 4196 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 AC174459.1-201ENSMUST00000224476 1943 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Cntnap2-202ENSMUST00000114641 9827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Slc17a1-201ENSMUST00000006785 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Otc-201ENSMUST00000049910 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Usp35M0QWN7 Teddm1b-201ENSMUST00000055314 2527 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 Bcas3os1-202ENSMUST00000151652 3138 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 Olfr348-202ENSMUST00000213498 3540 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 Vmn2r88-201ENSMUST00000022438 2574 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 Gm44624-201ENSMUST00000208700 2278 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 Gm14762-201ENSMUST00000105109 1771 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 Ctps2-202ENSMUST00000101095 1665 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 Anxa1-201ENSMUST00000025561 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 Klra1-201ENSMUST00000032288 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 Igkv4-81-201ENSMUST00000103340 290 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 Gm22438-201ENSMUST00000104049 132 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 Klhl10-202ENSMUST00000107395 932 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 Tpmt-202ENSMUST00000110118 881 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 Gm12939-201ENSMUST00000117303 165 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 Gm6142-201ENSMUST00000120290 325 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 Eif4e1b-203ENSMUST00000126785 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 1700086P04Rik-201ENSMUST00000149472 1009 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 Gm22262-201ENSMUST00000158713 86 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 Gm20491-201ENSMUST00000173765 1241 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 Gm27014-201ENSMUST00000182658 937 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 Gm28289-201ENSMUST00000189331 315 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 Sult1c2-ps1-201ENSMUST00000200231 164 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 Gm44162-201ENSMUST00000203543 544 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 Gm44251-201ENSMUST00000204963 442 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 Gm18907-201ENSMUST00000209719 932 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 Gm45272-202ENSMUST00000209875 502 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 Gm45486-201ENSMUST00000211767 1109 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 AC102582.2-201ENSMUST00000214658 1137 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 Asf1a-204ENSMUST00000219271 725 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 Gm46424-201ENSMUST00000221567 168 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 Gm18955-201ENSMUST00000223173 649 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 AC124489.1-201ENSMUST00000225852 526 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 Vmn1r73-201ENSMUST00000055070 912 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 Gm13769-201ENSMUST00000077123 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 Olfr539-201ENSMUST00000078967 960 ntAPPRIS P2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 Tmem267-201ENSMUST00000099147 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 Cenpf-204ENSMUST00000171929 11130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 Abi1-202ENSMUST00000091394 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 Idh3a-201ENSMUST00000167866 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 Pigc-202ENSMUST00000111594 3290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 Gpalpp1-201ENSMUST00000022585 5389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 Gbp3-202ENSMUST00000106221 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 Mmp13-201ENSMUST00000015394 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 Zfp825-203ENSMUST00000221173 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 Mapre2-202ENSMUST00000115830 2496 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 Tex28-202ENSMUST00000114328 1421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 Clec7a-204ENSMUST00000195589 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 Accs-203ENSMUST00000111246 3950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 Dsg1b-201ENSMUST00000076737 3965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 Sh3d19-201ENSMUST00000107664 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 Zfp976-201ENSMUST00000098503 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 Olfr99-202ENSMUST00000216328 1778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 Vmn1r90-204ENSMUST00000226802 7185 ntAPPRIS P2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 Gm36947-201ENSMUST00000194709 2249 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 Gm29450-201ENSMUST00000189657 1497 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 Gm29278-202ENSMUST00000189701 1497 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 Gm12653-201ENSMUST00000117778 561 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 0610043K17Rik-202ENSMUST00000142581 372 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 Gm12526-201ENSMUST00000154462 615 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 Gm22223-201ENSMUST00000157360 125 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 AU015336-201ENSMUST00000159040 849 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 Gm25617-201ENSMUST00000179548 133 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 Gm26528-201ENSMUST00000181965 283 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp35M0QWN7 Gm5272-201ENSMUST00000182730 982 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms