Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Gm8281-201ENSMUST00000100893 612 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Skint8-201ENSMUST00000106572 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Gm13642-201ENSMUST00000121697 381 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Gm11263-201ENSMUST00000121853 749 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Gm14048-201ENSMUST00000121864 1268 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Gm22276-201ENSMUST00000122469 129 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Gm23079-201ENSMUST00000157847 117 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Gm24176-201ENSMUST00000158928 121 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Gm8159-201ENSMUST00000163738 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Prom1-206ENSMUST00000171543 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Gm8297-201ENSMUST00000171636 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Gm25082-201ENSMUST00000177296 255 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Gm8237-202ENSMUST00000178594 447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 7630403G23Rik-201ENSMUST00000184229 1084 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Gm10603-203ENSMUST00000184875 508 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Gm5157-201ENSMUST00000185914 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Gm28573-201ENSMUST00000187821 380 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 A430093F15Rik-206ENSMUST00000189565 651 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Gm28145-201ENSMUST00000189742 380 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Gm18849-201ENSMUST00000189861 560 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 2310008N11Rik-201ENSMUST00000189978 568 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Gm28400-201ENSMUST00000191332 380 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Gm42756-201ENSMUST00000196601 2614 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Gm34144-201ENSMUST00000197039 259 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Mef2c-214ENSMUST00000197722 3517 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Gm43098-201ENSMUST00000199989 1297 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Gm44643-201ENSMUST00000208542 674 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Gm45100-201ENSMUST00000209153 391 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Olfr565-ps1-201ENSMUST00000209824 944 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Lnp1-201ENSMUST00000210579 671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 2310008N11Rik-203ENSMUST00000210732 601 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Gcnt2-204ENSMUST00000223570 335 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 AC165260.1-201ENSMUST00000224127 683 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 AC116476.1-201ENSMUST00000226274 2318 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Il1f6-201ENSMUST00000028361 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Cst11-201ENSMUST00000028934 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Rpl23a-ps1-201ENSMUST00000085632 465 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Zfa-ps-202ENSMUST00000180673 3420 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 AC121960.2-201ENSMUST00000227349 3446 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Tdrkh-207ENSMUST00000197901 2652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Macf1-202ENSMUST00000084301 23398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Gm13977-201ENSMUST00000133648 4049 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Ect2l-201ENSMUST00000095817 2900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Acad11-202ENSMUST00000120854 3108 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Gm37100-201ENSMUST00000193344 1353 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Olfr1340-203ENSMUST00000216242 3341 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Copg2-201ENSMUST00000048774 3961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Cntn3-202ENSMUST00000203619 5294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Psg20-202ENSMUST00000108482 1871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Gm38412-201ENSMUST00000199205 3895 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Gm17093-201ENSMUST00000170427 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Gm37142-201ENSMUST00000193718 3110 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Gm18796-201ENSMUST00000190440 1767 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Gm24173-201ENSMUST00000104130 128 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Gm26016-201ENSMUST00000104403 129 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Gm24519-201ENSMUST00000104507 132 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Tfpi-207ENSMUST00000111722 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Gm12635-201ENSMUST00000117285 752 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Gm13900-201ENSMUST00000119402 498 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Gm11259-201ENSMUST00000120554 715 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Gm13221-201ENSMUST00000121712 430 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Fthl17-ps3-201ENSMUST00000126259 513 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Rsf1os1-201ENSMUST00000126902 324 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Gm16095-201ENSMUST00000128235 253 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Gm15407-201ENSMUST00000136919 634 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Gm14097-201ENSMUST00000147868 470 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Serpina3d-ps-201ENSMUST00000163110 1272 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Mir6367-201ENSMUST00000183385 102 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Mir6922-201ENSMUST00000185099 66 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Gm10640-202ENSMUST00000190947 1134 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Gm38135-201ENSMUST00000195068 502 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Gm8539-201ENSMUST00000199822 501 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Gm42799-201ENSMUST00000201331 328 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Gm43377-201ENSMUST00000201640 455 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Gm18838-201ENSMUST00000204855 886 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Gm6070-201ENSMUST00000207275 419 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Gm2996-201ENSMUST00000211398 537 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Gm8290-201ENSMUST00000218202 477 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Gm18601-201ENSMUST00000220831 634 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 CT009546.3-201ENSMUST00000220914 208 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Gm7252-201ENSMUST00000223284 456 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Olfr965-201ENSMUST00000069342 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Olfr1224-ps1-202ENSMUST00000099793 1212 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Clmn-201ENSMUST00000109936 11866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Hdac9-201ENSMUST00000110819 4413 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Gm11590-201ENSMUST00000118999 1455 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Smarca2-242ENSMUST00000208751 1846 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Galnt13-201ENSMUST00000068595 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 4933406B17Rik-201ENSMUST00000212602 4333 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Gm26645-201ENSMUST00000181076 1316 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Slmap-201ENSMUST00000038522 4501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Gm29198-201ENSMUST00000190102 1512 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Cnot4-201ENSMUST00000044163 3337 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Zfp266-201ENSMUST00000068296 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Cnot2-203ENSMUST00000105267 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Olfr1396-201ENSMUST00000060398 3946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Olfr132-202ENSMUST00000216804 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Gm37685-201ENSMUST00000193507 2177 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Gimd1-203ENSMUST00000212594 1432 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Gm28048F7BCN0 Olfr1054-202ENSMUST00000213205 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.6 ms